CSE, CBE ile aynı mıdır?

Tarihsel olarak evet. Council of Biology Editors, Council of Science Editors oldu. Kampüs el ilanları hâlâ CBE der. Güncel kitap The CSE Manual, 9. baskıdır (2024). Yazar eşikleri, kentler veya erişim tarihleri için 6. baskı bir CBE fotokopisini—ya da hâlâ ilk 10 yazarı listeleyen artakalan 8. baskı Quick Guide’ı—izlemeyin.

Bir biyoloji laboratuvar raporu hangi CSE sistemini kullanmalıdır?

Öğretim görevlisinin adlandırdığı sistemi. Sayfa «numaralı CSE» diyorsa, listeyi önce alfabetikleştirin demiyorsa (citation–name) bu citation–sequence’dir. Ekoloji ve organizma dersleri çoğu zaman name–year ister. Beğendiğiniz bir yöntem makalesinden tahmin etmeyin.

CSE 9, et al. öncesi kaç yazar listeler?

Beş. 6 veya daha fazla yazarlı bir eser son kaynakta ilk yazarı artı et al. listeler. Name-year metin içi alıntılar 3 veya daha fazla yazar için zaten ilk yazar artı et al kullanır. 8. baskının «ilk 10» kuralı emeklidir; eski Quick Guide’daki Pizzi Anticancer Res. satırı artakalardır.

CSE’de dergi adlarını italik yapar mıyım?

Hayır. CSE son kaynakları dergi başlıklarını dik yazıya koyar ve kısaltır. İtalik, akan metindeki binomenlere (Homo sapiens) ve birkaç özel başlık durumuna aittir; kaynakçadaki J Cell Biol’e değil.

CSE’de bir GenBank veya RefSeq dizisini nasıl kaynak gösteririm?

Makaleye tam accession.version’ı koyun (AF123456.2, NM_001349333.1). Biçimsel bir son kaynak için NLM’nin Nucleotide veritabanı kaydı kalıbını izleyin: veritabanı, kuruluş, erişim numarası, ürün açıklaması, anılma tarihi ve URL. Tanımlayıcısız «GenBank» kaynak göstermeyin ve Release 273.0’ı diziymiş gibi kaynak göstermeyin.

CSE’de BLAST veya ImageJ nasıl kaynak gösterilir?

NCBI’nin veya projenin adlandırdığı yöntem makalesini kaynak gösterin. BLAST 1990’ın beş yazarı vardır, bu yüzden CSE 9 Altschul, Gish, Miller, Myers ve Lipman’ı listeler. Yürürlükteki web BLAST BLAST+’tır; Camacho et al., BMC Bioinformatics 2009;10:421 kaynak gösterin. ImageJ Schneider, Rasband ve Eliceiri’dir, Nat Methods 2012. Fiji çalıştırdıysanız onun yerine Schindelin 2012 kaynak gösterin. Tarayıcı sekmesini kaynak göstermeyin.

Sayfa yerine numarası olan bir eLife veya PLOS makalesini nasıl kaynak gösteririm?

Makale numarasını CSE’nin konum yuvasına koyun. Resmi Quick Guide örneği Liu et al., Adv Meteorol. 2020:8874869 (citation-sequence) veya Adv Meteorol. 8874869 (name-year)’dır. APA’nın Article eLocator önekini taşımayın.

bioRxiv’i mi yoksa yayımlanmış makaleyi mi kaynak göstermelidir?

Kullandığınız sürümü kaynak gösterin. Makale artık bir dergideyse dergiyi ve DOI’yi kaynak gösterin. Ön baskıyı yalnızca o ön baskıyı tartışırken tutun. CSE 9’un resmi örneği medRxiv’deki Lopez Bernal et al.’dır, [preprint] etiketli; o makale sonra N Engl J Med. 2021;385(7):585–594 olarak çıktı.

Name-year CSE, APA 7 ile aynı mıdır?

Hayır. İkisi de cümleye bir ad ve bir yıl koyar. APA virgül, ve işareti, italik dergi-ve-ciltle cümle düzeni makale başlıkları ve 20 yazar eşiği kullanır. CSE name-year (Fauci and Lane 2020), kısaltılmış dik dergi başlıkları, listede yazarların hemen ardından yıl ve 5 yazar eşiği kullanır. APA ile CSE’ye bakın.

CSE hâlâ Norton veya Springer için kenti ister mi?

9. baskıda hayır. Olson’ın Science Editor notu ve Quick Guide, yayımcıların birden çok yeri olduğu ve eserin kent olmadan bulunabildiği için yayın yerini kaldırır. 8. baskı bir «New York (NY):» satırı 2026 tarihli bir CSE ödevi için eskidir.

Biyoloji Kaynakları CSE Stilinde Nasıl Gösterilir (CSE Manual 9. baskı) [2026]

Kısa yanıt: biyoloji kaynakları CSE’de nasıl gösterilir

Önce izlenceyi veya derginin Yazarlar için Yönergeler belgesini açın. O belge The CSE Manual, Scientific Style and Format, CBE veya Council of Science Editors dediğinde CSE kullanın. Tüm ödev için tek sistem seçin: citation–sequence, citation–name veya name–year. Numaralı listeler özgün numarayı yeniden kullanır; name–year listeleri alfabetiktir. Dergi kaynakları önce yazarları (soyadı, sonra baş harfler, nokta yok) koyar, sonra cümle düzeninde makale başlığını, ISSN List of Title Word Abbreviations ile kısaltılmış dergiyi, yılı, cildi, sayıyı, sayfaları veya makale numarasını ve bir DOI varsa https://doi.org/ bağlantısını.

