CSE có giống CBE không?

Có, về lịch sử. Council of Biology Editors trở thành Council of Science Editors. Tờ phát trong trường vẫn nói CBE. Sách hiện hành là The CSE Manual, ấn bản 9 (2024). Đừng theo bản photocopy CBE ấn bản 6—hoặc Quick Guide ấn bản 8 còn sót vẫn liệt kê 10 tác giả đầu—cho ngưỡng tác giả, thành phố, hoặc ngày truy cập.

Báo cáo thí nghiệm sinh học nên dùng hệ thống CSE nào?

Hệ thống giảng viên đã gọi tên. Nếu tờ nói «CSE đánh số», đó là citation–sequence trừ khi nó cũng bảo xếp alphabet danh mục trước (citation–name). Các học phần sinh thái và sinh vật thường muốn name–year. Đừng đoán từ một bài phương pháp bạn thích.

CSE 9 liệt kê bao nhiêu tác giả trước et al.?

Năm. Một công trình có 6 tác giả trở lên liệt kê tác giả đầu cộng et al. ở tài liệu cuối. Trích dẫn trong văn name-year đã dùng tác giả đầu cộng et al cho 3 tác giả trở lên. Quy tắc «10 đầu» của ấn bản 8 đã thôi; dòng Pizzi Anticancer Res. trên Quick Guide cũ là còn sót.

Tôi có in nghiêng tên tạp chí trong CSE không?

Không. Tài liệu cuối CSE đặt tên tạp chí kiểu đứng và viết tắt chúng. In nghiêng thuộc về danh pháp hai phần trong văn chảy (Homo sapiens) và vài trường hợp tiêu đề đặc biệt, không phải J Cell Biol trong danh mục tài liệu.

Làm sao trích dẫn một trình tự GenBank hoặc RefSeq trong CSE?

Đặt accession.version đầy đủ vào bài (AF123456.2, NM_001349333.1). Với tài liệu cuối chính thức, theo mẫu bản ghi cơ sở Nucleotide của NLM: cơ sở dữ liệu, tổ chức, mã truy cập, mô tả sản phẩm, ngày trích dẫn, và URL. Đừng trích dẫn «GenBank» mà không có định danh, và đừng trích dẫn Release 273.0 như thể đó là trình tự.

Làm sao trích dẫn BLAST hoặc ImageJ trong CSE?

Trích dẫn bài phương pháp mà NCBI hoặc dự án gọi tên. BLAST 1990 có năm tác giả, nên CSE 9 liệt kê Altschul, Gish, Miller, Myers, và Lipman. BLAST web hiện hành là BLAST+; trích dẫn Camacho et al., BMC Bioinformatics 2009;10:421. ImageJ là Schneider, Rasband, và Eliceiri, Nat Methods 2012. Nếu bạn đã chạy Fiji, trích dẫn Schindelin 2012 thay thế. Đừng trích dẫn thẻ trình duyệt.

Làm sao trích dẫn bài eLife hoặc PLOS có số thay vì trang?

Đặt số bài vào ô vị trí của CSE. Mẫu chính thức của Quick Guide là Liu et al., Adv Meteorol. 2020:8874869 (citation-sequence) hoặc Adv Meteorol. 8874869 (name-year). Đừng nhập tiền tố Article eLocator của APA.

Tôi nên trích dẫn bioRxiv hay bài đã xuất bản?

Trích dẫn phiên bản bạn đã dùng. Nếu bài nay đã ở tạp chí, trích dẫn tạp chí và DOI. Chỉ giữ bản in trước khi bạn đang thảo luận bản in trước đó. Ví dụ chính thức của CSE 9 là Lopez Bernal et al. trên medRxiv, gắn [preprint]; bài đó sau xuất hiện thành N Engl J Med. 2021;385(7):585–594.

Name-year CSE có giống APA 7 không?

Không. Cả hai đặt một tên và một năm vào câu. APA dùng dấu phẩy, dấu &, tiêu đề bài kiểu câu với tạp chí-và-tập in nghiêng, và ngưỡng 20 tác giả. CSE name-year dùng (Fauci and Lane 2020), tên tạp chí đứng viết tắt, năm ngay sau tác giả trong danh mục, và ngưỡng 5 tác giả. Xem APA so với CSE.

CSE vẫn cần thành phố cho Norton hoặc Springer không?

Không trong ấn bản 9. Ghi chú Science Editor của Olson và Quick Guide đều bỏ nơi xuất bản vì nhà xuất bản có nhiều địa điểm và tác phẩm tìm được mà không cần thành phố. Một dòng «New York (NY):» của ấn bản 8 đã lỗi thời cho bài CSE năm 2026.

Cách trích dẫn nguồn sinh học theo kiểu CSE (CSE Manual ấn bản 9) [2026]

Trả lời nhanh: cách trích dẫn nguồn sinh học trong CSE

Mở đề cương hoặc Hướng dẫn dành cho tác giả của tạp chí trước. Dùng CSE khi tài liệu đó gọi tên The CSE Manual, Scientific Style and Format, CBE, hoặc Council of Science Editors. Chọn một hệ thống cho cả bài: citation–sequence, citation–name, hoặc name–year. Danh mục đánh số dùng lại số gốc; danh mục name–year theo alphabet. Tài liệu tạp chí đặt tác giả (họ rồi chữ cái đầu, không dấu chấm) trước, rồi tiêu đề bài theo kiểu câu, tạp chí viết tắt theo ISSN List of Title Word Abbreviations, năm, tập, số, trang hoặc số bài, và liên kết https://doi.org/ khi có DOI.

