Biyoloji Kaynak Gösterme Rehberi: CBE/CSE Stili
Biyolojik araştırma; saha çalışmalarından ve laboratuvar deneylerinden moleküler biyoloji ve ekolojiye kadar bilimsel literatürün sistematik biçimde belgelenmesini gerektirir. Bu rehber, biyoloji ve yaşam bilimleri için standart olan, eskiden CBE olarak bilinen CSE (Council of Science Editors) kaynak gösterme stilini ele alır.
Kaynak Gösterme Biyolojide Neden Önemlidir
Biyoloji bilimlerinde kaynak gösterme, gözlemleriniz, hipotezleriniz ve sonuçlarınız için ampirik temeli oluşturur. Gen ifadesi, ekosistem dinamikleri veya hücresel mekanizmalar üzerine bir çalışmaya atıf yaptığınızda, çalışmanızı yaşamı anlayışımızı tanımlayan birikmiş bilgiye bağlarsınız.
Biyoloji, temel olarak keşiflerin önceki araştırmalar üzerine inşa edildiği kümülatif bir bilimdir. Kaynak gösterme, iddiaların doğrulanmasına, deneylerin tekrarlanmasına olanak tanır ve biyolojik kavramların Darwin'in doğal seçiliminden CRISPR gen düzenlemesine kadar evrimini izler.
Biyolojide doğru kaynak gösterme aynı zamanda bilimsel dürüstlüğü gösterir, diğer araştırmacıların katkılarını kabul eder ve bilimsel yönteme temel olan tekrarlanabilirliği korur. Verilerin sıkı hakem incelemesine dayanması gereken bir alanda, kaynak gösterme doğruluğu araştırma kalitesini yansıtır.
CSE Stili: Üç Kaynak Gösterme Sistemi
Council of Science Editors (CSE) stili, her biri farklı biyolojik alt disiplinlere uygun üç ayrı kaynak gösterme sistemi sunar. Biyoloji öğrencileri üçünü de anlamalı ve öğretim üyelerinin veya hedef derginin tercih ettiği sistemi kullanmalıdır.
Atıf-Sıra Sistemi
Biyolojide en yaygın olanıdır. Kaynaklar metinde ilk görünüş sırasına göre numaralandırılır. Aynı kaynağa yapılan sonraki atıflarda aynı numara kullanılır.
Metin içi atıf:
Studies have shown1,2 that mitochondrial function...
Kaynakça:
1. Smith JA, Chen L. Mitochondrial dynamics in aging cells. J Cell Biol. 2023;218(4):567-582.
Atıf-Ad Sistemi
Kaynaklar alfabetik olarak listelenir, ardından numaralandırılır. Atıflar bu numaraları metin boyunca kullanır.
Ad-Yıl Sistemi
APA stiline benzer. Yazar ve yıl parantez içinde görünür. Alfabetik kaynakça.
Metin içi atıf:
(Smith and Chen 2023) or Smith and Chen (2023) observed...
Biyolojik Araştırmada Yaygın Kaynak Türleri
1. Dergi Makaleleri
Cell, Nature, Science gibi hakemli dergiler ve uzmanlaşmış biyoloji dergileri birincil araştırma bulgularını yayımlar.
Atıf-sıra biçimi:
1. Watson JD, Crick FH. Molecular structure of nucleic acids: a structure for deoxyribose nucleic acid. Nature. 1953;171(4356):737-738.
Ad-yıl biçimi:
Watson JD, Crick FH. 1953. Molecular structure of nucleic acids: a structure for deoxyribose nucleic acid. Nature. 171(4356):737-738.
2. Kitaplar ve Ders Kitapları
Biyoloji ders kitapları ve başvuru eserleri, genetik, ekoloji, fizyoloji ve diğer alt disiplinlerde temel bilgi sağlar.
Atıf-sıra:
2. Alberts B, Johnson A, Lewis J, Morgan D, Raff M, Roberts K, Walter P. Molecular biology of the cell. 7th ed. New York: W.W. Norton & Company; 2022. 1464 p.
3. Veritabanı Dizileri
GenBank, protein veritabanları ve genomik depolar, belirli kaynak gösterme biçimleri gerektiren, moleküler biyolojide vazgeçilmez kaynaklardır.
3. GenBank [Internet]. Bethesda (MD): National Center for Biotechnology Information; [date unknown]-. Accession No. NM_000546, Homo sapiens tumor protein p53 (TP53), mRNA; [cited 2026 Jan 5]. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_000546
4. Saha Rehberleri ve Tür Tanımlama
Taksonomik anahtarlar, saha rehberleri ve tanımlama kaynakları, ekoloji ve sistematik biyoloji için temeldir.