Resmi CSE 9 şablonları ve ilk işlenmiş satırlar

Citation-sequence / citation-name dergi şablonu:

Author(s). Article title. Journal title. Date;volume(issue):location. URL

Name-year dergi şablonu:

Author(s). Date. Article title. Journal title. Volume(issue):location. URL

Citation-sequence kitap şablonu:

Author(s). Title. Edition. Publisher; year of publication.

Name-year kitap şablonu:

Author(s). Date. Title. Edition. Publisher.

Resmi citation-sequence dergi:

Haasnoot M, Lawrence J, Magnan AK. Pathways to coastal retreat. Science. 2021;372(6548):1287–1290. https://doi.org/10.1126/science.abi6594

Resmi name-year dergi:

Fauci AS, Lane HC. 2020. Four decades of HIV/AIDS—much accomplished, much to do. N Engl J Med. 383(1):1–4. https://doi.org/10.1056/NEJMp1916753

Resmi name-year metin içi (iki yazar):

(Fauci and Lane 2020)

Cümle içinde citation-sequence:

Kıyı uyum yolları zaten kullanılıyor.¹

Quick Guide, üç sistem kuralını «yalnızca CSE kullan» diyen bir öğretim üyesine götürebileceğiniz tek cümlede dile getirir:

CSE Citation Quick Guide, 9. baskı (9 Ekim 2026’da açıldı)

The CSE Manual presents 3 systems for referring to references (also known as citations) within the text of a journal article, book, or other scientific publication: (1) citation–sequence, (2) name–year, and (3) citation–name.

A DOI-based URL (which starts with https://doi.org/), when available, should be preferred to any other form of URL.

For articles with more than 5 authors, list the first author followed by “et al.”

Journal titles are generally abbreviated according to the List of Title Word Abbreviations maintained by the ISSN International Centre.

Bu rehber neyi kapsar—ve neyi kapsamaz

Zor kısım biyoloji nesnesi olduğunda bu sayfayı kullanın: onu bulan PubMed kaydına karşı bir Nature makalesi, onu yatıran makaleye karşı bir GenBank accession.version, Altschul 1990 algoritma makalesine karşı bir BLAST+ araması, sonraki dergi makalesine karşı bir bioRxiv ön baskısı veya protokol kitabına karşı bir laboratuvar raporu yöntem alıntısı. CSE ile APA arasında mekân-öncelikli seçim için APA ile CSE veya hangi kaynak gösterme stili kullanın. Yakındaki numaralı stiller CSE değildir: tıbbi alıntı AMA 11 ve Vancouver/NLM’yi; kimya alıntısı ACS’yi kapsar. Tek kaynaklı bir yürüyüş için CSE’de bir dergi makalesi nasıl kaynak gösterilir bakın.

Yürürlükteki yetke The CSE Manual, 9. baskıdır; bir CBE fotokopisi değil

Bölümler hâlâ «CBE stili» veya «CSE 8. baskı» der. Kastettikleri The CSE Manual’dır; Scientific Style and Format, 8. baskının (2014) 2024 halefidir. Konsey, kullanıcılar kitabı zaten CSE kılavuzu diye andığı için kitabı yeniden adlandırdı. Kaynaklar Bölüm 29’dadır. Quick Guide kamuya açık örnek kümesidir; Ek 29.1 dergi başlığı kısaltmalarını kapsar. CSE kılavuzun kendisini şöyle kaynak gösterir:

Resmi CSE Manual ana sayfa alıntısı (csemanual.org, 9 Ekim 2026’da açıldı)

Council of Science Editors, Style Manual Task Force. The CSE manual: scientific style and format for authors, editors, and publishers. 9th ed. Council of Science Editors in cooperation with The University of Chicago Press; 2024. https://doi.org/10.7208/cse9

Bölüm 29 editörlerinden Peter J. Olson, 9. baskı eşiklerini Science Editor’da yeniden dile getirdi (Mart 2024; HTML makale 403 döndürdükten sonra bu yeniden yazım için Mart 2024 PDF’i açıldı):

Science Editor, Peter J. Olson CSE 9 Bölüm 29 üzerine

As of the ninth edition, the maximum number of authors listed is 5, and references with 6 or more authors should list only the first author followed by “et al.”

Additionally, access dates for online sources are now required only when the date of publication, copyright, or revision cannot be determined, and publisher locations are no longer needed (partly because this information has become less relevant, but also because many book publishers have multiple locations).

8. baskı çevrimiçi Quick Guide hâlâ scientificstyleandformat.org adresinde barındırılır. Hâlâ emekli 10 yazar eşiğini öğretir. Örneklerini 9. baskı bir ödevle karıştırmayın:

Artakalan 8. baskı Quick Guide (hâlâ yayında; CSE 9’a kopyalamayın)

8. baskı yazar eşiği (emekli):

For articles with more than 10 authors, list the first 10 followed by “et al.”

8. baskı 10 yazar örneği (Pizzi):

Pizzi C, Caraglia M, Cianciulli M, Fabbrocini A, Libroia A, Matano E, Contegiacomo A, Del Prete S, Abbruzzese A, Martignetti A, et al. Low-dose recombinant IL-2 induces psychological changes: monitoring by Minnesota Multiphasic Personality Inventory (MMPI). Anticancer Res. 2002;22(2A):727–732.

İlk 10 yazarı listeleyen, Springer için bir kent isteyen ve her DOI’ye erişim tarihi basan sekizinci baskı sınıf föyleri eski kitabı öğretir.

Üç CSE sistemi birbirinin yerine geçen ev stilleri değildir

Son kaynak noktalaması üç sistemde neredeyse aynıdır. Fark, metin içi işaretin nasıl işlediği ve listenin nasıl sıralandığıdır. Quick Guide, numaralı çiftin liste sırası dışında özdeş olduğunu söyler:

CSE Citation Quick Guide, numaralı sistemler üzerine

These 2 systems are identical except for the order in which the end references are listed. In both systems, numbers within the text refer to the end references.