Mẫu chính thức CSE 9 và các dòng ví dụ đầu

Mẫu tạp chí citation-sequence / citation-name:

Author(s). Article title. Journal title. Date;volume(issue):location. URL

Mẫu tạp chí name-year:

Author(s). Date. Article title. Journal title. Volume(issue):location. URL

Mẫu sách citation-sequence:

Author(s). Title. Edition. Publisher; year of publication.

Mẫu sách name-year:

Author(s). Date. Title. Edition. Publisher.

Tạp chí citation-sequence chính thức:

Haasnoot M, Lawrence J, Magnan AK. Pathways to coastal retreat. Science. 2021;372(6548):1287–1290. https://doi.org/10.1126/science.abi6594

Tạp chí name-year chính thức:

Fauci AS, Lane HC. 2020. Four decades of HIV/AIDS—much accomplished, much to do. N Engl J Med. 383(1):1–4. https://doi.org/10.1056/NEJMp1916753

Name-year trong văn chính thức (hai tác giả):

(Fauci and Lane 2020)

Citation-sequence trong câu:

Các lộ trình thích ứng ven biển đã được dùng.¹

Quick Guide nêu quy tắc ba hệ thống trong một câu bạn có thể mang tới giảng viên nói «cứ dùng CSE»:

CSE Citation Quick Guide, ấn bản 9 (mở ngày 9 tháng 10 năm 2026)

The CSE Manual presents 3 systems for referring to references (also known as citations) within the text of a journal article, book, or other scientific publication: (1) citation–sequence, (2) name–year, and (3) citation–name.

A DOI-based URL (which starts with https://doi.org/), when available, should be preferred to any other form of URL.

For articles with more than 5 authors, list the first author followed by “et al.”

Journal titles are generally abbreviated according to the List of Title Word Abbreviations maintained by the ISSN International Centre.

Hướng dẫn này bao gồm gì—và không bao gồm gì

Dùng trang này khi phần khó là đối tượng sinh học: một bài Nature so với bản ghi PubMed đã tìm ra nó, một accession.version GenBank so với bài đã nộp nó, một tìm kiếm BLAST+ so với bài thuật toán Altschul 1990, một bản in trước bioRxiv so với bài tạp chí sau, hoặc một trích dẫn phương pháp trong báo cáo thí nghiệm so với sách giao thức. Với lựa chọn nơi nhận bài trước giữa CSE và APA, dùng APA so với CSE hoặc kiểu trích dẫn nào. Các kiểu đánh số lân cận không phải CSE: trích dẫn y khoa gồm AMA 11 và Vancouver/NLM; trích dẫn hóa học gồm ACS. Để đi hết một nguồn, xem cách trích dẫn bài tạp chí theo CSE.

Thẩm quyền hiện hành là The CSE Manual, ấn bản 9, không phải bản photocopy CBE

Các khoa vẫn nói «kiểu CBE» hoặc «CSE ấn bản 8.» Họ muốn nói The CSE Manual, người kế nhiệm năm 2024 của Scientific Style and Format, ấn bản 8 (2014). Hội đồng đổi tên sách vì người dùng đã gọi nó là cẩm nang CSE. Tài liệu nằm ở Chương 29. Quick Guide là bộ ví dụ công khai; Phụ lục 29.1 gồm viết tắt tên tạp chí. CSE trích dẫn chính cẩm nang như sau:

Trích dẫn trang chủ CSE Manual chính thức (csemanual.org, mở ngày 9 tháng 10 năm 2026)

Council of Science Editors, Style Manual Task Force. The CSE manual: scientific style and format for authors, editors, and publishers. 9th ed. Council of Science Editors in cooperation with The University of Chicago Press; 2024. https://doi.org/10.7208/cse9

Peter J. Olson, một trong các biên tập viên Chương 29, nêu lại các ngưỡng ấn bản 9 trên Science Editor (tháng 3 năm 2024; bản PDF tháng 3 năm 2024 được mở cho lần viết lại này sau khi bài HTML trả 403):

Science Editor, Peter J. Olson về CSE 9 Chương 29

As of the ninth edition, the maximum number of authors listed is 5, and references with 6 or more authors should list only the first author followed by “et al.”

Additionally, access dates for online sources are now required only when the date of publication, copyright, or revision cannot be determined, and publisher locations are no longer needed (partly because this information has become less relevant, but also because many book publishers have multiple locations).

Quick Guide trực tuyến ấn bản 8 vẫn được lưu tại scientificstyleandformat.org. Nó vẫn dạy ngưỡng 10 tác giả đã thôi. Đừng trộn ví dụ của nó với một bài ấn bản 9:

Quick Guide ấn bản 8 còn sót (vẫn hiện hành; đừng chép vào CSE 9)

Ngưỡng tác giả ấn bản 8 (đã thôi):

For articles with more than 10 authors, list the first 10 followed by “et al.”

Mẫu 10 tác giả ấn bản 8 (Pizzi):

Pizzi C, Caraglia M, Cianciulli M, Fabbrocini A, Libroia A, Matano E, Contegiacomo A, Del Prete S, Abbruzzese A, Martignetti A, et al. Low-dose recombinant IL-2 induces psychological changes: monitoring by Minnesota Multiphasic Personality Inventory (MMPI). Anticancer Res. 2002;22(2A):727–732.

Tờ lớp ấn bản tám liệt kê 10 tác giả đầu, đòi một thành phố cho Springer, và đóng dấu ngày truy cập lên mọi DOI đang dạy cuốn sách cũ.

Ba hệ thống CSE không phải kiểu nhà hoán đổi được

Dấu câu tài liệu cuối gần như giống nhau ở cả ba hệ thống. Khác biệt là cách dấu trong văn hoạt động và cách danh mục được sắp. Quick Guide nói cặp đánh số giống nhau trừ thứ tự danh mục:

CSE Citation Quick Guide, về các hệ thống đánh số

These 2 systems are identical except for the order in which the end references are listed. In both systems, numbers within the text refer to the end references.