4. Sibley DA. The Sibley guide to birds. 2nd ed. New York: Alfred A. Knopf; 2014. 598 p.
5. Konferans Özetleri ve Bildirileri
Bilimsel konferanslar, dergi yayınından önce ortaya çıkan araştırmaları sergiler.
5. Martinez KL, Johnson RS. Novel approaches to coral reef restoration. In: Proceedings of the International Coral Reef Symposium; 2023 Jul 3-8; Bremen, Germany. p. 234-245.
6. Devlet ve Kurum Raporları
EPA, NOAA, USGS ve diğer kurumlar araştırma raporları, veri özetleri ve çevresel değerlendirmeler yayımlar.
6. [EPA] Environmental Protection Agency (US). National water quality inventory: report to Congress. Washington (DC): EPA; 2023. Report No.: EPA-841-R-23-001.
Biyolojik Araştırmadan Örnekler
Klasik Genetik Makalesi
7. Mendel G. Experiments in plant hybridization. Proceedings of the Natural History Society of Brünn. 1866;4:3-47.
Moleküler Biyoloji Çalışması
8. Doudna JA, Charpentier E. The new frontier of genome engineering with CRISPR-Cas9. Science. 2014;346(6213):1258096.
Ekoloji Saha Çalışması
9. Paine RT. Food web complexity and species diversity. Am Nat. 1966;100(910):65-75.
Koruma Biyolojisi
10. Wilson EO. Half-earth: our planet's fight for life. New York: Liveright Publishing Corporation; 2016. 272 p.
Alana Özgü Kaynak Gösterme Zorlukları
1. Taksonomik Otoriteler
Bir türden ilk kez bahsederken, onu tanımlayan taksonomik otoriteyle birlikte bilimsel adı ekleyin.
Drosophila melanogaster (Meigen, 1830) or Escherichia coli (Migula 1895)
2. Yayımlanmamış Veriler ve Kişisel İletişim
Ön verileri veya kişisel iletişimi metin içinde belirtin ancak kaynakçada göstermeyin.
(A. Johnson, unpublished data) or (B. Smith, personal communication)
3. PubMed'de Alıntılanan ile Diğer Veritabanları
Makalelere veritabanları aracılığıyla erişildiğinde, genellikle veritabanının kendisi yerine orijinal dergi yayınını kaynak gösterin.
4. Çok Yazarlı İşbirliği Makaleleri
Büyük biyoloji işbirlikleri 20'den fazla yazara sahip olabilir. CSE stili tüm yazarları listeler veya ilk 10 yazardan sonra “et al.” kullanır.
5. Ön Baskılar ve bioRxiv
Biyoloji giderek daha fazla ön baskı sunucuları kullanıyor. Ön baskı durumunu açıkça belirtin ve hakemli sürümler yayımlandığında kaynak gösterimlerini güncelleyin.
11. Chen L, Martinez R. Novel mechanisms of protein folding. bioRxiv. 2023. doi:10.1101/2023.12.01.567890. Preprint.
Biyoloji Öğrencileri İçin İpuçları
1. Doğru CSE Sistemini Seçin
Öğretim üyenizin veya hedef derginizin hangi CSE sistemini gerektirdiğini teyit edin. Atıf-sıra en yaygın olanıdır, ancak moleküler biyoloji genellikle ad-yıl kullanır.
2. Kısaltılmış Dergi Başlıkları Kullanın
CSE stili standart dergi kısaltmaları kullanır. Derginin resmî kısaltmasını kontrol edin veya standartlaştırılmış biçimler için Web of Science gibi veritabanlarını kullanın.
3. Çevrimiçi Kaynaklar İçin Erişim Tarihlerini Ekleyin
Veritabanları, web siteleri ve yalnızca çevrimiçi kaynaklar için materyale eriştiğiniz tarihi ekleyin.
4. Yöntem Makalelerini Kaynak Gösterin
Yerleşik protokoller veya teknikler kullanırken, orijinal yöntembilim makalesini veya yayımlanmış protokolü kaynak gösterin.
5. İstatistik Yazılımını Belgeleyin
Analizinizde kullandığınız R paketlerini, istatistik yazılımını ve biyoinformatik araçlarını kaynak gösterin.
12. R Core Team. R: a language and environment for statistical computing [Internet]. Vienna (Austria): R Foundation for Statistical Computing; 2023. Available from: https://www.R-project.org/
6. Tam Kaynak Gösterimleriyle Laboratuvar Defterleri Tutun
Literatür taramaları ve deneyler sırasında eksiksiz kaynak gösterme bilgilerini kaydedin. Bu, ileride zaman alan aramaları önler.
