Como citar fontes de biologia no estilo CSE

Resposta rápida: como citar fontes de biologia em CSE

Abra primeiro o programa da disciplina ou as Instruções aos Autores do periódico. Use CSE quando esse documento nomear The CSE Manual, Scientific Style and Format, CBE ou Council of Science Editors. Escolha um sistema para o artigo inteiro: citation–sequence, citation–name ou name–year. As listas numeradas reutilizam o número original; as listas name–year são alfabéticas. As referências de periódico põem primeiro os autores (apelido e depois iniciais, sem pontos), em seguida o título do artigo em maiúsculas de frase, o periódico abreviado com a ISSN List of Title Word Abbreviations, o ano, o volume, o fascículo, as páginas ou o número do artigo, e uma ligação https://doi.org/ quando existir um DOI.

O Quick Guide formula a regra dos três sistemas numa só frase que se pode levar a um docente que diz «é só usar CSE»:

O que este guia cobre — e o que não cobre

Use esta página quando a parte difícil for o objeto de biologia: um artigo da Nature versus o registo do PubMed que o encontrou, uma accession.version do GenBank versus o artigo que a depositou, uma pesquisa BLAST+ versus o artigo do algoritmo de Altschul 1990, um preprint do bioRxiv versus o artigo de periódico posterior, ou uma citação de métodos num relatório de laboratório versus o livro de protocolos. Para a escolha que começa no veículo entre CSE e APA, use APA vs CSE ou qual estilo de citação. Estilos numerados vizinhos não são CSE: citação médica cobre AMA 11 e Vancouver/NLM; citação em química cobre ACS. Para um percurso de uma só fonte, veja como citar um artigo de periódico em CSE.

A autoridade atual é The CSE Manual, 9.ª edição, não uma fotocópia CBE

Os departamentos ainda dizem «estilo CBE» ou «CSE 8.ª». Querem dizer The CSE Manual, o sucessor de 2024 de Scientific Style and Format, 8.ª edição (2014). O conselho renomeou o livro porque os utilizadores já o chamavam de manual CSE. As referências ficam no capítulo 29. O Quick Guide é o conjunto público de exemplos; o apêndice 29.1 cobre abreviaturas de títulos de periódico. O CSE cita o próprio manual assim:

Peter J. Olson, um dos editores do capítulo 29, reiterou os cortes da 9.ª edição em Science Editor (março de 2024; o PDF de março de 2024 foi aberto para esta reescrita depois de o artigo HTML ter devolvido 403):

O Quick Guide em linha da 8.ª edição ainda está alojado em scientificstyleandformat.org. Continua a ensinar o corte retirado de 10 autores. Não misture os exemplos dele com um artigo da 9.ª edição:

As folhas de aula da 8.ª edição que listam os primeiros 10 autores, exigem uma cidade para a Springer e carimbam data de acesso em cada DOI estão a ensinar o livro antigo.

Os três sistemas CSE não são estilos de casa intercambiáveis

A pontuação da referência final é quase a mesma nos três sistemas. A diferença é o funcionamento da marca no texto e a ordenação da lista. O Quick Guide diz que o par numerado é idêntico, salvo a ordem da lista:

O Quick Guide não fixa a marca numerada em sobrescrito versus parênteses. Periódicos e docentes fixam. Um laboratório do campus que quer sobrescrito ¹ depois do ponto continua a ser CSE citation–sequence; um artigo médico ICMJE que quer (1) é Vancouver, não CSE, mesmo quando a referência final parece semelhante.

Artigos de periódico: exemplos oficiais do CSE 9

Os modelos de periódico do Quick Guide estão na caixa acima. Os títulos de periódico são abreviados. Com dois autores, a referência final usa vírgula e a marca name–year no texto usa and. O et al name–year no texto não tem ponto nos exemplos oficiais. Estas linhas são exemplos oficiais do CSE 9, não artigos inventados de biologia celular:

Os periódicos de biologia que abandonaram a paginação por fascículo em favor de números de artigo usam o mesmo espaço de localização. O espécime oficial do Quick Guide é de hidrologia, não um artigo falso da eLife; eLife, PLOS Biology e PeerJ ainda põem o número do artigo onde o CSE põe location. O mesmo capítulo mostra também um volume sem fascículo e um suplemento:

Note os pormenores da 9.ª edição que os estudantes ainda erram. As iniciais não têm pontos nem espaços (Fauci AS, não Fauci, A. S.). O título do artigo está em maiúsculas de frase. Não há ponto extra depois do URL do DOI. Obras do mesmo ano dos mesmos autores recebem 2020a e 2020b. Um número de artigo não é um prefixo eLocator da APA; o CSE escreve o número depois dos dois-pontos (sistemas numerados) ou depois do título do periódico (name–year).

