CSE est-il la même chose que CBE ?

Oui, historiquement. Le Council of Biology Editors est devenu le Council of Science Editors. Les polycopiés de campus disent encore CBE. Le livre actuel est The CSE Manual, 9e édition (2024). Ne suivez pas une photocopie CBE de 6e édition—ni le Quick Guide résiduel de 8e édition qui énumère encore les 10 premiers auteurs—pour les seuils d'auteurs, les villes ou les dates d'accès.

Quel système CSE un compte rendu de laboratoire de biologie doit-il utiliser ?

Celui que l'enseignant a nommé. Si la fiche dit « CSE numéroté », c'est citation–sequence sauf si elle demande aussi d'alphabétiser la liste d'abord (citation–name). Les cours d'écologie et de biologie organismique veulent souvent name–year. Ne devinez pas à partir d'un article de méthodes qui vous a plu.

Combien d'auteurs CSE 9 énumère-t-il avant et al. ?

Cinq. Une œuvre avec 6 auteurs ou plus énumère le premier auteur plus et al. dans la référence finale. Les citations name-year dans le texte utilisent déjà premier auteur plus et al pour 3 auteurs ou plus. La règle « les 10 premiers » de la 8e édition est retirée ; la ligne Pizzi Anticancer Res. de l'ancien Quick Guide est résiduelle.

Dois-je mettre les noms de revue en italique en CSE ?

Non. Les références finales CSE composent les titres de revue en romain et les abrègent. L'italique appartient aux binômes dans le texte courant (Homo sapiens) et à quelques cas particuliers de titre, pas à J Cell Biol dans la liste de références.

Comment citer une séquence GenBank ou RefSeq en CSE ?

Mettez l'accession.version complète dans l'article (AF123456.2, NM_001349333.1). Pour une référence finale formelle, suivez le modèle de notice de la base Nucleotide de la NLM : base de données, organisation, accession, description du produit, date de consultation et URL. Ne citez pas « GenBank » sans identifiant, et ne citez pas Release 273.0 comme s'il s'agissait de la séquence.

Comment citer BLAST ou ImageJ en CSE ?

Citez l'article de méthodes que nomment NCBI ou le projet. BLAST 1990 a cinq auteurs, donc CSE 9 énumère Altschul, Gish, Miller, Myers et Lipman. Le BLAST web actuel est BLAST+ ; citez Camacho et al., BMC Bioinformatics 2009;10:421. ImageJ est Schneider, Rasband et Eliceiri, Nat Methods 2012. Si vous avez exécuté Fiji, citez Schindelin 2012 à la place. Ne citez pas l'onglet du navigateur.

Comment citer un article eLife ou PLOS qui a un numéro au lieu de pages ?

Mettez le numéro d'article dans l'emplacement location de CSE. Le spécimen officiel du Quick Guide est Liu et al., Adv Meteorol. 2020:8874869 (citation-sequence) ou Adv Meteorol. 8874869 (name-year). N'importez pas le préfixe Article eLocator d'APA.

Dois-je citer bioRxiv ou l'article publié ?

Citez la version que vous avez utilisée. Si l'article est désormais dans une revue, citez la revue et le DOI. Gardez la prépublication seulement lorsque vous discutez de cette prépublication. L'exemple officiel de CSE 9 est Lopez Bernal et al. sur medRxiv, étiqueté [preprint] ; cet article a ensuite paru comme N Engl J Med. 2021;385(7):585–594.

Le CSE name-year est-il la même chose que APA 7 ?

Non. Les deux mettent un nom et une année dans la phrase. APA utilise des virgules, des esperluettes, des titres d'article en casse de phrase avec revue-et-volume en italique, et un seuil de 20 auteurs. CSE name-year utilise (Fauci and Lane 2020), des titres de revue abrégés en romain, l'année juste après les auteurs dans la liste, et un seuil de 5 auteurs. Voir APA vs CSE.

CSE a-t-il encore besoin de la ville pour Norton ou Springer ?

Pas dans la 9e édition. La note d'Olson dans Science Editor et le Quick Guide retirent tous deux le lieu de publication parce que les éditeurs ont plusieurs implantations et que l'œuvre se trouve sans la ville. Une ligne « New York (NY) : » de 8e édition est dépassée pour un travail CSE de 2026.

Comment citer des sources de biologie en style CSE (CSE Manual 9e éd.) [2026]

Réponse rapide : comment citer des sources de biologie en CSE

Ouvrez d'abord le syllabus ou les instructions aux auteurs de la revue. Utilisez CSE lorsque ce document nomme The CSE Manual, Scientific Style and Format, CBE ou Council of Science Editors. Choisissez un système pour tout le travail : citation–sequence, citation–name ou name–year. Les listes numérotées réutilisent le numéro d'origine ; les listes name–year sont alphabétiques. Les références de revue mettent d'abord les auteurs (nom de famille puis initiales, sans points), puis le titre de l'article en casse de phrase, la revue abrégée avec la ISSN List of Title Word Abbreviations, l'année, le volume, le fascicule, les pages ou le numéro d'article, et un lien https://doi.org/ lorsqu'un DOI existe.

Modèles officiels CSE 9 et premières lignes travaillées

Modèle de revue citation-sequence / citation-name :

Author(s). Article title. Journal title. Date;volume(issue):location. URL

Modèle de revue name-year :

Author(s). Date. Article title. Journal title. Volume(issue):location. URL

Modèle de livre citation-sequence :

Author(s). Title. Edition. Publisher; year of publication.