In the citation–sequence system, the end references are listed in the sequence in which they first appear within the text. For example, if a reference by Smith is the first one mentioned in the text, then the complete reference to the Smith work will be number 1 in the end references. The same number is used for subsequent in-text references to the same document.

In the citation–name system, the end references are listed alphabetically by the first author’s surname. Multiple works by the same author are listed alphabetically by title.

Chọn hệ thống mà đề cương hoặc tạp chí gọi tên. Đừng trộn chúng trong một bài.
Hệ thống	Dấu trong văn	Thứ tự danh mục cuối	Cách dùng sinh học thường gặp
Citation–sequence	Số ở lần nhắc đầu; dùng lại số đó	Thứ tự xuất hiện lần đầu	Nhiều báo cáo thí nghiệm và một số tạp chí khoa học sự sống
Citation–name	Số gán sau khi danh mục được xếp alphabet	Alphabet theo tác giả đầu, rồi tiêu đề	Ít phổ biến hơn trong trường; vẫn là một lựa chọn CSE
Name–year	(Họ Năm); hai tác giả nối bằng and	Alphabet, không đánh số; năm sau tác giả	Sinh thái, tiến hóa, và nhiều tạp chí sinh vật

Quick Guide không khóa dấu đánh số vào số mũ so với ngoặc đơn. Tạp chí và giảng viên thì khóa. Một phòng thí nghiệm trong trường muốn số mũ ¹ sau dấu chấm vẫn là CSE citation–sequence; một bài y khoa ICMJE muốn (1) là Vancouver, không phải CSE, dù tài liệu cuối trông giống.

Bài tạp chí: ví dụ chính thức CSE 9

Các mẫu tạp chí của Quick Guide nằm trong hộp phía trên. Tên tạp chí được viết tắt. Với hai tác giả, tài liệu cuối dùng dấu phẩy và dấu name–year trong văn dùng and. et al name–year trong văn không có dấu chấm ở các ví dụ chính thức. Các dòng này là ví dụ chính thức CSE 9, không phải bài sinh học tế bào bịa:

Ví dụ tạp chí chính thức CSE 9

Citation-sequence, ba tác giả:

Haasnoot M, Lawrence J, Magnan AK. Pathways to coastal retreat. Science. 2021;372(6548):1287–1290. https://doi.org/10.1126/science.abi6594

Citation-sequence, hơn 5 tác giả:

Ashraf M et al. Interaction between the distribution of diabetic retinopathy lesions and the association of optical coherence tomography angiography scans with diabetic retinopathy severity. JAMA Ophthalmol. 2020;138(12):1291–1297. https://doi.org/10.1001/jamaophthalmol.2020.4516

Name-year, hai tác giả:

Fauci AS, Lane HC. 2020. Four decades of HIV/AIDS—much accomplished, much to do. N Engl J Med. 383(1):1–4. https://doi.org/10.1056/NEJMp1916753

Name-year trong văn, hai tác giả:

(Fauci and Lane 2020)

Name-year trong văn, ba trở lên:

(Haasnoot et al 2021)

Ngưỡng tác giả name-year (Quick Guide):

For articles with 3 to 5 authors, list all authors in the end reference; for articles with more than 5 authors, list the first author followed by “et al.” In either case, list only the first author followed by “et al” in the in-text reference.

Các tạp chí sinh học đã bỏ đánh trang theo số để dùng số bài vẫn dùng cùng ô vị trí. Mẫu chính thức của Quick Guide là thủy văn, không phải bài eLife giả; eLife, PLOS Biology, và PeerJ vẫn đặt số bài vào chỗ CSE đặt location. Cùng chương cũng cho thấy một tập không có số và một phụ san:

Số bài chính thức CSE 9, không số, phụ san, và cặp cùng năm

Citation-sequence, số bài và không tập:

Liu L, Bai P, Liu C, Tian W, Liang K. Changes in extreme precipitation in the Mekong Basin. Adv Meteorol. 2020:8874869. https://doi.org/10.1155/2020/8874869

Name-year, số bài:

Liu L, Bai P, Liu C, Tian W, Liang K. 2020. Changes in extreme precipitation in the Mekong Basin. Adv Meteorol. 8874869. https://doi.org/10.1155/2020/8874869

Citation-sequence chính thức, tập và không số:

Kim KY, Kim BS. The effect of regional warming on the East Asian summer monsoon. Clim Dyn. 2020;54:3259–3277. https://doi.org/10.1007/s00382-020-05169-7

Citation-sequence chính thức, số cộng phụ san:

Yohannes AM, Kaplan A, Hanania NA. Anxiety and depression in chronic obstructive pulmonary disease: recognition and management. Cleve Clin J Med. 2018;85(2 Suppl 1):S11–S18. https://doi.org/10.3949/ccjm.85.s1.03

Name-year cùng tác giả, cùng năm (2020a chính thức):

Lee SMC et al. 2020a. Arterial structure and function during and after long-duration spaceflight. J Appl Physiol. 129(1):108–123. https://doi.org/10.1152/japplphysiol.00550.2019

Name-year cùng tác giả, cùng năm (2020b chính thức):

Lee SMC et al. 2020b. Efficacy of gradient compression garments in the hours after long-duration spaceflight. Front Physiol. 11:784. https://doi.org/10.3389/fphys.2020.00784

Name-year trong văn, cả hai công trình:

(Lee et al 2020a, 2020b)

Chú ý các chi tiết ấn bản 9 mà sinh viên vẫn làm sai. Chữ cái đầu không có dấu chấm và không có khoảng (Fauci AS, không phải Fauci, A. S.). Tiêu đề bài theo kiểu câu. Không có dấu chấm thừa sau URL DOI. Các công trình cùng năm của cùng tác giả lấy 2020a và 2020b. Một số bài không phải tiền tố eLocator APA; CSE viết số sau dấu hai chấm (hệ thống đánh số) hoặc sau tên tạp chí (name–year).