In the citation–sequence system, the end references are listed in the sequence in which they first appear within the text. For example, if a reference by Smith is the first one mentioned in the text, then the complete reference to the Smith work will be number 1 in the end references. The same number is used for subsequent in-text references to the same document.

In the citation–name system, the end references are listed alphabetically by the first author’s surname. Multiple works by the same author are listed alphabetically by title.

İzlencenin veya derginin adlandırdığı sistemi seçin. Bir ödevde karıştırmayın.
Sistem	Metin içi işaret	Son liste sırası	Yaygın biyoloji kullanımı
Citation–sequence	İlk anılışta numara; o numarayı yeniden kullanın	İlk görünüş sırası	Birçok laboratuvar raporu ve bazı yaşam bilimi dergileri
Citation–name	Liste alfabetikleştirildikten sonra atanan numara	İlk yazara, sonra başlığa göre alfabetik	Kampüste daha az yaygın; yine de bir CSE seçeneği
Name–year	(Soyadı Yıl); iki yazar and ile birleşir	Alfabetik, numarasız; yıl yazarlardan sonra	Ekoloji, evrim ve birçok organizma dergisi

Quick Guide numaralı işareti üst simgeye karşı paranteze kilitlemez. Dergiler ve öğretim üyeleri kilitler. Noktadan sonra üst simge ¹ isteyen bir kampüs laboratuvarı hâlâ CSE citation–sequence’dir; (1) isteyen bir ICMJE tıp makalesi, son kaynak benzer görünse bile Vancouver’dır, CSE değil.

Dergi makaleleri: resmi CSE 9 örnekleri

Quick Guide’ın dergi şablonları yukarıdaki kutudadır. Dergi başlıkları kısaltılır. İki yazarda son kaynak virgül kullanır, name–year metin içi işareti and kullanır. Resmi örneklerde name–year metin içi et al noktasızdır. Bu satırlar resmi CSE 9 örnekleridir, uydurulmuş hücre biyolojisi makaleleri değil:

Resmi CSE 9 dergi örnekleri

Citation-sequence, üç yazar:

Haasnoot M, Lawrence J, Magnan AK. Pathways to coastal retreat. Science. 2021;372(6548):1287–1290. https://doi.org/10.1126/science.abi6594

Citation-sequence, 5’ten fazla yazar:

Ashraf M et al. Interaction between the distribution of diabetic retinopathy lesions and the association of optical coherence tomography angiography scans with diabetic retinopathy severity. JAMA Ophthalmol. 2020;138(12):1291–1297. https://doi.org/10.1001/jamaophthalmol.2020.4516

Name-year, iki yazar:

Fauci AS, Lane HC. 2020. Four decades of HIV/AIDS—much accomplished, much to do. N Engl J Med. 383(1):1–4. https://doi.org/10.1056/NEJMp1916753

Name-year metin içi, iki yazar:

(Fauci and Lane 2020)

Name-year metin içi, üç veya daha fazla:

(Haasnoot et al 2021)

Name-year yazar eşiği (Quick Guide):

For articles with 3 to 5 authors, list all authors in the end reference; for articles with more than 5 authors, list the first author followed by “et al.” In either case, list only the first author followed by “et al” in the in-text reference.

Sayı sayfalandırmasını makale numaraları için bırakan biyoloji dergileri aynı konum yuvasını kullanır. Resmi Quick Guide örneği hidrolojidir, sahte bir eLife makalesi değil; eLife, PLOS Biology ve PeerJ makale numarasını CSE’nin location koyduğu yere koymayı sürdürür. Aynı bölüm ayrıca sayısız bir cilt ve bir ek gösterir:

Resmi CSE 9 makale numarası, sayı yok, ek ve aynı yıl çifti

Citation-sequence, makale numarası ve cilt yok:

Liu L, Bai P, Liu C, Tian W, Liang K. Changes in extreme precipitation in the Mekong Basin. Adv Meteorol. 2020:8874869. https://doi.org/10.1155/2020/8874869

Name-year, makale numarası:

Liu L, Bai P, Liu C, Tian W, Liang K. 2020. Changes in extreme precipitation in the Mekong Basin. Adv Meteorol. 8874869. https://doi.org/10.1155/2020/8874869

Resmi citation-sequence, cilt ve sayı yok:

Kim KY, Kim BS. The effect of regional warming on the East Asian summer monsoon. Clim Dyn. 2020;54:3259–3277. https://doi.org/10.1007/s00382-020-05169-7

Resmi citation-sequence, sayı artı ek:

Yohannes AM, Kaplan A, Hanania NA. Anxiety and depression in chronic obstructive pulmonary disease: recognition and management. Cleve Clin J Med. 2018;85(2 Suppl 1):S11–S18. https://doi.org/10.3949/ccjm.85.s1.03

Name-year aynı yazarlar, aynı yıl (resmi 2020a):

Lee SMC et al. 2020a. Arterial structure and function during and after long-duration spaceflight. J Appl Physiol. 129(1):108–123. https://doi.org/10.1152/japplphysiol.00550.2019

Name-year aynı yazarlar, aynı yıl (resmi 2020b):

Lee SMC et al. 2020b. Efficacy of gradient compression garments in the hours after long-duration spaceflight. Front Physiol. 11:784. https://doi.org/10.3389/fphys.2020.00784

Name-year metin içi, her iki eser:

(Lee et al 2020a, 2020b)

Öğrencilerin hâlâ yanlış yaptığı 9. baskı ayrıntılarına dikkat edin. Baş harflerde nokta ve boşluk yoktur (Fauci AS, Fauci, A. S. değil). Makale başlığı cümle düzenindedir. DOI URL’sinden sonra ekstra nokta yoktur. Aynı yazarların aynı yıl eserleri 2020a ve 2020b alır. Bir makale numarası APA eLocator öneki değildir; CSE numarayı iki noktadan sonra (numaralı sistemler) veya dergi başlığından sonra (name–year) yazar.