Modèle de livre name-year :

Author(s). Date. Title. Edition. Publisher.

Revue officielle citation-sequence :

Haasnoot M, Lawrence J, Magnan AK. Pathways to coastal retreat. Science. 2021;372(6548):1287–1290. https://doi.org/10.1126/science.abi6594

Revue officielle name-year :

Fauci AS, Lane HC. 2020. Four decades of HIV/AIDS—much accomplished, much to do. N Engl J Med. 383(1):1–4. https://doi.org/10.1056/NEJMp1916753

Name-year officiel dans le texte (deux auteurs) :

(Fauci and Lane 2020)

Citation-sequence dans la phrase :

Les voies d'adaptation côtière sont déjà utilisées.¹

Le Quick Guide énonce la règle des trois systèmes en une phrase que vous pouvez apporter à un professeur qui dit « utilisez juste CSE » :

CSE Citation Quick Guide, 9e édition (consulté le 9 octobre 2026)

The CSE Manual presents 3 systems for referring to references (also known as citations) within the text of a journal article, book, or other scientific publication: (1) citation–sequence, (2) name–year, and (3) citation–name.

A DOI-based URL (which starts with https://doi.org/), when available, should be preferred to any other form of URL.

For articles with more than 5 authors, list the first author followed by “et al.”

Journal titles are generally abbreviated according to the List of Title Word Abbreviations maintained by the ISSN International Centre.

Ce que ce guide couvre—et ce qu'il ne couvre pas

Utilisez cette page lorsque le point difficile est l'objet biologique : un article de Nature face à la notice PubMed qui l'a trouvé, une accession.version GenBank face à l'article qui l'a déposée, une recherche BLAST+ face à l'article d'algorithme d'Altschul 1990, une prépublication bioRxiv face à l'article de revue ultérieur, ou une citation de méthodes dans un compte rendu de laboratoire face au livre de protocoles. Pour le choix par support entre CSE et APA, utilisez APA vs CSE ou quel style de citation. Les styles numérotés voisins ne sont pas CSE : citer en médecine couvre AMA 11 et Vancouver/NLM ; citer en chimie couvre ACS. Pour un parcours d'une seule source, voir comment citer un article de revue en CSE.

L'autorité actuelle est The CSE Manual, 9e édition, pas une photocopie CBE

Les départements disent encore « style CBE » ou « CSE 8e ». Ils veulent dire The CSE Manual, le successeur de 2024 de Scientific Style and Format, 8e édition (2014). Le conseil a renommé le livre parce que les utilisateurs l'appelaient déjà le manuel CSE. Les références vivent au chapitre 29. Le Quick Guide est l'ensemble public d'exemples ; l'annexe 29.1 couvre les abréviations de titres de revue. CSE cite le manuel lui-même ainsi :

Citation officielle de la page d'accueil de The CSE Manual (csemanual.org, consultée le 9 octobre 2026)

Council of Science Editors, Style Manual Task Force. The CSE manual: scientific style and format for authors, editors, and publishers. 9th ed. Council of Science Editors in cooperation with The University of Chicago Press; 2024. https://doi.org/10.7208/cse9

Peter J. Olson, l'un des éditeurs du chapitre 29, a reformulé les seuils de la 9e édition dans Science Editor (mars 2024 ; le PDF de mars 2024 a été ouvert pour cette réécriture après que l'article HTML a renvoyé 403) :

Science Editor, Peter J. Olson sur CSE 9 chapitre 29

As of the ninth edition, the maximum number of authors listed is 5, and references with 6 or more authors should list only the first author followed by “et al.”

Additionally, access dates for online sources are now required only when the date of publication, copyright, or revision cannot be determined, and publisher locations are no longer needed (partly because this information has become less relevant, but also because many book publishers have multiple locations).

Le Quick Guide en ligne de 8e édition est toujours hébergé sur scientificstyleandformat.org. Il enseigne encore le seuil retiré de 10 auteurs. Ne mélangez pas ses exemples avec un travail de 9e édition :

Quick Guide résiduel de 8e édition (toujours en ligne ; ne le copiez pas dans CSE 9)

Seuil d'auteurs de 8e édition (retiré) :

For articles with more than 10 authors, list the first 10 followed by “et al.”

Spécimen à 10 auteurs de 8e édition (Pizzi) :

Pizzi C, Caraglia M, Cianciulli M, Fabbrocini A, Libroia A, Matano E, Contegiacomo A, Del Prete S, Abbruzzese A, Martignetti A, et al. Low-dose recombinant IL-2 induces psychological changes: monitoring by Minnesota Multiphasic Personality Inventory (MMPI). Anticancer Res. 2002;22(2A):727–732.

Les fiches de cours de 8e édition qui énumèrent les 10 premiers auteurs, exigent une ville pour Springer et tamponnent une date d'accès sur chaque DOI enseignent l'ancien livre.

Les trois systèmes CSE ne sont pas des styles maison interchangeables

La ponctuation de la référence finale est presque la même dans les trois systèmes. La différence porte sur le fonctionnement de la marque dans le texte et sur l'ordre de la liste. Le Quick Guide dit que la paire numérotée est identique sauf pour l'ordre de la liste :

CSE Citation Quick Guide, sur les systèmes numérotés

These 2 systems are identical except for the order in which the end references are listed. In both systems, numbers within the text refer to the end references.