Một bài di truyền thật được định dạng cùng cách—đây là Watson và Crick (1953), không phải mẫu CSE Quick Guide—trông như thế này trong citation–sequence:

Bản dựng CSE 9 đã làm của một bài Nature thật

Watson JD, Crick FH. Molecular structure of nucleic acids: a structure for deoxyribose nucleic acid. Nature. 1953;171(4356):737–738. https://doi.org/10.1038/171737a0

Tìm được PDF đó trên PubMed hoặc Web of Science không khiến PubMed thành nguồn. Trích dẫn Nature. Tra viết tắt trong ISSN LTWA hoặc NLM Catalog; đừng bịa Nat. hoặc J Cell Bio. Ưu tiên DOI. Nếu bạn chỉ có PMID, tìm DOI trước khi định dạng tài liệu.

Sách và chương: thành phố xuất bản đã mất

Tài liệu sách CSE 9 bỏ thành phố mà tờ phát ấn bản 8 vẫn đòi. Các dòng này là ví dụ chính thức CSE 9, gồm hai tựa sinh học (Reiss và Ruse; Klarsfeld và Revah) và bản dịch sinh tổng hợp ty thể chính thức:

Ví dụ sách và chương chính thức CSE 9

Name-year, hai tác giả:

Reiss MJ, Ruse M. 2023. The new biology: a battle between mechanism and organicism. Harvard University Press.

Name-year trong văn:

(Reiss and Ruse 2023)

Citation-sequence, sách dịch:

Klarsfeld A, Revah F. The biology of death: origins of mortality. Brady L, translator. Cornell University Press; 2003.

Citation-sequence, dịch giả và biên tập (tựa ty thể chính thức):

Luzikov VN. Mitochondrial biogenesis and breakdown. Galkin AV, translator; Roodyn DB, editor. Consultants Bureau; 1985.

Chương citation-sequence, tác giả khác:

Geisslitz S, Scherf K. The holy grail of ancient cereals. In: Boukid F, editor. Cereal-based foodstuffs: the backbone of Mediterranean cuisine. Springer; 2021. p 269–301.

Chương citation-sequence, cùng tác giả:

Everard M. Ecosystem services: key issues. Routledge; 2017. Chapter 8, Regenerative landscapes: reversing the cycle; p 141–169.

Sách trực tuyến citation-sequence, hơn 5 biên tập viên:

Agarwal A et al, editors. Oxford handbook of clinical surgery. 5th ed. Oxford University Press; 2022. https://doi.org/10.1093/med/9780198799481.001.0001

Một giáo trình sinh học tế bào hiện hành có hơn năm tác giả vì thế bắt đầu bằng tên đầu cộng et al., và không cần «New York». Alberts, Heald, Johnson, Morgan, Raff, Roberts, và Walter là bảy tên, nên CSE 9 cắt:

Bản dựng CSE 9 của một giáo trình thật (7 tác giả, nên et al.)

Alberts B et al. Molecular biology of the cell. 7th ed. W. W. Norton & Company; 2022.

Chỉ trích dẫn một chương khi bạn đã dùng chương đó, không phải cả cuốn. Mẫu cùng-tác-giả chính thức giữ tựa sách trước, rồi nhãn chương và trang. Nếu chương có tác giả khác biên tập viên sách, dùng mẫu In: Editor, editor. của Quick Guide (Geisslitz và Scherf ở trên). Đừng trích dẫn tên tệp PDF của hiệu sách trong trường.

Còn sót: Harrison 22 không còn “Forthcoming 2026”

Quick Guide hiện hành vẫn in ấn bản 22 của Harrison như một cuốn forthcoming ghi năm 2026. McGraw Hill công bố phát hành toàn cầu ngày 20 tháng 8 năm 2025; dòng bản quyền in/eBook là 2025. Danh sách biên tập đã xuất bản bắt đầu bằng Longo, không phải Kasper. Giữ dòng forthcoming chính thức làm mẫu CSE, rồi trích dẫn cuốn bạn thực sự đã mở:

Dòng forthcoming chính thức còn sót so với ấn bản 22 đã xuất bản

Sách forthcoming citation-sequence chính thức (Quick Guide, vẫn hiện hành):

Kasper D et al. Harrison’s principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill Professional. Forthcoming 2026.

Sách forthcoming name-year chính thức:

Kasper D et al. Forthcoming 2026. Harrison’s principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill Professional.

Name-year trong văn chính thức:

(Kasper, forthcoming 2026)

Bản dựng CSE 9 của ấn bản 22 đã xuất bản (Longo trước; 8 tên, nên et al.):

Longo DL et al, editors. Harrison's principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill; 2025.

Trình tự và cơ sở dữ liệu: trích dẫn accession.version, không phải «GenBank»

Bài sinh học phân tử thất bại ở đây thường hơn ở dấu câu tạp chí. Nếu bạn đã dùng một bản ghi nucleotide hoặc protein, đối tượng là bản ghi đó. Bản cập nhật GenBank 2025 trên Nucleic Acids Research (53(D1):D56–D61) vẫn là niên giám GenBank chuyên biệt mới nhất tính đến 9 tháng 10 năm 2026; GenBank Release 273.0 (15 tháng 8 năm 2026) là một đợt phát hành dữ liệu, không phải bài trích dẫn thay thế. Bản cập nhật 2025 nêu quy tắc truy hồi được:

Sayers et al., bản cập nhật GenBank 2025, Nucleic Acids Research

the best way to cite a GenBank record in a publication is to use the full accession.version identifier for the record.