Um artigo real de genética formatado do mesmo modo — isto é Watson and Crick (1953), não uma amostra do CSE Quick Guide — fica assim em citation–sequence:

Encontrar esse PDF no PubMed ou no Web of Science não torna o PubMed a fonte. Cite a Nature. Procure a abreviatura na ISSN LTWA ou no NLM Catalog; não invente Nat. nem J Cell Bio. Prefira o DOI. Se só tiver um PMID, encontre o DOI antes de formatar a referência.

Livros e capítulos: a cidade de publicação desapareceu

As referências de livro do CSE 9 eliminam a cidade que os folhetos da 8.ª edição ainda exigem. Estas linhas são exemplos oficiais do CSE 9, inclusive dois títulos de biologia (Reiss e Ruse; Klarsfeld e Revah) e a tradução oficial sobre biogénese mitocondrial:

Um manual atual de biologia celular com mais de cinco autores começa, portanto, pelo primeiro nome mais et al., e não precisa de «New York». Alberts, Heald, Johnson, Morgan, Raff, Roberts e Walter são sete nomes, por isso o CSE 9 trunca:

Cite um capítulo só quando utilizou esse capítulo, não o livro inteiro. O padrão oficial de mesmo autor mantém primeiro o título do livro, depois o rótulo do capítulo e as páginas. Se o capítulo tem autores diferentes dos editores do livro, use o padrão In: Editor, editor. do Quick Guide (Geisslitz e Scherf acima). Não cite o nome do ficheiro PDF da livraria do campus.

Vestígio: Harrison 22 já não é “Forthcoming 2026”

O Quick Guide em vigor ainda imprime a 22.ª edição de Harrison como livro forthcoming datado de 2026. A McGraw Hill anunciou o lançamento mundial a 20 de agosto de 2025; a linha de copyright do impresso/eBook é 2025. A lista publicada de editores começa por Longo, não por Kasper. Conserve a linha oficial forthcoming como modelo CSE e cite o livro que de facto abriu:

Sequências e bases de dados: cite a accession.version, não «GenBank»

Os artigos de biologia molecular falham nisto com mais frequência do que na pontuação de periódico. Se utilizou um registo de nucleótido ou de proteína, o objeto é esse registo. A atualização GenBank 2025 em Nucleic Acids Research (53(D1):D56–D61) continua a ser o anual dedicado mais recente do GenBank em 9 de outubro de 2026; o GenBank Release 273.0 (15 de agosto de 2026) é um lançamento de dados, não um artigo de citação substituto. A atualização de 2025 formula a regra de recuperabilidade:

O identificador trabalhado deles é AF123456.2, não AF123456. Pesquisar a acessão sem versão devolve só a versão atual, que pode ter mudado desde a análise. A página de citação NCBI da NLM dá o padrão de registo de base (isto é redação NLM/Citing Medicine, não uma linha do CSE 9 Quick Guide). A mesma página aponta agora também para o artigo de recursos NCBI 2026 para uma citação de base geral:

Substitua a acessão, a descrição do produto e a data citada pela versão que recuperou. Não cite «NCBI» nem «GenBank» sem acessão quando a afirmação depende de uma sequência. Se o artigo que está a escrever usou o GenBank como base e não como um registo, cite a atualização atual do GenBank em Nucleic Acids Research (ainda o artigo de 2025 até aparecer uma atualização GenBank 2026) em vez de inventar uma referência à página inicial. Protein Data Bank, UniProt e GBIF funcionam do mesmo modo: nomeie o ID do registo que um leitor posterior possa abrir. A página da NLM também manda citar o BLAST a partir da lista de referências do BLAST, não a partir de uma captura de ecrã da caixa de pesquisa.