In the citation–sequence system, the end references are listed in the sequence in which they first appear within the text. For example, if a reference by Smith is the first one mentioned in the text, then the complete reference to the Smith work will be number 1 in the end references. The same number is used for subsequent in-text references to the same document.

In the citation–name system, the end references are listed alphabetically by the first author’s surname. Multiple works by the same author are listed alphabetically by title.

Choisissez le système que nomme le syllabus ou la revue. Ne les mélangez pas dans un même travail.
Système	Marque dans le texte	Ordre de la liste finale	Usage courant en biologie
Citation–sequence	Numéro à la première mention ; réutilisez ce numéro	Ordre de première apparition	Beaucoup de comptes rendus de laboratoire et certaines revues des sciences de la vie
Citation–name	Numéro attribué après alphabétisation de la liste	Alphabétique par premier auteur, puis titre	Moins courant sur le campus ; reste une option CSE
Name–year	(Nom Année) ; deux auteurs joints par and	Alphabétique, non numéroté ; l'année après les auteurs	Écologie, évolution et de nombreuses revues organismiques

Le Quick Guide ne verrouille pas la marque numérotée sur l'exposant plutôt que les parenthèses. Les revues et les enseignants, si. Un laboratoire de campus qui veut l'exposant ¹ après le point reste du CSE citation–sequence ; un article médical ICMJE qui veut (1) est du Vancouver, pas du CSE, même lorsque la référence finale se ressemble.

Articles de revue : exemples officiels CSE 9

Les modèles de revue du Quick Guide sont dans l'encadré ci-dessus. Les titres de revue sont abrégés. Pour deux auteurs, la référence finale utilise une virgule et la marque name–year dans le texte utilise and. Le et al name–year dans le texte n'a pas de point dans les exemples officiels. Ces lignes sont des exemples officiels CSE 9, pas des articles de biologie cellulaire inventés :

Exemples officiels de revue CSE 9

Citation-sequence, trois auteurs :

Haasnoot M, Lawrence J, Magnan AK. Pathways to coastal retreat. Science. 2021;372(6548):1287–1290. https://doi.org/10.1126/science.abi6594

Citation-sequence, plus de 5 auteurs :

Ashraf M et al. Interaction between the distribution of diabetic retinopathy lesions and the association of optical coherence tomography angiography scans with diabetic retinopathy severity. JAMA Ophthalmol. 2020;138(12):1291–1297. https://doi.org/10.1001/jamaophthalmol.2020.4516

Name-year, deux auteurs :

Fauci AS, Lane HC. 2020. Four decades of HIV/AIDS—much accomplished, much to do. N Engl J Med. 383(1):1–4. https://doi.org/10.1056/NEJMp1916753

Name-year dans le texte, deux auteurs :

(Fauci and Lane 2020)

Name-year dans le texte, trois ou plus :

(Haasnoot et al 2021)

Seuil d'auteurs name-year (Quick Guide) :

For articles with 3 to 5 authors, list all authors in the end reference; for articles with more than 5 authors, list the first author followed by “et al.” In either case, list only the first author followed by “et al” in the in-text reference.

Les revues de biologie qui ont abandonné la pagination par fascicule au profit des numéros d'article utilisent le même emplacement. Le spécimen officiel du Quick Guide est de l'hydrologie, pas un faux article eLife ; eLife, PLOS Biology et PeerJ placent toujours le numéro d'article là où CSE met location. Le même chapitre montre aussi un volume sans fascicule et un supplément :

Numéro d'article, sans fascicule, supplément et paire de la même année officiels CSE 9

Citation-sequence, numéro d'article et sans volume :

Liu L, Bai P, Liu C, Tian W, Liang K. Changes in extreme precipitation in the Mekong Basin. Adv Meteorol. 2020:8874869. https://doi.org/10.1155/2020/8874869

Name-year, numéro d'article :

Liu L, Bai P, Liu C, Tian W, Liang K. 2020. Changes in extreme precipitation in the Mekong Basin. Adv Meteorol. 8874869. https://doi.org/10.1155/2020/8874869

Citation-sequence officiel, volume et sans fascicule :

Kim KY, Kim BS. The effect of regional warming on the East Asian summer monsoon. Clim Dyn. 2020;54:3259–3277. https://doi.org/10.1007/s00382-020-05169-7

Citation-sequence officiel, fascicule plus supplément :

Yohannes AM, Kaplan A, Hanania NA. Anxiety and depression in chronic obstructive pulmonary disease: recognition and management. Cleve Clin J Med. 2018;85(2 Suppl 1):S11–S18. https://doi.org/10.3949/ccjm.85.s1.03

Name-year mêmes auteurs, même année (2020a officiel) :

Lee SMC et al. 2020a. Arterial structure and function during and after long-duration spaceflight. J Appl Physiol. 129(1):108–123. https://doi.org/10.1152/japplphysiol.00550.2019

Name-year mêmes auteurs, même année (2020b officiel) :

Lee SMC et al. 2020b. Efficacy of gradient compression garments in the hours after long-duration spaceflight. Front Physiol. 11:784. https://doi.org/10.3389/fphys.2020.00784

Name-year dans le texte, les deux œuvres :

(Lee et al 2020a, 2020b)

Observez les détails de 9e édition que les étudiants se trompent encore. Les initiales n'ont ni points ni espaces (Fauci AS, pas Fauci, A. S.). Le titre de l'article est en casse de phrase. Il n'y a pas de point supplémentaire après l'URL du DOI. Les œuvres de la même année des mêmes auteurs prennent 2020a et 2020b. Un numéro d'article n'est pas un préfixe eLocator APA ; CSE écrit le numéro après les deux-points (systèmes numérotés) ou après le titre de la revue (name–year).