Bản dựng CSE 9 của bài NAR đó (7 tác giả, nên et al.):

Sayers EW et al. GenBank 2025 update. Nucleic Acids Res. 2025;53(D1):D56–D61. https://doi.org/10.1093/nar/gkae1114

Định danh họ đã làm là AF123456.2, không phải AF123456. Tìm accession không phiên bản chỉ trả phiên bản hiện hành, vốn có thể đã đổi từ khi bạn phân tích. Trang trích dẫn NCBI của NLM đưa mẫu bản ghi cơ sở dữ liệu (đây là lời NLM/Citing Medicine, không phải dòng Quick Guide CSE 9). Cùng trang nay cũng chỉ tới bài nguồn lực NCBI 2026 cho một trích dẫn cơ sở dữ liệu chung:

NLM, How do I cite NCBI services and databases?

Nucleotide [Internet]. Bethesda (MD): National Library of Medicine (US), National Center for Biotechnology Information; [1988] – . Accession No. NM_001349333.1, Homo sapiens FYN binding protein (FYB), transcript variant 4, mRNA; [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001349333.1

Bản dựng CSE 9 của bài nguồn lực NCBI 2026 (NAR 54(D1):D20–D27):

Sayers EW et al. Database resources of the National Center for Biotechnology Information in 2026. Nucleic Acids Res. 2025;54(D1):D20–D27. https://doi.org/10.1093/nar/gkaf1060

Thay accession, mô tả sản phẩm, và ngày cited bằng phiên bản bạn đã lấy. Đừng trích dẫn «NCBI» hoặc «GenBank» mà không có accession khi lập luận phụ thuộc vào một trình tự. Nếu bài bạn đang viết dùng GenBank như một cơ sở dữ liệu chứ không phải một bản ghi, hãy trích dẫn bản cập nhật GenBank Nucleic Acids Research hiện hành (vẫn là bài 2025 cho đến khi có bản cập nhật GenBank 2026) thay vì bịa một tài liệu trang chủ. Protein Data Bank, UniProt, và GBIF làm cùng cách: gọi tên ID bản ghi mà độc giả sau có thể mở. Trang NLM cũng bảo bạn trích dẫn BLAST từ danh mục tài liệu BLAST, không phải từ ảnh chụp hộp tìm.

Phần mềm và bài phương pháp: trích dẫn thuật toán bạn đã chạy

Một đoạn Methods nói «các trình tự được tìm bằng BLAST» mà không có tài liệu là thiếu. Trợ giúp BLAST của NCBI liệt kê các bài cần trích dẫn. Bài thuật toán 1990 có năm tác giả, nên CSE 9 liệt kê cả năm. Bài gapped-BLAST 1997 có bảy, nên CSE 9 chỉ giữ Altschul cộng et al. Sinh viên đang chạy dịch vụ web hiện hành hoặc tệp nhị phân blastn thường đang chạy BLAST+, mà bài kiến trúc là Camacho et al.—bảy tác giả, nên CSE 9 cắt. Trang trợ giúp NCBI vẫn in bài đó là 2008; bài BMC là tập 10, bài 421 (15 tháng 12 năm 2009). ElasticBLAST (2023) có năm tác giả, nên CSE 9 liệt kê cả năm. Các dòng này là bản dựng CSE 9 của các trích dẫn NCBI khuyến nghị, không phải mẫu Quick Guide:

Bản dựng CSE 9 các bài phương pháp NCBI BLAST và ImageJ

BLAST 1990 (5 tác giả, nên liệt kê tất cả):

Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990;215(3):403–410. https://doi.org/10.1016/S0022-2836(05)80360-2

Gapped BLAST / PSI-BLAST 1997 (hơn 5 tác giả):

Altschul SF et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res. 1997;25(17):3389–3402. https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389

BLAST+ (năm danh mục NCBI 2008; BMC 2009; 7 tác giả, nên et al.):

Camacho C et al. BLAST+: architecture and applications. BMC Bioinformatics. 2009;10:421. https://doi.org/10.1186/1471-2105-10-421

ElasticBLAST (5 tác giả, nên liệt kê tất cả):

Camacho C, Boratyn GM, Joukov V, Vera Alvarez R, Madden TL. ElasticBLAST: accelerating sequence search via cloud computing. BMC Bioinformatics. 2023;24(1):117. https://doi.org/10.1186/s12859-023-05245-9

ImageJ (Nature Methods; 3 tác giả):

Schneider CA, Rasband WS, Eliceiri KW. NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis. Nat Methods. 2012;9(7):671–675. https://doi.org/10.1038/nmeth.2089

Fiji, nếu đó là biến thể bạn đã chạy (trang trích dẫn ImageJ, doi:10.1038/nmeth.2019):

Schindelin J et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat Methods. 2012;9(7):676–682. https://doi.org/10.1038/nmeth.2019

Trang trích dẫn ImageJ nói rõ: trích dẫn ImageJ (doi:10.1038/nmeth.2089) cho chương trình gốc, Fiji (doi:10.1038/nmeth.2019) nếu bạn dùng Fiji, và ImageJ2 (doi:10.1186/s12859-017-1934-z) nếu bạn dùng ImageJ2. Trích dẫn phiên bản bạn đã chạy. Nếu trang đích của dự án gọi tên một trích dẫn ưu tiên (ImageJ, R, QIIME 2, FlyBase), dùng bài hoặc tài liệu phần mềm đó. Đừng bịa ngày phát hành bạn chưa từng ghi, và đừng trích dẫn «NCBI BLAST» như thể đó là bài tạp chí không có tác giả.