Software e artigos de métodos: cite o algoritmo que executou

Um parágrafo de Methods que diz «as sequências foram pesquisadas com BLAST» sem referência está incompleto. A ajuda do BLAST da NCBI lista os artigos a citar. O artigo do algoritmo de 1990 tem cinco autores, por isso o CSE 9 lista os cinco. O artigo de gapped-BLAST de 1997 tem sete, por isso o CSE 9 mantém só Altschul mais et al. Os estudantes que executam o serviço web atual ou o binário blastn estão, em geral, a executar BLAST+, cujo artigo de arquitetura é Camacho et al. — sete autores, por isso o CSE 9 trunca. A página de ajuda da NCBI ainda imprime esse artigo como 2008; o artigo BMC é volume 10, artigo 421 (15 de dezembro de 2009). ElasticBLAST (2023) tem cinco autores, por isso o CSE 9 lista os cinco. Estas linhas são formatações CSE 9 das citações recomendadas pela NCBI, não amostras do Quick Guide:

A página de citação do ImageJ é explícita: cite ImageJ (doi:10.1038/nmeth.2089) para o programa original, Fiji (doi:10.1038/nmeth.2019) se utilizou Fiji, e ImageJ2 (doi:10.1186/s12859-017-1934-z) se utilizou ImageJ2. Cite a versão que executou. Se a página do projeto nomear uma citação preferida (ImageJ, R, QIIME 2, FlyBase), use esse artigo ou essa referência de software. Não invente uma data de lançamento que nunca registou e não cite «NCBI BLAST» como se fosse um artigo de periódico sem autores.

Preprints, dissertações e artigos ahead-of-print

O CSE 9 acrescentou uma secção de preprint. Marque o estado entre parênteses retos e mantenha o nome do servidor. Quando a versão revista por pares aparecer, cite o artigo de periódico e retire o preprint, salvo se estiver a discutir o próprio registo do preprint. O espécime oficial do Quick Guide é Lopez Bernal et al. no medRxiv. Esse artigo já não é só um preprint: saiu como Lopez Bernal et al., *N Engl J Med* 2021;385(7):585–594. Conserve a linha oficial de preprint como modelo CSE; cite a versão NEJM se foi essa que leu.

Sítios: URL residual do CDC, e date unknown só em name–year

Os sítios ainda precisam de uma data de publicação ou atualização quando ela existe. Os dois sistemas CSE não redigem a regra de data em falta de forma idêntica. Citation–sequence pede só uma data de acesso; name–year acrescenta a expressão «date unknown». O espécime oficial de sítio datado continua a ser a página de equidade em saúde do CDC. Aberta em 9 de outubro de 2026, esse URL exato devolveu 404. Os arquivos do CDC e archive.cdc.gov guardam capturas anteriores; não cole o caminho residual 2019-ncov num artigo de 2026 como se estivesse ativo. Copie a pontuação oficial CSE e depois substitua o URL pela página que de facto recuperou.

Os dados não publicados ficam na frase, não na lista de referências

Os grupos de laboratório ainda tentam lançar «unpublished data» e conversas de corredor como referências numeradas. O CSE 9 mantém-nos fora da lista final:

Escreva (A. Johnson, unpublished data, 2026) na frase se o docente o permitir. Não invente uma referência final numerada para uma página de caderno que mais ninguém consegue recuperar. Se os dados depois aparecerem num artigo, numa tese ou num registo do GenBank, cite esse objeto recuperável.

Os nomes taxonómicos são prosa, não um quarto sistema secreto de citação

No texto corrido, coloque o binómio em itálico: Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Homo sapiens. Depois da primeira menção, muitos periódicos de biologia aceitam o género abreviado (D. melanogaster). A autoridade descritora — Meigen, 1830 para essa mosca-da-fruta — é nomenclatura taxonómica. Não é uma referência final CSE a menos que de facto tenha lido e citado o artigo original de descrição. Não transforme Meigen, 1830 num artigo de periódico falso e não italicize a autoridade.

Os símbolos de genes e proteínas seguem o órgão de nomenclatura do organismo (HGNC para genes humanos, FlyBase, SGD e assim por diante), não o capítulo 29 do CSE. O CSE diz como citar o artigo ou o registo de base; o estilo do símbolo vem do campo.