Un vrai article de génétique formaté de la même façon—c'est Watson et Crick (1953), pas un échantillon du CSE Quick Guide—ressemble à ceci en citation–sequence :

Rendu CSE 9 travaillé d'un vrai article de Nature

Watson JD, Crick FH. Molecular structure of nucleic acids: a structure for deoxyribose nucleic acid. Nature. 1953;171(4356):737–738. https://doi.org/10.1038/171737a0

Trouver ce PDF dans PubMed ou Web of Science ne fait pas de PubMed la source. Citez Nature. Cherchez l'abréviation dans la ISSN LTWA ou le NLM Catalog ; n'inventez pas Nat. ni J Cell Bio. Préférez le DOI. Si vous n'avez qu'un PMID, trouvez le DOI avant de formater la référence.

Livres et chapitres : la ville de publication a disparu

Les références de livres CSE 9 suppriment la ville que les polycopiés de 8e édition exigent encore. Ces lignes sont des exemples officiels CSE 9, y compris deux titres de biologie (Reiss et Ruse ; Klarsfeld et Revah) et la traduction officielle sur la biogenèse mitochondriale :

Exemples officiels de livres et chapitres CSE 9

Name-year, deux auteurs :

Reiss MJ, Ruse M. 2023. The new biology: a battle between mechanism and organicism. Harvard University Press.

Name-year dans le texte :

(Reiss and Ruse 2023)

Citation-sequence, livre traduit :

Klarsfeld A, Revah F. The biology of death: origins of mortality. Brady L, translator. Cornell University Press; 2003.

Citation-sequence, traducteur et éditeur (titre mitochondrial officiel) :

Luzikov VN. Mitochondrial biogenesis and breakdown. Galkin AV, translator; Roodyn DB, editor. Consultants Bureau; 1985.

Chapitre citation-sequence, auteurs différents :

Geisslitz S, Scherf K. The holy grail of ancient cereals. In: Boukid F, editor. Cereal-based foodstuffs: the backbone of Mediterranean cuisine. Springer; 2021. p 269–301.

Chapitre citation-sequence, même auteur :

Everard M. Ecosystem services: key issues. Routledge; 2017. Chapter 8, Regenerative landscapes: reversing the cycle; p 141–169.

Livre en ligne citation-sequence, plus de 5 éditeurs :

Agarwal A et al, editors. Oxford handbook of clinical surgery. 5th ed. Oxford University Press; 2022. https://doi.org/10.1093/med/9780198799481.001.0001

Un manuel actuel de biologie cellulaire avec plus de cinq auteurs commence donc par le premier nom plus et al., et n'a pas besoin de « New York ». Alberts, Heald, Johnson, Morgan, Raff, Roberts et Walter font sept noms, donc CSE 9 tronque :

Rendu CSE 9 d'un vrai manuel (7 auteurs, donc et al.)

Alberts B et al. Molecular biology of the cell. 7th ed. W. W. Norton & Company; 2022.

Citez un chapitre seulement lorsque vous avez utilisé ce chapitre, pas le livre entier. Le modèle officiel du même auteur garde d'abord le titre du livre, puis l'étiquette du chapitre et les pages. Si le chapitre a des auteurs différents des éditeurs du livre, utilisez le modèle In: Editor, editor. du Quick Guide (Geisslitz et Scherf ci-dessus). Ne citez pas le nom de fichier PDF de la librairie du campus.

Résidu : Harrison 22 n'est plus « Forthcoming 2026 »

Le Quick Guide en ligne imprime encore la 22e édition de Harrison comme un livre forthcoming daté 2026. McGraw Hill a annoncé la sortie mondiale le 20 août 2025 ; la ligne de copyright de l'imprimé/eBook est 2025. La liste publiée des éditeurs commence par Longo, pas par Kasper. Gardez la ligne officielle forthcoming comme modèle CSE, puis citez le livre que vous avez réellement ouvert :

Ligne forthcoming résiduelle officielle face à la 22e édition publiée

Livre forthcoming officiel citation-sequence (Quick Guide, toujours en ligne) :

Kasper D et al. Harrison’s principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill Professional. Forthcoming 2026.

Livre forthcoming officiel name-year :

Kasper D et al. Forthcoming 2026. Harrison’s principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill Professional.

Name-year officiel dans le texte :

(Kasper, forthcoming 2026)

Rendu CSE 9 de la 22e édition publiée (Longo en premier ; 8 noms, donc et al.) :

Longo DL et al, editors. Harrison's principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill; 2025.