Aynı biçimde biçimlendirilmiş gerçek bir genetik makalesi—bu Watson ve Crick (1953)’tür, bir CSE Quick Guide örneği değil—citation–sequence’de şöyle görünür:

Gerçek bir Nature makalesinin işlenmiş CSE 9 sunumu

Watson JD, Crick FH. Molecular structure of nucleic acids: a structure for deoxyribose nucleic acid. Nature. 1953;171(4356):737–738. https://doi.org/10.1038/171737a0

O PDF’yi PubMed veya Web of Science’ta bulmak PubMed’i kaynak yapmaz. Nature’ı kaynak gösterin. Kısaltmayı ISSN LTWA veya NLM Catalog’da arayın; Nat. veya J Cell Bio. uydurmayın. DOI’yi yeğleyin. Yalnızca bir PMID’niz varsa kaynağı biçimlendirmeden önce DOI’yi bulun.

Kitaplar ve bölümler: yayın kenti kalktı

CSE 9 kitap kaynakları, 8. baskı el ilanlarının hâlâ istediği kenti düşürür. Bu satırlar resmi CSE 9 örnekleridir; iki biyoloji başlığı (Reiss ve Ruse; Klarsfeld ve Revah) ve resmi mitokondriyal biyogenez çevirisi dâhildir:

Resmi CSE 9 kitap ve bölüm örnekleri

Name-year, iki yazar:

Reiss MJ, Ruse M. 2023. The new biology: a battle between mechanism and organicism. Harvard University Press.

Name-year metin içi:

(Reiss and Ruse 2023)

Citation-sequence, çevrilmiş kitap:

Klarsfeld A, Revah F. The biology of death: origins of mortality. Brady L, translator. Cornell University Press; 2003.

Citation-sequence, çevirmen ve editör (resmi mitokondriyal başlık):

Luzikov VN. Mitochondrial biogenesis and breakdown. Galkin AV, translator; Roodyn DB, editor. Consultants Bureau; 1985.

Citation-sequence bölüm, farklı yazarlar:

Geisslitz S, Scherf K. The holy grail of ancient cereals. In: Boukid F, editor. Cereal-based foodstuffs: the backbone of Mediterranean cuisine. Springer; 2021. p 269–301.

Citation-sequence bölüm, aynı yazar:

Everard M. Ecosystem services: key issues. Routledge; 2017. Chapter 8, Regenerative landscapes: reversing the cycle; p 141–169.

Citation-sequence çevrimiçi kitap, 5’ten fazla editör:

Agarwal A et al, editors. Oxford handbook of clinical surgery. 5th ed. Oxford University Press; 2022. https://doi.org/10.1093/med/9780198799481.001.0001

Beşten fazla yazarlı güncel bir hücre biyolojisi ders kitabı bu yüzden ilk ad artı et al. ile başlar ve «New York» gerekmez. Alberts, Heald, Johnson, Morgan, Raff, Roberts ve Walter yedi addır, bu yüzden CSE 9 kısaltır:

Gerçek bir ders kitabının CSE 9 sunumu (7 yazar, bu yüzden et al.)

Alberts B et al. Molecular biology of the cell. 7th ed. W. W. Norton & Company; 2022.

Bir bölümü yalnızca o bölümü kullandığınızda kaynak gösterin, bütün kitabı değil. Resmi aynı-yazar kalıbı önce kitap başlığını, sonra bölüm etiketini ve sayfaları tutar. Bölümün yazarları kitap editörlerinden farklıysa Quick Guide’ın In: Editor, editor. kalıbını kullanın (yukarıda Geisslitz ve Scherf). Kampüs kitabevi PDF dosya adını kaynak göstermeyin.

Artakalan: Harrison 22 artık “Forthcoming 2026” değil

Yayındaki Quick Guide Harrison’ın 22. baskısını hâlâ 2026 tarihli forthcoming bir kitap olarak basar. McGraw Hill küresel çıkışı 20 Ağustos 2025’te duyurdu; basılı/eKitap telif satırı 2025’tir. Yayımlanmış editör listesi Kasper değil Longo ile başlar. Resmi forthcoming satırını bir CSE şablonu olarak tutun, sonra gerçekten açtığınız kitabı kaynak gösterin:

Resmi artakalan forthcoming satır versus yayımlanmış 22. baskı

Resmi citation-sequence forthcoming kitap (Quick Guide, hâlâ yayında):

Kasper D et al. Harrison’s principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill Professional. Forthcoming 2026.

Resmi name-year forthcoming kitap:

Kasper D et al. Forthcoming 2026. Harrison’s principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill Professional.

Resmi name-year metin içi:

(Kasper, forthcoming 2026)

Yayımlanmış 22. baskının CSE 9 sunumu (önce Longo; 8 ad, bu yüzden et al.):

Longo DL et al, editors. Harrison's principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill; 2025.

Diziler ve veritabanları: «GenBank» değil, accession.version’ı kaynak gösterin

Moleküler biyoloji makaleleri burada dergi noktalamasından daha sık düşer. Bir nükleotit veya protein kaydı kullandıysanız nesne o kayıttır. Nucleic Acids Research’teki GenBank 2025 güncellemesi (53(D1):D56–D61) 9 Ekim 2026 itibarıyla hâlâ en son ayrılmış GenBank yıllığıdır; GenBank Release 273.0 (15 Ağustos 2026) bir veri sürümüdür, yerine geçen bir alıntı makalesi değil. 2025 güncellemesi geri bulunabilirlik kuralını dile getirir:

Sayers et al., GenBank 2025 güncellemesi, Nucleic Acids Research

the best way to cite a GenBank record in a publication is to use the full accession.version identifier for the record.