CSE, APA, Vancouver ou o estilo de casa do periódico?

A biologia no campus não é um só estilo. A página de campo de estilos de citação em biologia é o levantamento; esta tabela é a decisão que se toma para um trabalho:

Science e PNAS são os periódicos que o CSE 9 cita como modelos do novo corte de autores; as próprias Instruções aos Autores deles ainda regem manuscritos submetidos ali. Um artigo da PLOS ONE usa o estilo numerado à maneira Vancouver da PLOS, não uma lista CSE name–year. Quando o programa silencia, pergunte. Depois fixe um sistema antes de formatar a primeira referência.

Modos de falha que os estudantes de biologia de facto encontram

• Misturar sistemas. O número 7 no texto não pode apontar para uma lista name–year alfabética. Escolha um sistema e reutilize-o em cada legenda de figura.
• Usar o corte de 10 autores da 8.ª edição. O CSE 9 lista no máximo 5 nomes, depois primeiro autor + et al. Uma referência de Molecular Biology of the Cell com 7 autores é Alberts B et al., não sete apelidos. A linha residual de 10 autores de Pizzi ainda vive no Quick Guide da 8.ª edição.
• Inventar abreviaturas de periódico. J. Cell. Biol. com pontos a mais não é abreviatura CSE. Use a ISSN LTWA ou o NLM Catalog.
• Citar a base que encontrou o PDF. PubMed, JSTOR e o proxy do campus são caminhos de pesquisa. A fonte é o artigo de periódico.
• Deixar a cidade em cada livro. O CSE 9 retirou o local de publicação. New York: W. W. Norton & Company; 2022 é o padrão antigo.
• Carimbar data de acesso em cada DOI. As datas de acesso permanecem só quando a data de publicação, copyright ou revisão não puder ser determinada.
• Copiar o URL residual 2019-ncov do CDC. O exemplo oficial de sítio CSE ainda imprime esse caminho; aberto em 9 de outubro de 2026 devolveu 404. Cite a página que de facto abriu.
• Copiar “Forthcoming 2026” para Harrison 22. A McGraw Hill publicou a 22.ª edição em 2025, com Longo listado em primeiro.
• Citar a linha medRxiv de Lopez Bernal depois de ter lido o NEJM. O preprint do Quick Guide é o modelo. O artigo de periódico é N Engl J Med. 2021;385(7):585–594.
• Esquecer que sítios name–year dizem date unknown. O separador citation–sequence pede só uma data de acesso. O separador name–year acrescenta [date unknown].
• Tratar um número de artigo como eLocator da APA. O CSE oficial escreve Adv Meteorol. 2020:8874869 (numerado) ou Adv Meteorol. 8874869 (name–year).
• Escrever uma afirmação de sequência sem accession.version. AF123456 não basta; AF123456.2 é o objeto citável. O GenBank Release 273.0 é um despejo, não uma citação.
• Citar BLAST 1990 para uma pesquisa BLAST+. A lista de ajuda atual da NCBI inclui Camacho BLAST+ (BMC Bioinformatics 10:421) e ElasticBLAST 2023.
• Citar ImageJ quando executou Fiji. A página de citação do ImageJ quer Schneider 2012 para ImageJ e Schindelin 2012 para Fiji.
• Colocar dados não publicados na lista numerada. Comunicações pessoais e resultados de caderno ficam na frase.
• Formatar um binómio como se fosse referência. D. melanogaster é prosa. O artigo que leu sobre essa mosca é a citação.
• Citar uma revisão por um resultado experimental específico. Use o artigo original de métodos ou resultados quando a afirmação é sobre essa experiência.
• Omitir software, pacotes ou protocolos publicados. Cite a versão que executou a partir da citação recomendada do projeto ou do artigo de métodos. Não invente uma versão que nunca usou.

Formate o registo que de facto capturou

Um gerador só consegue aplicar a pontuação CSE aos metadados que armazenou. Não inventa número de fascículo, abreviatura ISSN nem versão de sequência. Fixe primeiro o sistema no texto e depois formate a partir de um registo completo — DOI, PMID ou campos manuais — no gerador de citações CSE.

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