Séquences et bases de données : citez l'accession.version, pas « GenBank »

Les articles de biologie moléculaire échouent plus souvent là-dessus qu'à la ponctuation de revue. Si vous avez utilisé une notice de nucléotide ou de protéine, l'objet est cette notice. La mise à jour GenBank 2025 dans Nucleic Acids Research (53(D1):D56–D61) reste le dernier annuel dédié à GenBank au 9 octobre 2026 ; GenBank Release 273.0 (15 août 2026) est une livraison de données, pas un article de citation de remplacement. La mise à jour 2025 énonce la règle de récupérabilité :

Sayers et al., mise à jour GenBank 2025, Nucleic Acids Research

the best way to cite a GenBank record in a publication is to use the full accession.version identifier for the record.

Rendu CSE 9 de cet article NAR (7 auteurs, donc et al.) :

Sayers EW et al. GenBank 2025 update. Nucleic Acids Res. 2025;53(D1):D56–D61. https://doi.org/10.1093/nar/gkae1114

Leur identifiant travaillé est AF123456.2, pas AF123456. Chercher l'accession non versionnée ne renvoie que la version actuelle, qui a pu changer depuis votre analyse. La page de citation NCBI de la NLM donne le modèle de notice de base de données (c'est le libellé NLM/Citing Medicine, pas une ligne du Quick Guide CSE 9). Cette même page renvoie désormais aussi à l'article ressources NCBI 2026 pour une citation de base de données générale :

NLM, How do I cite NCBI services and databases?

Nucleotide [Internet]. Bethesda (MD): National Library of Medicine (US), National Center for Biotechnology Information; [1988] – . Accession No. NM_001349333.1, Homo sapiens FYN binding protein (FYB), transcript variant 4, mRNA; [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001349333.1

Rendu CSE 9 de l'article ressources NCBI 2026 (NAR 54(D1):D20–D27) :

Sayers EW et al. Database resources of the National Center for Biotechnology Information in 2026. Nucleic Acids Res. 2025;54(D1):D20–D27. https://doi.org/10.1093/nar/gkaf1060

Remplacez l'accession, la description du produit et la date de consultation par la version que vous avez récupérée. Ne citez pas « NCBI » ni « GenBank » sans accession lorsque l'affirmation dépend d'une séquence. Si l'article que vous rédigez a utilisé GenBank comme base de données plutôt que comme une notice, citez la mise à jour GenBank actuelle de Nucleic Acids Research (toujours l'article 2025 jusqu'à ce qu'une mise à jour GenBank 2026 paraisse) au lieu d'inventer une référence de page d'accueil. Protein Data Bank, UniProt et GBIF fonctionnent de la même façon : nommez l'ID de notice qu'un lecteur ultérieur pourra ouvrir. La page de la NLM vous dit aussi de citer BLAST depuis la liste de références BLAST, pas depuis une capture d'écran de la boîte de recherche.

Logiciels et articles de méthodes : citez l'algorithme que vous avez exécuté

Un paragraphe Methods qui dit « les séquences ont été recherchées avec BLAST » sans référence est incomplet. L'aide BLAST de NCBI énumère les articles à citer. L'article d'algorithme de 1990 a cinq auteurs, donc CSE 9 les énumère tous les cinq. L'article BLAST à trous de 1997 en a sept, donc CSE 9 ne garde que Altschul plus et al. Les étudiants qui exécutent le service web actuel ou le binaire blastn exécutent en général BLAST+, dont l'article d'architecture est Camacho et al.—sept auteurs, donc CSE 9 tronque. La page d'aide de NCBI imprime encore cet article comme 2008 ; l'article BMC est le volume 10, article 421 (15 décembre 2009). ElasticBLAST (2023) a cinq auteurs, donc CSE 9 les énumère tous les cinq. Ces lignes sont des rendus CSE 9 des citations recommandées par NCBI, pas des échantillons du Quick Guide :

Rendu CSE 9 des articles de méthodes NCBI BLAST et ImageJ

BLAST 1990 (5 auteurs, donc énumérez tous) :

Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990;215(3):403–410. https://doi.org/10.1016/S0022-2836(05)80360-2

Gapped BLAST / PSI-BLAST 1997 (plus de 5 auteurs) :

Altschul SF et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res. 1997;25(17):3389–3402. https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389

BLAST+ (année 2008 dans la liste NCBI ; BMC 2009 ; 7 auteurs, donc et al.) :

Camacho C et al. BLAST+: architecture and applications. BMC Bioinformatics. 2009;10:421. https://doi.org/10.1186/1471-2105-10-421

ElasticBLAST (5 auteurs, donc énumérez tous) :

Camacho C, Boratyn GM, Joukov V, Vera Alvarez R, Madden TL. ElasticBLAST: accelerating sequence search via cloud computing. BMC Bioinformatics. 2023;24(1):117. https://doi.org/10.1186/s12859-023-05245-9

ImageJ (Nature Methods ; 3 auteurs) :

Schneider CA, Rasband WS, Eliceiri KW. NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis. Nat Methods. 2012;9(7):671–675. https://doi.org/10.1038/nmeth.2089

Fiji, si c'est la variante que vous avez exécutée (page de citation ImageJ, doi:10.1038/nmeth.2019) :

Schindelin J et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat Methods. 2012;9(7):676–682. https://doi.org/10.1038/nmeth.2019

La page de citation ImageJ est explicite : citez ImageJ (doi:10.1038/nmeth.2089) pour le programme d'origine, Fiji (doi:10.1038/nmeth.2019) si vous avez utilisé Fiji, et ImageJ2 (doi:10.1186/s12859-017-1934-z) si vous avez utilisé ImageJ2. Citez la version que vous avez exécutée. Si la page du projet nomme une citation préférée (ImageJ, R, QIIME 2, FlyBase), utilisez cet article ou cette référence logicielle. N'inventez pas une date de version que vous n'avez jamais notée, et ne citez pas « NCBI BLAST » comme s'il s'agissait d'un article de revue sans auteurs.