O NAR makalesinin CSE 9 sunumu (7 yazar, bu yüzden et al.):

Sayers EW et al. GenBank 2025 update. Nucleic Acids Res. 2025;53(D1):D56–D61. https://doi.org/10.1093/nar/gkae1114

İşledikleri tanımlayıcı AF123456.2’dir, AF123456 değil. Sürümsüz erişim numarasını aramak yalnızca geçerli sürümü döndürür; analiz ettiğinizden beri değişmiş olabilir. NLM’nin NCBI alıntı sayfası veritabanı kaydı kalıbını verir (bu NLM/Citing Medicine sözüdür, bir CSE 9 Quick Guide satırı değil). Aynı sayfa artık genel bir veritabanı alıntısı için 2026 NCBI kaynakları makalesine de işaret eder:

NLM, How do I cite NCBI services and databases?

Nucleotide [Internet]. Bethesda (MD): National Library of Medicine (US), National Center for Biotechnology Information; [1988] – . Accession No. NM_001349333.1, Homo sapiens FYN binding protein (FYB), transcript variant 4, mRNA; [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001349333.1

2026 NCBI kaynakları makalesinin CSE 9 sunumu (NAR 54(D1):D20–D27):

Sayers EW et al. Database resources of the National Center for Biotechnology Information in 2026. Nucleic Acids Res. 2025;54(D1):D20–D27. https://doi.org/10.1093/nar/gkaf1060

Erişim numarasını, ürün açıklamasını ve anılma tarihini aldığınız sürümle değiştirin. İddia bir diziye dayanıyorsa tanımsız «NCBI» veya «GenBank» kaynak göstermeyin. Yazdığınız makale GenBank’i tek kayıt değil bir veritabanı olarak kullandıysa, bir ana sayfa kaynağı uydurmak yerine yürürlükteki GenBank Nucleic Acids Research güncellemesini kaynak gösterin (2026 bir GenBank güncellemesi çıkana dek hâlâ 2025 makalesi). Protein Data Bank, UniProt ve GBIF aynı biçimde işler: sonraki bir okurun açabileceği kayıt kimliğini adlandırın. NLM sayfası ayrıca BLAST’i arama kutusunun ekran görüntüsünden değil BLAST kaynak listesinden kaynak göstermenizi söyler.

Yazılım ve yöntem makaleleri: çalıştırdığınız algoritmayı kaynak gösterin

«Diziler BLAST ile arandı» deyip kaynak vermeyen bir Methods paragrafı eksiktir. NCBI’nin BLAST yardımı alıntılanacak makaleleri listeler. 1990 algoritma makalesinin beş yazarı vardır, bu yüzden CSE 9 beşini de listeler. 1997 gapped-BLAST makalesinin yedi yazarı vardır, bu yüzden CSE 9 yalnızca Altschul artı et al. tutar. Yürürlükteki web hizmetini veya blastn ikilisini çalıştıran öğrenciler genellikle BLAST+ çalıştırır; mimari makalesi Camacho et al.’dır—yedi yazar, bu yüzden CSE 9 kısaltır. NCBI’nin yardım sayfası o makaleyi hâlâ 2008 diye basar; BMC makalesi cilt 10, makale 421’dir (15 Aralık 2009). ElasticBLAST (2023) beş yazardır, bu yüzden CSE 9 beşini de listeler. Bu satırlar NCBI’nin önerdiği alıntıların CSE 9 sunumudur, Quick Guide örnekleri değil:

NCBI BLAST ve ImageJ yöntem makalelerinin CSE 9 sunumu

BLAST 1990 (5 yazar, bu yüzden hepsini listeleyin):

Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990;215(3):403–410. https://doi.org/10.1016/S0022-2836(05)80360-2

Gapped BLAST / PSI-BLAST 1997 (5’ten fazla yazar):

Altschul SF et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res. 1997;25(17):3389–3402. https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389

BLAST+ (NCBI liste yılı 2008; BMC 2009; 7 yazar, bu yüzden et al.):

Camacho C et al. BLAST+: architecture and applications. BMC Bioinformatics. 2009;10:421. https://doi.org/10.1186/1471-2105-10-421

ElasticBLAST (5 yazar, bu yüzden hepsini listeleyin):

Camacho C, Boratyn GM, Joukov V, Vera Alvarez R, Madden TL. ElasticBLAST: accelerating sequence search via cloud computing. BMC Bioinformatics. 2023;24(1):117. https://doi.org/10.1186/s12859-023-05245-9

ImageJ (Nature Methods; 3 yazar):

Schneider CA, Rasband WS, Eliceiri KW. NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis. Nat Methods. 2012;9(7):671–675. https://doi.org/10.1038/nmeth.2089

Fiji, çalıştırdığınız çeşitse (ImageJ alıntılama sayfası, doi:10.1038/nmeth.2019):

Schindelin J et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat Methods. 2012;9(7):676–682. https://doi.org/10.1038/nmeth.2019

ImageJ alıntılama sayfası açıktır: özgün program için ImageJ (doi:10.1038/nmeth.2089), Fiji kullandıysanız Fiji (doi:10.1038/nmeth.2019) ve ImageJ2 kullandıysanız ImageJ2 (doi:10.1186/s12859-017-1934-z) kaynak gösterin. Çalıştırdığınız sürümü kaynak gösterin. Projenin iniş sayfası yeğlenen bir alıntı adlandırıyorsa (ImageJ, R, QIIME 2, FlyBase), o makaleyi veya yazılım kaynağını kullanın. Hiç kaydetmediğiniz bir yayın tarihi uydurmayın ve «NCBI BLAST»i yazarsız bir dergi makalesiymiş gibi kaynak göstermeyin.