Bản in trước, luận văn, và bài ahead-of-print

CSE 9 thêm một mục bản in trước. Đánh dấu trạng thái trong ngoặc vuông và giữ tên máy chủ. Khi phiên bản phản biện xuất hiện, trích dẫn bài tạp chí và thôi bản in trước trừ khi bạn đang thảo luận chính bản ghi bản in trước. Mẫu chính thức của Quick Guide là Lopez Bernal et al. trên medRxiv. Bài đó không còn chỉ là bản in trước: nó xuất hiện thành Lopez Bernal et al., *N Engl J Med* 2021;385(7):585–594. Giữ dòng bản in trước chính thức làm mẫu CSE; trích dẫn bản NEJM nếu đó là bản bạn đã đọc.

Bản in trước chính thức CSE 9, phiên bản đã xuất bản còn sót, luận văn, và ahead of print

Bản in trước citation-sequence chính thức:

Lopez Bernal J et al. Effectiveness of COVID-19 vaccines against the B.1.617.2 variant [preprint]. medRxiv 2021. https://doi.org/10.1101/2021.05.22.21257658

Bản in trước name-year chính thức:

Lopez Bernal J et al. 2021. Effectiveness of COVID-19 vaccines against the B.1.617.2 variant [preprint]. medRxiv. https://doi.org/10.1101/2021.05.22.21257658

Bản dựng CSE 9 của bài NEJM sau (trích dẫn cái này nếu bạn đọc tạp chí):

Lopez Bernal J et al. Effectiveness of Covid-19 vaccines against the B.1.617.2 (Delta) variant. N Engl J Med. 2021;385(7):585–594. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2108891

Luận văn citation-sequence chính thức:

Liang S. Transport properties of topological semimetals and non-symmorphic topological insulator [dissertation]. Princeton University; 2020. https://arks.princeton.edu/ark:/88435/dsp01vm40xv52n

Ahead of print citation-sequence chính thức:

Corrigan TJ Jr, Businger S. The anatomy of a series of cloud bursts that eclipsed the US rainfall record. Mon Wea Rev. [published online ahead of print 2021 Dec 30]. https://doi.org/10.1175/MWR-D-21-0028.1

Trang web: URL CDC còn sót, và date unknown chỉ trong name–year

Trang web vẫn cần ngày xuất bản hoặc cập nhật khi có. Hai hệ thống CSE không diễn đạt quy tắc thiếu-ngày giống nhau. Citation–sequence chỉ hỏi ngày truy cập; name–year thêm cụm «date unknown». Mẫu trang có ngày chính thức vẫn là trang công bằng sức khỏe CDC. Mở ngày 9 tháng 10 năm 2026, đúng URL đó trả 404. Các chồng CDC và archive.cdc.gov giữ ảnh chụp sớm hơn; đừng dán đường 2019-ncov còn sót vào bài 2026 như thể nó hiện hành. Chép dấu câu CSE chính thức, rồi thay URL bằng trang bạn thực sự đã lấy.

CSE Citation Quick Guide, trang web

Thẻ citation-sequence / citation-name:

If no date of publication or update is available, include an access date.

Thẻ name-year:

If no date of publication is available, use “date unknown” and include an access date.

Trang web có ngày citation-sequence chính thức (CDC; URL còn sót nay 404):

Health equity considerations and racial and ethnic minority groups. US Centers for Disease Control and Prevention, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Division of Viral Diseases; 2020 Apr 30 [updated 2022 Jan 25]. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/health-equity/race-ethnicity.html

Trang web có ngày name-year chính thức:

Health equity considerations and racial and ethnic minority groups. 2020 Apr 30. US Centers for Disease Control and Prevention, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Division of Viral Diseases; [updated 2022 Jan 25]. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/health-equity/race-ethnicity.html

Name-year trong văn chính thức cho trang đó:

(Health equity . . . 2020)

Bản đồ không ngày name-year chính thức:

Montrose Point Bird Sanctuary, Chicago, Illinois. [date unknown]. Google Maps; [accessed 2022 Jan 3]. https://goo.gl/maps/GJALYGBXFZ8TSGK5A

Name-year trong văn chính thức:

(Montrose Point . . . [date unknown])

Dữ liệu chưa xuất bản ở lại trong câu, không vào danh mục tài liệu

Các nhóm thí nghiệm vẫn cố nhập «unpublished data» và chuyện hành lang thành tài liệu đánh số. CSE 9 giữ chúng ngoài danh mục cuối:

CSE Citation Quick Guide, trao đổi cá nhân

References to personal communications are placed in running text rather than as formal end references. Permission is usually required and should be acknowledged in an “Acknowledgments” or “Notes” section at the end of the document.

. . . local and systemic reactions were expected to be stronger after the second dose (2022 letter from TD Perez to author; unreferenced, see “Notes”) . . .

Not all forthcoming or unpublished sources are suitable for inclusion in reference lists. Check with your publisher if in doubt.

Viết (A. Johnson, unpublished data, 2026) trong câu nếu giảng viên cho phép. Đừng bịa một tài liệu cuối đánh số cho một trang sổ mà không ai khác truy hồi được. Nếu dữ liệu sau đó xuất hiện trong bài, luận văn, hoặc bản ghi GenBank, hãy trích dẫn đối tượng có thể truy hồi đó.

Tên phân loại là văn xuôi, không phải hệ thống trích dẫn thứ tư bí mật

Trong văn chảy, in nghiêng danh pháp hai phần: Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Homo sapiens. Sau lần nhắc đầu, nhiều tạp chí sinh học chấp nhận chi viết tắt (D. melanogaster). Thẩm quyền mô tả—Meigen, 1830 cho ruồi giấm đó—là danh pháp phân loại. Đó không phải tài liệu cuối CSE trừ khi bạn thực sự đọc và trích dẫn bài mô tả gốc. Đừng biến Meigen, 1830 thành một bài tạp chí giả, và đừng in nghiêng thẩm quyền.