Prépublications, thèses et articles ahead-of-print

CSE 9 a ajouté une section prépublication. Marquez le statut entre crochets et gardez le nom du serveur. Lorsque la version évaluée par les pairs paraît, citez l'article de revue et retirez la prépublication sauf si vous discutez de la notice de prépublication elle-même. Le spécimen officiel du Quick Guide est Lopez Bernal et al. sur medRxiv. Cet article n'est plus seulement une prépublication : il a paru comme Lopez Bernal et al., *N Engl J Med* 2021;385(7):585–594. Gardez la ligne officielle de prépublication comme modèle CSE ; citez la version NEJM si c'est celle que vous avez lue.

Prépublication officielle CSE 9, version publiée résiduelle, thèse et ahead of print

Prépublication officielle citation-sequence :

Lopez Bernal J et al. Effectiveness of COVID-19 vaccines against the B.1.617.2 variant [preprint]. medRxiv 2021. https://doi.org/10.1101/2021.05.22.21257658

Prépublication officielle name-year :

Lopez Bernal J et al. 2021. Effectiveness of COVID-19 vaccines against the B.1.617.2 variant [preprint]. medRxiv. https://doi.org/10.1101/2021.05.22.21257658

Rendu CSE 9 de l'article NEJM ultérieur (citez celui-ci si vous avez lu la revue) :

Lopez Bernal J et al. Effectiveness of Covid-19 vaccines against the B.1.617.2 (Delta) variant. N Engl J Med. 2021;385(7):585–594. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2108891

Thèse officielle citation-sequence :

Liang S. Transport properties of topological semimetals and non-symmorphic topological insulator [dissertation]. Princeton University; 2020. https://arks.princeton.edu/ark:/88435/dsp01vm40xv52n

Ahead of print officiel citation-sequence :

Corrigan TJ Jr, Businger S. The anatomy of a series of cloud bursts that eclipsed the US rainfall record. Mon Wea Rev. [published online ahead of print 2021 Dec 30]. https://doi.org/10.1175/MWR-D-21-0028.1

Sites web : URL CDC résiduelle, et date unknown seulement en name–year

Les sites web ont toujours besoin d'une date de publication ou de mise à jour lorsqu'elle existe. Les deux systèmes CSE ne formulent pas la règle de date manquante de la même façon. Citation–sequence ne demande qu'une date d'accès ; name–year ajoute la mention « date unknown ». Le spécimen officiel de site web daté reste la page d'équité en santé du CDC. Ouverte le 9 octobre 2026, cette URL exacte a renvoyé 404. Les archives du CDC et archive.cdc.gov conservent des instantanés antérieurs ; ne collez pas le chemin résiduel 2019-ncov dans un travail de 2026 comme s'il était en ligne. Copiez la ponctuation officielle CSE, puis remplacez l'URL par la page que vous avez réellement récupérée.

CSE Citation Quick Guide, sites web

Onglet citation-sequence / citation-name :

If no date of publication or update is available, include an access date.

Onglet name-year :

If no date of publication is available, use “date unknown” and include an access date.

Site web daté officiel citation-sequence (CDC ; l'URL résiduelle renvoie maintenant 404) :

Health equity considerations and racial and ethnic minority groups. US Centers for Disease Control and Prevention, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Division of Viral Diseases; 2020 Apr 30 [updated 2022 Jan 25]. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/health-equity/race-ethnicity.html

Site web daté officiel name-year :

Health equity considerations and racial and ethnic minority groups. 2020 Apr 30. US Centers for Disease Control and Prevention, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Division of Viral Diseases; [updated 2022 Jan 25]. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/health-equity/race-ethnicity.html

Name-year officiel dans le texte pour cette page :

(Health equity . . . 2020)

Carte non datée officielle name-year :

Montrose Point Bird Sanctuary, Chicago, Illinois. [date unknown]. Google Maps; [accessed 2022 Jan 3]. https://goo.gl/maps/GJALYGBXFZ8TSGK5A

Name-year officiel dans le texte :

(Montrose Point . . . [date unknown])

Les données non publiées restent dans la phrase, pas dans la liste de références

Les groupes de laboratoire tentent encore d'entrer « données non publiées » et conversations de couloir comme références numérotées. CSE 9 les laisse hors de la liste finale :

CSE Citation Quick Guide, communication personnelle

References to personal communications are placed in running text rather than as formal end references. Permission is usually required and should be acknowledged in an “Acknowledgments” or “Notes” section at the end of the document.

. . . local and systemic reactions were expected to be stronger after the second dose (2022 letter from TD Perez to author; unreferenced, see “Notes”) . . .

Not all forthcoming or unpublished sources are suitable for inclusion in reference lists. Check with your publisher if in doubt.

Écrivez (A. Johnson, unpublished data, 2026) dans la phrase si votre enseignant l'autorise. N'inventez pas une référence finale numérotée pour une page de carnet que personne d'autre ne peut retrouver. Si les données paraissent plus tard dans un article, une thèse ou une notice GenBank, citez cet objet récupérable.