Ön baskılar, tezler ve ahead-of-print makaleler

CSE 9 bir ön baskı bölümü ekledi. Durumu köşeli parantezle işaretleyin ve sunucu adını koruyun. Hakem değerlendirmeli sürüm çıktığında dergi makalesini kaynak gösterin ve ön baskı kaydının kendisini tartışmıyorsanız ön baskıyı emekli edin. Resmi Quick Guide örneği medRxiv’deki Lopez Bernal et al.’dır. O makale artık yalnızca bir ön baskı değildir: Lopez Bernal et al., *N Engl J Med* 2021;385(7):585–594 olarak çıktı. Resmi ön baskı satırını CSE şablonu olarak tutun; okuduğunuz buysa NEJM sürümünü kaynak gösterin.

Resmi CSE 9 ön baskı, artakalan yayımlanmış sürüm, tez ve ahead of print

Resmi citation-sequence ön baskı:

Lopez Bernal J et al. Effectiveness of COVID-19 vaccines against the B.1.617.2 variant [preprint]. medRxiv 2021. https://doi.org/10.1101/2021.05.22.21257658

Resmi name-year ön baskı:

Lopez Bernal J et al. 2021. Effectiveness of COVID-19 vaccines against the B.1.617.2 variant [preprint]. medRxiv. https://doi.org/10.1101/2021.05.22.21257658

Sonraki NEJM makalesinin CSE 9 sunumu (dergiyi okuduysanız bunu kaynak gösterin):

Lopez Bernal J et al. Effectiveness of Covid-19 vaccines against the B.1.617.2 (Delta) variant. N Engl J Med. 2021;385(7):585–594. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2108891

Resmi citation-sequence tez:

Liang S. Transport properties of topological semimetals and non-symmorphic topological insulator [dissertation]. Princeton University; 2020. https://arks.princeton.edu/ark:/88435/dsp01vm40xv52n

Resmi citation-sequence ahead of print:

Corrigan TJ Jr, Businger S. The anatomy of a series of cloud bursts that eclipsed the US rainfall record. Mon Wea Rev. [published online ahead of print 2021 Dec 30]. https://doi.org/10.1175/MWR-D-21-0028.1

Web siteleri: artakalan CDC URL’si ve date unknown yalnızca name–year’da

Web siteleri, varsa hâlâ bir yayın veya güncelleme tarihi ister. İki CSE sistemi eksik-tarih kuralını özdeş sözcüklerle yazmaz. Citation–sequence yalnızca bir erişim tarihi ister; name–year «date unknown» ifadesini ekler. Resmi tarihli-site örneği hâlâ CDC sağlık eşitliği sayfasıdır. 9 Ekim 2026’da açıldığında o kesin URL 404 döndürdü. CDC yığınları ve archive.cdc.gov daha erken anlık görüntüleri tutar; artakalan 2019-ncov yolunu 2026 bir ödeve yayındaymış gibi yapıştırmayın. Resmi CSE noktalamasını kopyalayın, sonra URL’yi gerçekten aldığınız sayfayla değiştirin.

CSE Citation Quick Guide, web siteleri

Citation-sequence / citation-name sekmesi:

If no date of publication or update is available, include an access date.

Name-year sekmesi:

If no date of publication is available, use “date unknown” and include an access date.

Resmi citation-sequence tarihli web sitesi (CDC; artakalan URL artık 404):

Health equity considerations and racial and ethnic minority groups. US Centers for Disease Control and Prevention, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Division of Viral Diseases; 2020 Apr 30 [updated 2022 Jan 25]. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/health-equity/race-ethnicity.html

Resmi name-year tarihli web sitesi:

Health equity considerations and racial and ethnic minority groups. 2020 Apr 30. US Centers for Disease Control and Prevention, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Division of Viral Diseases; [updated 2022 Jan 25]. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/health-equity/race-ethnicity.html

O sayfa için resmi name-year metin içi:

(Health equity . . . 2020)

Resmi name-year tarihsiz harita:

Montrose Point Bird Sanctuary, Chicago, Illinois. [date unknown]. Google Maps; [accessed 2022 Jan 3]. https://goo.gl/maps/GJALYGBXFZ8TSGK5A

Resmi name-year metin içi:

(Montrose Point . . . [date unknown])

Yayımlanmamış veriler cümlede kalır, kaynakçada değil

Laboratuvar grupları hâlâ «unpublished data» ve koridor konuşmalarını numaralı kaynak olarak girmeye çalışır. CSE 9 bunları son listenin dışında tutar:

CSE Citation Quick Guide, kişisel iletişim

References to personal communications are placed in running text rather than as formal end references. Permission is usually required and should be acknowledged in an “Acknowledgments” or “Notes” section at the end of the document.

. . . local and systemic reactions were expected to be stronger after the second dose (2022 letter from TD Perez to author; unreferenced, see “Notes”) . . .

Not all forthcoming or unpublished sources are suitable for inclusion in reference lists. Check with your publisher if in doubt.

Öğretim görevliniz izin veriyorsa cümlede (A. Johnson, unpublished data, 2026) yazın. Başka kimsenin geri alamayacağı bir defter sayfası için numaralı bir son kaynak uydurmayın. Veriler sonra bir makalede, tezde veya GenBank kaydında çıkarsa o geri bulunabilir nesneyi kaynak gösterin.