7. Mümkün Olduğunda Birincil Araştırmayı Kaynak Gösterin
Derleme makaleleri mükemmel genel bakışlar sunarken, deneysel bulgular hakkında belirli iddialarda bulunurken orijinal araştırma makalelerini kaynak gösterin.
Önerilen Araçlar ve Kaynaklar
Resmî CSE Kaynakları
- Scientific Style and Format: The CSE Manual (8. baskı): CSE kaynak gösterme ve bilimsel yazım için kapsamlı kılavuz
- Council of Science Editors web sitesi: Kaynak gösterme uygulamalarına ilişkin güncellemeler ve açıklamalar
Biyologlar İçin Kaynak Gösterme Yönetimi
- Zotero: Güçlü PubMed entegrasyonuyla çeşitli biyolojik kaynakları yönetmek için mükemmel
- Mendeley: PDF açıklama ve araştırma ağı özellikleriyle biyologlar arasında popüler
- Papers: Birçok biyoloji araştırmacısının tercih ettiği Mac/iOS uygulaması
- EndNote: Sağlam CSE biçimlendirmesiyle kapsamlı bir araç
Biyolojik Araştırma Veritabanları
- PubMed: Biyomedikal ve yaşam bilimleri literatürü için temel veritabanı
- Web of Science: Atıf takibi ve etki metrikleri
- Google Scholar: Atıf uyarılarıyla geniş kapsam
- BioOne: Tam metin biyoloji dergileri
- JSTOR: Tarihsel ve ekolojik literatür
Uzmanlaşmış Biyoloji Veritabanları
- GenBank (NCBI): Genetik dizi veritabanı
- Protein Data Bank (PDB): 3B yapısal veri
- Global Biodiversity Information Facility (GBIF): Tür gözlem verisi
- TreeBASE: Filogenetik veri
- FishBase / SeaLifeBase: Tür bilgisi
Yazım ve Araştırma Desteği
- Purdue OWL CSE Guide: Örneklerle açık açıklamalar
- Nature Scitable: Bilimsel yazım üzerine ücretsiz eğitim kaynakları
- Angelika H. Hofmann'ın Writing in the Biological Sciences kitabı: Biyolojik yazım için pratik rehber
Kaçınılması Gereken Yaygın Hatalar
- CSE sistemlerini karıştırmak: Bir makale boyunca tek bir sistemi tutarlı biçimde kullanın
- Yanlış yazar adı biçimi: CSE, nokta veya boşluk olmadan soyadını ve baş harfleri kullanır: Smith, J.A. değil Smith JA
- Cilt/sayı numaralarının eksik olması: Dergi makaleleri için ikisini de ekleyin
- Uygunsuz tür adı biçimlendirmesi: Cins ve türü italik yazın: Homo sapiens
- Erişim tarihlerini unutmak: Çevrimiçi veritabanları ve değişen içerikler için ekleyin
- Eksik veritabanı kaynak gösterimleri: Erişim numaralarını ve depo bilgilerini ekleyin
- Birincil araştırma yerine derleme makaleleri kaynak göstermek: Mümkün olduğunda iddiaları orijinal çalışmalara kadar takip edin
Özel Biyoloji Kaynak Gösterme Senaryoları
Yayımlanmamış Tez
13. Johnson KL. Evolutionary mechanisms in adaptive radiation [dissertation]. [Berkeley (CA)]: University of California, Berkeley; 2023. 234 p.
Başka Bir Kaynaktan Görsel veya Şekil
14. Miller AB, Chen CD. Cell division mechanisms. Nature. 2023;612:456-462. Figure 3, Cell cycle phases; p. 459.
Laboratuvar El Kitabı
15. Current protocols in molecular biology [Internet]. Hoboken (NJ): John Wiley & Sons; c2023 [cited 2026 Jan 5]. Available from: https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/
Biyoteknoloji Patenti
16. Smith JA, Johnson KL, inventors; Genetics Corp, assignee. CRISPR-based gene editing method. United States patent US 11,234,567. 2023 Jan 24.
Biyoloji Makaleleri İçin CSE Kaynak Gösterimleri Oluşturun
Biyoloji araştırma makaleleriniz ve laboratuvar raporlarınız için doğru CSE stilinde kaynak gösterimleri oluşturun. Atıf-sıra, atıf-ad ve ad-yıl biçimlerini destekler. DOI, PubMed kimliğine göre arama yapın veya kaynak ayrıntılarını manuel girin.