Les noms taxonomiques sont de la prose, pas un quatrième système de citation secret

Dans le texte courant, mettez le binôme en italique : Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Homo sapiens. Après la première mention, de nombreuses revues de biologie acceptent le genre abrégé (D. melanogaster). L'autorité descriptive—Meigen, 1830 pour cette drosophile—est de la nomenclature taxonomique. Ce n'est pas une référence finale CSE sauf si vous avez réellement lu et cité l'article de description originale. Ne transformez pas Meigen, 1830 en un faux article de revue, et ne mettez pas l'autorité en italique.

Les symboles de gènes et de protéines suivent l'organisme de nomenclature du taxon (HGNC pour les gènes humains, FlyBase, SGD, et ainsi de suite), pas le chapitre 29 de CSE. CSE vous dit comment citer l'article ou la notice de base de données ; le style du symbole vient du champ.

CSE, APA, Vancouver, ou le style maison de la revue ?

La biologie de campus n'est pas un seul style. La page de champ des styles de citation en biologie est le panorama ; ce tableau est la décision que vous prenez pour un devoir :

Adaptez le support. N'importez pas des parenthèses APA dans une liste numérotée CSE.
Si le document dit…	Utilisez	N'utilisez pas
CSE, CBE, Scientific Style and Format, ou Council of Science Editors	CSE (l'un des trois systèmes)	La ponctuation auteur–date APA, ou le (1) de Vancouver comme s'il était du CSE
APA, méthodes de psychologie, ou une revue de didactique de la biologie qui nomme APA	APA	CSE name–year. Ils se ressemblent et ce n'est pas la même liste
ICMJE, Uniform Requirements, NLM, ou Vancouver	Vancouver ou le guide de citation médicale	Le seuil et al. à 5 auteurs de CSE 9 ou les parenthèses name–year
Consignes aux auteurs de Nature, Cell, Science ou PLOS	Le style maison de cette revue	Un « style biologie » générique inventé à partir de cette page

Science et PNAS sont les revues que CSE 9 cite comme modèles du nouveau seuil d'auteurs ; leurs propres Instructions for Authors gouvernent encore les manuscrits qui y sont soumis. Un article PLOS ONE utilise le style numéroté de type Vancouver de PLOS, pas une liste name–year CSE. Quand le syllabus se tait, demandez. Puis verrouillez un système avant de formater la première référence.

Échecs que les étudiants de biologie rencontrent vraiment

Mélanger les systèmes. Le numéro 7 dans le texte ne peut pas pointer vers une liste alphabétique name–year. Choisissez un système et réutilisez-le dans chaque légende de figure.
Utiliser le seuil de 10 auteurs de la 8e édition. CSE 9 énumère au plus 5 noms, puis premier auteur + et al. Une référence à 7 auteurs de Molecular Biology of the Cell est Alberts B et al., pas sept noms de famille. La ligne résiduelle Pizzi à 10 auteurs vit encore sur le Quick Guide de 8e édition.
Inventer des abréviations de revue. J. Cell. Biol. avec des points en trop n'est pas une abréviation CSE. Utilisez l'ISSN LTWA ou le NLM Catalog.
Citer la base de données qui a trouvé le PDF. PubMed, JSTOR et le proxy du campus sont des chemins de recherche. La source est l'article de revue.
Laisser la ville sur chaque livre. CSE 9 a supprimé le lieu de publication. New York: W. W. Norton & Company; 2022 est l'ancien modèle.
Tamponner une date d'accès sur chaque DOI. Les dates d'accès restent seulement lorsque la date de publication, de copyright ou de révision ne peut pas être déterminée.
Copier l'URL CDC 2019-ncov résiduelle. L'exemple officiel de site web CSE imprime encore ce chemin ; ouvert le 9 octobre 2026, il a renvoyé 404. Citez la page que vous avez réellement ouverte.
Copier « Forthcoming 2026 » pour Harrison 22. McGraw Hill a publié la 22e édition en 2025, Longo étant listé en premier.
Citer la ligne medRxiv de Lopez Bernal après avoir lu le NEJM. La prépublication du Quick Guide est le modèle. L'article de revue est N Engl J Med. 2021;385(7):585–594.
Oublier que les sites web name–year disent date unknown. L'onglet citation–sequence ne demande qu'une date d'accès. L'onglet name–year ajoute [date unknown].
Traiter un numéro d'article comme un eLocator APA. Le CSE officiel écrit Adv Meteorol. 2020:8874869 (numéroté) ou Adv Meteorol. 8874869 (name–year).
Écrire une affirmation de séquence sans accession.version. AF123456 ne suffit pas ; AF123456.2 est l'objet citable. GenBank Release 273.0 est une livraison brute de données, pas une citation.
Citer BLAST 1990 pour une recherche BLAST+. La liste d'aide actuelle de NCBI comprend Camacho BLAST+ (BMC Bioinformatics 10:421) et ElasticBLAST 2023.
Citer ImageJ alors que vous avez exécuté Fiji. La page de citation ImageJ veut Schneider 2012 pour ImageJ et Schindelin 2012 pour Fiji.
Mettre des données non publiées dans la liste numérotée. Les communications personnelles et les résultats de carnet restent dans la phrase.
Formater un binôme comme s'il était une référence. D. melanogaster est de la prose. L'article que vous avez lu sur cette mouche est la citation.
Citer une revue pour un résultat expérimental précis. Utilisez l'article original de méthodes ou de résultats lorsque l'affirmation porte sur cette expérience.
Omettre logiciels, paquets ou protocoles publiés. Citez la version que vous avez exécutée à partir de la citation recommandée du projet ou de l'article de méthodes. N'inventez pas une version que vous n'avez jamais utilisée.