Taksonomik adlar düz yazıdır, gizli dördüncü bir alıntı sistemi değil

Akan metinde binomeni italik yapın: Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Homo sapiens. İlk anılıştan sonra birçok biyoloji dergisi kısaltılmış cinsi kabul eder (D. melanogaster). Betimleyen yetke—o meyve sineği için Meigen, 1830—taksonomik adlandırmadır. Özgün betimleme makalesini gerçekten okuyup kaynak göstermediğiniz sürece bir CSE son kaynağı değildir. Meigen, 1830’u sahte bir dergi makalesine çevirmeyin ve yetkeyi italik yapmayın.

Gen ve protein simgeleri organizmanın adlandırması organını izler (insan genleri için HGNC, FlyBase, SGD ve benzeri), CSE Bölüm 29’u değil. CSE makaleyi veya veritabanı kaydını nasıl kaynak göstereceğinizi söyler; simge stili alandan gelir.

CSE, APA, Vancouver yoksa derginin ev stili mi?

Kampüs biyolojisi tek stil değildir. Biyoloji kaynak gösterme stilleri alan sayfası taramadır; bu tablo bir ödev için verdiğiniz karardır:

Mekânı eşleştirin. APA parantezlerini bir CSE numaralı listeye taşımayın.
Belge şunu diyorsa…	Kullanın	Kullanmayın
CSE, CBE, Scientific Style and Format veya Council of Science Editors	CSE (üç sistemden biri)	APA yazar–tarih noktalaması veya Vancouver’ın (1)’ini CSE imiş gibi
APA, psikoloji yöntemleri veya APA adlandıran bir biyoloji eğitimi dergisi	APA	CSE name–year. Akraba görünürler ve aynı liste değildirler
ICMJE, Uniform Requirements, NLM veya Vancouver	Vancouver veya tıbbi alıntı rehberi	CSE 9’un 5 yazarlı et al. eşiği veya name–year parantezleri
Nature, Cell, Science veya PLOS yazar yönergeleri	O derginin ev stili	Bu sayfadan uydurduğunuz genel bir «biyoloji stili»

Science ve PNAS, CSE 9’un yeni yazar eşiği için model olarak andığı dergilerdir; oraya gönderilen el yazmalarını hâlâ kendi Yazarlar için Yönergeler belgelerini yönetir. Bir PLOS ONE makalesi PLOS’un numaralı Vancouver benzeri stilini kullanır, bir CSE name–year listesini değil. İzlence suskunsa sorun. Sonra ilk kaynağı biçimlendirmeden önce bir sistemi kilitleyin.

Biyoloji öğrencilerinin gerçekten düştüğü hata kipleri

Sistemleri karıştırmak. Metindeki 7 numarası alfabetik bir name–year listesine işaret edemez. Bir sistem seçin ve her şekil açıklamasında yeniden kullanın.
8. baskı 10 yazar eşiğini kullanmak. CSE 9 en fazla 5 ad listeler, sonra ilk yazar + et al. 7 yazarlı bir Molecular Biology of the Cell kaynağı Alberts B et al.’dır, yedi soyadı değil. Artakalan Pizzi 10 yazar satırı hâlâ 8. baskı Quick Guide’da durur.
Dergi kısaltması uydurmak. Ekstra noktalı J. Cell. Biol. bir CSE kısaltması değildir. ISSN LTWA veya NLM Catalog kullanın.
PDF’yi bulan veritabanını kaynak göstermek. PubMed, JSTOR ve kampüs vekili arama yollarıdır. Kaynak dergi makalesidir.
Her kitapta kenti bırakmak. CSE 9 yayın yerini düşürdü. New York: W. W. Norton & Company; 2022 eski kalıptır.
Her DOI’ye erişim tarihi basmak. Erişim tarihleri yalnızca yayın, telif veya revizyon tarihi belirlenemediğinde kalır.
Artakalan CDC 2019-ncov URL’sini kopyalamak. Resmi CSE web sitesi örneği hâlâ o yolu basar; 9 Ekim 2026’da açıldığında 404 döndürdü. Gerçekten açtığınız sayfayı kaynak gösterin.
Harrison 22 için “Forthcoming 2026” kopyalamak. McGraw Hill 22. baskıyı 2025’te yayımladı; Longo ilk sırada listelenir.
NEJM’yi okuduktan sonra Lopez Bernal medRxiv satırını kaynak göstermek. Quick Guide ön baskısı şablondur. Dergi makalesi N Engl J Med. 2021;385(7):585–594’tür.
Name–year web sitelerinin date unknown dediğini unutmak. Citation–sequence sekmesi yalnızca erişim tarihi ister. Name–year sekmesi [date unknown] ekler.
Makale numarasını APA eLocator gibi ele almak. Resmi CSE Adv Meteorol. 2020:8874869 (numaralı) veya Adv Meteorol. 8874869 (name–year) yazar.
Accession.version’sız bir dizi iddiası yazmak. AF123456 yetmez; alıntılanabilir nesne AF123456.2’dir. GenBank Release 273.0 bir dökümdür, bir alıntı değil.
BLAST+ araması için BLAST 1990’ı kaynak göstermek. NCBI’nin yürürlükteki yardım listesi Camacho BLAST+ (BMC Bioinformatics 10:421) ve ElasticBLAST 2023’ü içerir.
Fiji çalıştırırken ImageJ kaynak göstermek. ImageJ alıntılama sayfası ImageJ için Schneider 2012, Fiji için Schindelin 2012 ister.
Yayımlanmamış verileri numaralı listeye koymak. Kişisel iletişimler ve defter sonuçları cümlede kalır.
Bir binomeni kaynakmış gibi biçimlendirmek. D. melanogaster düz yazıdır. O sinek hakkında okuduğunuz makale alıntıdır.
Belirli bir deney sonucu için bir derlemeyi kaynak göstermek. İddia o deney hakkındaysa özgün yöntem veya sonuç makalesini kullanın.
Yazılımı, paketleri veya yayımlanmış protokolleri atlamak. Çalıştırdığınız sürümü projenin önerdiği alıntıdan veya yöntem makalesinden kaynak gösterin. Hiç kullanmadığınız bir sürüm uydurmayın.