Ký hiệu gen và protein theo cơ quan danh pháp của sinh vật (HGNC cho gen người, FlyBase, SGD, v.v.), không phải Chương 29 CSE. CSE bảo bạn cách trích dẫn bài hoặc bản ghi cơ sở dữ liệu; kiểu ký hiệu đến từ ngành.

CSE, APA, Vancouver, hay kiểu nhà của tạp chí?

Sinh học trong trường không phải một kiểu. Trang ngành kiểu trích dẫn sinh học là khảo sát; bảng này là quyết định bạn đưa cho một bài tập:

Khớp nơi nhận bài. Đừng nhập ngoặc APA vào danh mục đánh số CSE.
Nếu tài liệu nói…	Dùng	Đừng dùng
CSE, CBE, Scientific Style and Format, hoặc Council of Science Editors	CSE (một trong ba hệ thống)	Dấu câu tác giả–ngày APA, hoặc (1) của Vancouver như thể đó là CSE
APA, phương pháp tâm lý, hoặc tạp chí giáo dục sinh học gọi tên APA	APA	CSE name–year. Chúng trông họ hàng và không phải cùng một danh mục
ICMJE, Uniform Requirements, NLM, hoặc Vancouver	Vancouver hoặc hướng dẫn trích dẫn y khoa	Ngưỡng et al. 5 tác giả của CSE 9 hoặc ngoặc name–year
Hướng dẫn tác giả Nature, Cell, Science, hoặc PLOS	Kiểu nhà của tạp chí đó	Một «kiểu sinh học» chung mà bạn bịa từ trang này

Science và PNAS là các tạp chí CSE 9 trích dẫn làm mẫu cho ngưỡng tác giả mới; Hướng dẫn dành cho tác giả của chính họ vẫn quản bản thảo gửi tới đó. Một bài PLOS ONE dùng kiểu đánh số giống Vancouver của PLOS, không phải danh mục name–year CSE. Khi đề cương im lặng, hãy hỏi. Rồi khóa một hệ thống trước khi bạn định dạng tài liệu đầu.

Các kiểu thất bại mà sinh viên sinh học thực sự gặp

Trộn hệ thống. Số 7 trong văn không thể trỏ tới một danh mục name–year alphabet. Chọn một hệ thống và dùng lại ở mọi chú thích hình.
Dùng ngưỡng 10 tác giả ấn bản 8. CSE 9 liệt kê nhiều nhất 5 tên, rồi tác giả đầu + et al. Một tài liệu Molecular Biology of the Cell 7 tác giả là Alberts B et al., không phải bảy họ. Dòng Pizzi 10 tác giả còn sót vẫn còn trên Quick Guide ấn bản 8.
Bịa viết tắt tạp chí. J. Cell. Biol. với dấu chấm thừa không phải viết tắt CSE. Dùng ISSN LTWA hoặc NLM Catalog.
Trích dẫn cơ sở dữ liệu đã tìm ra PDF. PubMed, JSTOR, và proxy trong trường là đường tìm. Nguồn là bài tạp chí.
Để thành phố trên mọi cuốn sách. CSE 9 đã bỏ nơi xuất bản. New York: W. W. Norton & Company; 2022 là mẫu cũ.
Đóng dấu ngày truy cập lên mọi DOI. Ngày truy cập chỉ còn khi không xác định được ngày xuất bản, bản quyền, hoặc sửa đổi.
Chép URL CDC 2019-ncov còn sót. Ví dụ trang web CSE chính thức vẫn in đường đó; mở ngày 9 tháng 10 năm 2026 nó trả 404. Trích dẫn trang bạn thực sự đã mở.
Chép “Forthcoming 2026” cho Harrison 22. McGraw Hill phát hành ấn bản 22 năm 2025, với Longo liệt kê trước.
Trích dẫn dòng medRxiv Lopez Bernal sau khi bạn đã đọc NEJM. Bản in trước Quick Guide là mẫu. Bài tạp chí là N Engl J Med. 2021;385(7):585–594.
Quên rằng trang web name–year nói date unknown. Thẻ citation–sequence chỉ hỏi ngày truy cập. Thẻ name–year thêm [date unknown].
Xử lý số bài như eLocator APA. CSE chính thức viết Adv Meteorol. 2020:8874869 (đánh số) hoặc Adv Meteorol. 8874869 (name–year).
Viết lập luận trình tự mà không có accession.version. AF123456 chưa đủ; AF123456.2 là đối tượng có thể trích dẫn. GenBank Release 273.0 là một bản đổ, không phải một trích dẫn.
Trích dẫn BLAST 1990 cho một tìm kiếm BLAST+. Danh mục trợ giúp hiện hành của NCBI gồm Camacho BLAST+ (BMC Bioinformatics 10:421) và ElasticBLAST 2023.
Trích dẫn ImageJ khi bạn đã chạy Fiji. Trang trích dẫn ImageJ muốn Schneider 2012 cho ImageJ và Schindelin 2012 cho Fiji.
Đưa dữ liệu chưa xuất bản vào danh mục đánh số. Trao đổi cá nhân và kết quả sổ tay ở lại trong câu.
Định dạng danh pháp hai phần như thể đó là tài liệu. D. melanogaster là văn xuôi. Bài bạn đọc về ruồi đó mới là trích dẫn.
Trích dẫn bài tổng quan cho một kết quả thí nghiệm cụ thể. Dùng bài phương pháp hoặc kết quả gốc khi lập luận về thí nghiệm đó.
Bỏ phần mềm, gói, hoặc giao thức đã xuất bản. Trích dẫn phiên bản bạn đã chạy từ trích dẫn khuyến nghị của dự án hoặc bài phương pháp. Đừng bịa một bản phát hành bạn chưa từng dùng.