Formatez la notice que vous avez réellement capturée

Un générateur ne peut appliquer la ponctuation CSE qu'aux métadonnées que vous avez enregistrées. Il ne peut pas inventer un numéro de fascicule, une abréviation ISSN ou une version de séquence. Verrouillez d'abord le système dans le texte, puis formatez à partir d'une notice complète—DOI, PMID ou champs manuels—dans le générateur de citations CSE.

Générez des citations CSE pour des articles de biologie

Utilisez citation–sequence, citation–name ou name–year de façon cohérente. Recherchez par DOI ou PubMed ID, ou saisissez la source que vous avez réellement ouverte. Le générateur n'inventera pas un suffixe de version GenBank que vous n'avez jamais noté.

Essayez le générateur de citations CSE →

Questions de citation CSE en biologie

CSE est-il la même chose que CBE ?: Oui, historiquement. Le Council of Biology Editors est devenu le Council of Science Editors. Les polycopiés de campus disent encore CBE. Le livre actuel est The CSE Manual, 9e édition (2024). Ne suivez pas une photocopie CBE de 6e édition—ni le Quick Guide résiduel de 8e édition qui énumère encore les 10 premiers auteurs—pour les seuils d'auteurs, les villes ou les dates d'accès.
Quel système CSE un compte rendu de laboratoire de biologie doit-il utiliser ?: Celui que l'enseignant a nommé. Si la fiche dit « CSE numéroté », c'est citation–sequence sauf si elle demande aussi d'alphabétiser la liste d'abord (citation–name). Les cours d'écologie et de biologie organismique veulent souvent name–year. Ne devinez pas à partir d'un article de méthodes qui vous a plu.
Combien d'auteurs CSE 9 énumère-t-il avant et al. ?: Cinq. Une œuvre avec 6 auteurs ou plus énumère le premier auteur plus et al. dans la référence finale. Les citations name-year dans le texte utilisent déjà premier auteur plus et al pour 3 auteurs ou plus. La règle « les 10 premiers » de la 8e édition est retirée ; la ligne Pizzi Anticancer Res. de l'ancien Quick Guide est résiduelle.
Dois-je mettre les noms de revue en italique en CSE ?: Non. Les références finales CSE composent les titres de revue en romain et les abrègent. L'italique appartient aux binômes dans le texte courant (Homo sapiens) et à quelques cas particuliers de titre, pas à J Cell Biol dans la liste de références.
Comment citer une séquence GenBank ou RefSeq en CSE ?: Mettez l'accession.version complète dans l'article (AF123456.2, NM_001349333.1). Pour une référence finale formelle, suivez le modèle de notice de la base Nucleotide de la NLM : base de données, organisation, accession, description du produit, date de consultation et URL. Ne citez pas « GenBank » sans identifiant, et ne citez pas Release 273.0 comme s'il s'agissait de la séquence.
Comment citer BLAST ou ImageJ en CSE ?: Citez l'article de méthodes que nomment NCBI ou le projet. BLAST 1990 a cinq auteurs, donc CSE 9 énumère Altschul, Gish, Miller, Myers et Lipman. Le BLAST web actuel est BLAST+ ; citez Camacho et al., BMC Bioinformatics 2009;10:421. ImageJ est Schneider, Rasband et Eliceiri, Nat Methods 2012. Si vous avez exécuté Fiji, citez Schindelin 2012 à la place. Ne citez pas l'onglet du navigateur.
Comment citer un article eLife ou PLOS qui a un numéro au lieu de pages ?: Mettez le numéro d'article dans l'emplacement location de CSE. Le spécimen officiel du Quick Guide est Liu et al., Adv Meteorol. 2020:8874869 (citation-sequence) ou Adv Meteorol. 8874869 (name-year). N'importez pas le préfixe Article eLocator d'APA.
Dois-je citer bioRxiv ou l'article publié ?: Citez la version que vous avez utilisée. Si l'article est désormais dans une revue, citez la revue et le DOI. Gardez la prépublication seulement lorsque vous discutez de cette prépublication. L'exemple officiel de CSE 9 est Lopez Bernal et al. sur medRxiv, étiqueté [preprint] ; cet article a ensuite paru comme N Engl J Med. 2021;385(7):585–594.
Le CSE name-year est-il la même chose que APA 7 ?: Non. Les deux mettent un nom et une année dans la phrase. APA utilise des virgules, des esperluettes, des titres d'article en casse de phrase avec revue-et-volume en italique, et un seuil de 20 auteurs. CSE name-year utilise (Fauci and Lane 2020), des titres de revue abrégés en romain, l'année juste après les auteurs dans la liste, et un seuil de 5 auteurs. Voir APA vs CSE.
CSE a-t-il encore besoin de la ville pour Norton ou Springer ?: Pas dans la 9e édition. La note d'Olson dans Science Editor et le Quick Guide retirent tous deux le lieu de publication parce que les éditeurs ont plusieurs implantations et que l'œuvre se trouve sans la ville. Une ligne « New York (NY) : » de 8e édition est dépassée pour un travail CSE de 2026.