Gerçekten yakaladığınız kaydı biçimlendirin

Bir üreteç CSE noktalamasını yalnızca sakladığınız üst verilere uygulayabilir. Bir sayı, bir ISSN kısaltması veya bir dizi sürümü uyduramaz. Önce metin içi sistemi kilitleyin, sonra CSE alıntı üreteci’nde eksiksiz bir kayıttan—DOI, PMID veya elle alanlar—biçimlendirin.

Biyoloji makaleleri için CSE alıntıları üretin

Citation–sequence, citation–name veya name–year’ı tutarlı kullanın. DOI veya PubMed ID ile arayın ya da gerçekten açtığınız kaynağı girin. Üreteç, hiç kaydetmediğiniz bir GenBank sürüm soneki uydurmaz.

CSE alıntı üretecini deneyin →

Biyoloji CSE alıntı soruları

CSE, CBE ile aynı mıdır?: Tarihsel olarak evet. Council of Biology Editors, Council of Science Editors oldu. Kampüs el ilanları hâlâ CBE der. Güncel kitap The CSE Manual, 9. baskıdır (2024). Yazar eşikleri, kentler veya erişim tarihleri için 6. baskı bir CBE fotokopisini—ya da hâlâ ilk 10 yazarı listeleyen artakalan 8. baskı Quick Guide’ı—izlemeyin.
Bir biyoloji laboratuvar raporu hangi CSE sistemini kullanmalıdır?: Öğretim görevlisinin adlandırdığı sistemi. Sayfa «numaralı CSE» diyorsa, listeyi önce alfabetikleştirin demiyorsa (citation–name) bu citation–sequence’dir. Ekoloji ve organizma dersleri çoğu zaman name–year ister. Beğendiğiniz bir yöntem makalesinden tahmin etmeyin.
CSE 9, et al. öncesi kaç yazar listeler?: Beş. 6 veya daha fazla yazarlı bir eser son kaynakta ilk yazarı artı et al. listeler. Name-year metin içi alıntılar 3 veya daha fazla yazar için zaten ilk yazar artı et al kullanır. 8. baskının «ilk 10» kuralı emeklidir; eski Quick Guide’daki Pizzi Anticancer Res. satırı artakalardır.
CSE’de dergi adlarını italik yapar mıyım?: Hayır. CSE son kaynakları dergi başlıklarını dik yazıya koyar ve kısaltır. İtalik, akan metindeki binomenlere (Homo sapiens) ve birkaç özel başlık durumuna aittir; kaynakçadaki J Cell Biol’e değil.
CSE’de bir GenBank veya RefSeq dizisini nasıl kaynak gösteririm?: Makaleye tam accession.version’ı koyun (AF123456.2, NM_001349333.1). Biçimsel bir son kaynak için NLM’nin Nucleotide veritabanı kaydı kalıbını izleyin: veritabanı, kuruluş, erişim numarası, ürün açıklaması, anılma tarihi ve URL. Tanımlayıcısız «GenBank» kaynak göstermeyin ve Release 273.0’ı diziymiş gibi kaynak göstermeyin.
CSE’de BLAST veya ImageJ nasıl kaynak gösterilir?: NCBI’nin veya projenin adlandırdığı yöntem makalesini kaynak gösterin. BLAST 1990’ın beş yazarı vardır, bu yüzden CSE 9 Altschul, Gish, Miller, Myers ve Lipman’ı listeler. Yürürlükteki web BLAST BLAST+’tır; Camacho et al., BMC Bioinformatics 2009;10:421 kaynak gösterin. ImageJ Schneider, Rasband ve Eliceiri’dir, Nat Methods 2012. Fiji çalıştırdıysanız onun yerine Schindelin 2012 kaynak gösterin. Tarayıcı sekmesini kaynak göstermeyin.
Sayfa yerine numarası olan bir eLife veya PLOS makalesini nasıl kaynak gösteririm?: Makale numarasını CSE’nin konum yuvasına koyun. Resmi Quick Guide örneği Liu et al., Adv Meteorol. 2020:8874869 (citation-sequence) veya Adv Meteorol. 8874869 (name-year)’dır. APA’nın Article eLocator önekini taşımayın.
bioRxiv’i mi yoksa yayımlanmış makaleyi mi kaynak göstermelidir?: Kullandığınız sürümü kaynak gösterin. Makale artık bir dergideyse dergiyi ve DOI’yi kaynak gösterin. Ön baskıyı yalnızca o ön baskıyı tartışırken tutun. CSE 9’un resmi örneği medRxiv’deki Lopez Bernal et al.’dır, [preprint] etiketli; o makale sonra N Engl J Med. 2021;385(7):585–594 olarak çıktı.
Name-year CSE, APA 7 ile aynı mıdır?: Hayır. İkisi de cümleye bir ad ve bir yıl koyar. APA virgül, ve işareti, italik dergi-ve-ciltle cümle düzeni makale başlıkları ve 20 yazar eşiği kullanır. CSE name-year (Fauci and Lane 2020), kısaltılmış dik dergi başlıkları, listede yazarların hemen ardından yıl ve 5 yazar eşiği kullanır. APA ile CSE’ye bakın.
CSE hâlâ Norton veya Springer için kenti ister mi?: 9. baskıda hayır. Olson’ın Science Editor notu ve Quick Guide, yayımcıların birden çok yeri olduğu ve eserin kent olmadan bulunabildiği için yayın yerini kaldırır. 8. baskı bir «New York (NY):» satırı 2026 tarihli bir CSE ödevi için eskidir.