Định dạng bản ghi bạn thực sự đã bắt

Một bộ tạo chỉ có thể áp dấu câu CSE lên siêu dữ liệu bạn đã lưu. Nó không thể bịa số phát hành, viết tắt ISSN, hoặc phiên bản trình tự. Khóa hệ thống trong văn trước, rồi định dạng từ một bản ghi đầy đủ—DOI, PMID, hoặc trường thủ công—trong bộ tạo trích dẫn CSE.

Tạo trích dẫn CSE cho bài sinh học

Dùng citation–sequence, citation–name, hoặc name–year một cách nhất quán. Tìm theo DOI hoặc PubMed ID, hoặc nhập nguồn bạn thực sự đã mở. Bộ tạo sẽ không bịa hậu tố phiên bản GenBank bạn chưa từng ghi.

Thử bộ tạo trích dẫn CSE →

Câu hỏi trích dẫn CSE sinh học

CSE có giống CBE không?: Có, về lịch sử. Council of Biology Editors trở thành Council of Science Editors. Tờ phát trong trường vẫn nói CBE. Sách hiện hành là The CSE Manual, ấn bản 9 (2024). Đừng theo bản photocopy CBE ấn bản 6—hoặc Quick Guide ấn bản 8 còn sót vẫn liệt kê 10 tác giả đầu—cho ngưỡng tác giả, thành phố, hoặc ngày truy cập.
Báo cáo thí nghiệm sinh học nên dùng hệ thống CSE nào?: Hệ thống giảng viên đã gọi tên. Nếu tờ nói «CSE đánh số», đó là citation–sequence trừ khi nó cũng bảo xếp alphabet danh mục trước (citation–name). Các học phần sinh thái và sinh vật thường muốn name–year. Đừng đoán từ một bài phương pháp bạn thích.
CSE 9 liệt kê bao nhiêu tác giả trước et al.?: Năm. Một công trình có 6 tác giả trở lên liệt kê tác giả đầu cộng et al. ở tài liệu cuối. Trích dẫn trong văn name-year đã dùng tác giả đầu cộng et al cho 3 tác giả trở lên. Quy tắc «10 đầu» của ấn bản 8 đã thôi; dòng Pizzi Anticancer Res. trên Quick Guide cũ là còn sót.
Tôi có in nghiêng tên tạp chí trong CSE không?: Không. Tài liệu cuối CSE đặt tên tạp chí kiểu đứng và viết tắt chúng. In nghiêng thuộc về danh pháp hai phần trong văn chảy (Homo sapiens) và vài trường hợp tiêu đề đặc biệt, không phải J Cell Biol trong danh mục tài liệu.
Làm sao trích dẫn một trình tự GenBank hoặc RefSeq trong CSE?: Đặt accession.version đầy đủ vào bài (AF123456.2, NM_001349333.1). Với tài liệu cuối chính thức, theo mẫu bản ghi cơ sở Nucleotide của NLM: cơ sở dữ liệu, tổ chức, mã truy cập, mô tả sản phẩm, ngày trích dẫn, và URL. Đừng trích dẫn «GenBank» mà không có định danh, và đừng trích dẫn Release 273.0 như thể đó là trình tự.
Làm sao trích dẫn BLAST hoặc ImageJ trong CSE?: Trích dẫn bài phương pháp mà NCBI hoặc dự án gọi tên. BLAST 1990 có năm tác giả, nên CSE 9 liệt kê Altschul, Gish, Miller, Myers, và Lipman. BLAST web hiện hành là BLAST+; trích dẫn Camacho et al., BMC Bioinformatics 2009;10:421. ImageJ là Schneider, Rasband, và Eliceiri, Nat Methods 2012. Nếu bạn đã chạy Fiji, trích dẫn Schindelin 2012 thay thế. Đừng trích dẫn thẻ trình duyệt.
Làm sao trích dẫn bài eLife hoặc PLOS có số thay vì trang?: Đặt số bài vào ô vị trí của CSE. Mẫu chính thức của Quick Guide là Liu et al., Adv Meteorol. 2020:8874869 (citation-sequence) hoặc Adv Meteorol. 8874869 (name-year). Đừng nhập tiền tố Article eLocator của APA.
Tôi nên trích dẫn bioRxiv hay bài đã xuất bản?: Trích dẫn phiên bản bạn đã dùng. Nếu bài nay đã ở tạp chí, trích dẫn tạp chí và DOI. Chỉ giữ bản in trước khi bạn đang thảo luận bản in trước đó. Ví dụ chính thức của CSE 9 là Lopez Bernal et al. trên medRxiv, gắn [preprint]; bài đó sau xuất hiện thành N Engl J Med. 2021;385(7):585–594.
Name-year CSE có giống APA 7 không?: Không. Cả hai đặt một tên và một năm vào câu. APA dùng dấu phẩy, dấu &, tiêu đề bài kiểu câu với tạp chí-và-tập in nghiêng, và ngưỡng 20 tác giả. CSE name-year dùng (Fauci and Lane 2020), tên tạp chí đứng viết tắt, năm ngay sau tác giả trong danh mục, và ngưỡng 5 tác giả. Xem APA so với CSE.
CSE vẫn cần thành phố cho Norton hoặc Springer không?: Không trong ấn bản 9. Ghi chú Science Editor của Olson và Quick Guide đều bỏ nơi xuất bản vì nhà xuất bản có nhiều địa điểm và tác phẩm tìm được mà không cần thành phố. Một dòng «New York (NY):» của ấn bản 8 đã lỗi thời cho bài CSE năm 2026.