Перейти к содержимому
По дисциплинам

Как цитировать биологические источники в стиле CSE

Биологические статьи следуют *The CSE Manual: Scientific Style and Format for Authors, Editors, and Publishers*, 9-е издание (2024), глава 29. Бесплатный CSE Citation Quick Guide — публичный набор примеров: зафиксируйте одну из трёх внутритекстовых систем, затем напишите восстанавливаемую ссылку на объект, которым вы действительно пользовались — журнальную статью, главу книги, accession.version GenBank, методическую статью BLAST, препринт или диссертацию. Эта страница — практическое руководство по типам биологических источников. Если задание всё ещё может быть APA, начните с APA и CSE.

Автор: 24 мин чтения

Фотография к руководствам раздела «По дисциплинам»
Фото: Gabriel Ghnassia, Викисклад (CC0)
На этой странице

Краткий ответ: как цитировать биологические источники в CSE

Сначала откройте программу курса или Instructions for Authors журнала. Используйте CSE, когда этот документ называет The CSE Manual, Scientific Style and Format, CBE или Council of Science Editors. Выберите одну систему на всю работу: citation–sequence, citation–name или name–year. Нумерованные списки повторно используют исходный номер; списки name–year — алфавитные. Журнальные ссылки сначала ставят авторов (фамилия, затем инициалы, без точек), затем заголовок статьи с заглавной только первой буквы, журнал, сокращённый по ISSN List of Title Word Abbreviations, год, том, выпуск, страницы или номер статьи и ссылку https://doi.org/, когда DOI есть.

Официальные шаблоны CSE 9 и первые разобранные строки

Шаблон журнала citation-sequence / citation-name:

Author(s). Article title. Journal title. Date;volume(issue):location. URL

Шаблон журнала name-year:

Author(s). Date. Article title. Journal title. Volume(issue):location. URL

Шаблон книги citation-sequence:

Author(s). Title. Edition. Publisher; year of publication.

Шаблон книги name-year:

Author(s). Date. Title. Edition. Publisher.

Официальный журнал citation-sequence:

Haasnoot M, Lawrence J, Magnan AK. Pathways to coastal retreat. Science. 2021;372(6548):1287–1290. https://doi.org/10.1126/science.abi6594

Официальный журнал name-year:

Fauci AS, Lane HC. 2020. Four decades of HIV/AIDS—much accomplished, much to do. N Engl J Med. 383(1):1–4. https://doi.org/10.1056/NEJMp1916753

Официальное name-year в тексте (два автора):

(Fauci and Lane 2020)

Citation-sequence в предложении:

Coastal adaptation pathways are already in use.1

Quick Guide формулирует правило трёх систем одним предложением, которое можно отнести преподавателю, говорящему «просто используйте CSE»:

CSE Citation Quick Guide, 9-е издание (открыт 9 октября 2026)

The CSE Manual presents 3 systems for referring to references (also known as citations) within the text of a journal article, book, or other scientific publication: (1) citation–sequence, (2) name–year, and (3) citation–name.
A DOI-based URL (which starts with https://doi.org/), when available, should be preferred to any other form of URL.
For articles with more than 5 authors, list the first author followed by “et al.”
Journal titles are generally abbreviated according to the List of Title Word Abbreviations maintained by the ISSN International Centre.

Что охватывает это руководство — и чего не охватывает

Пользуйтесь этой страницей, когда трудность в самом биологическом объекте: статья в Nature против записи PubMed, которая её нашла; accession.version GenBank против статьи, которая её депонировала; поиск BLAST+ против статьи об алгоритме Altschul 1990; препринт bioRxiv против позднейшей журнальной статьи; или ссылка на методы в лабораторном отчёте против книги протоколов. Для выбора площадки между CSE и APA используйте APA и CSE или какой стиль цитирования. Соседние нумерованные стили — не CSE: медицинское цитирование охватывает AMA 11 и Vancouver/NLM; химическое цитирование охватывает ACS. Разбор одного источника см. в как цитировать журнальную статью в CSE.

Действующий авторитет — The CSE Manual, 9-е издание, а не ксерокопия CBE

Кафедры всё ещё говорят «стиль CBE» или «CSE 8-е». Имеется в виду The CSE Manual, преемник 2024 года книги Scientific Style and Format, 8-е издание (2014). Совет переименовал книгу, потому что пользователи уже называли её руководством CSE. Ссылки живут в главе 29. Quick Guide — публичный набор примеров; приложение 29.1 охватывает сокращения названий журналов. CSE цитирует само руководство так:

Официальная ссылка на домашнюю страницу CSE Manual (csemanual.org, открыта 9 октября 2026)

Council of Science Editors, Style Manual Task Force. The CSE manual: scientific style and format for authors, editors, and publishers. 9th ed. Council of Science Editors in cooperation with The University of Chicago Press; 2024. https://doi.org/10.7208/cse9

Питер Дж. Олсон, один из редакторов главы 29, заново сформулировал пороги 9-го издания в Science Editor (март 2024; PDF за март 2024 открыт для этой переработки после того, как HTML-статья вернула 403):

Science Editor, Питер Дж. Олсон о CSE 9, глава 29

As of the ninth edition, the maximum number of authors listed is 5, and references with 6 or more authors should list only the first author followed by “et al.”
Additionally, access dates for online sources are now required only when the date of publication, copyright, or revision cannot be determined, and publisher locations are no longer needed (partly because this information has become less relevant, but also because many book publishers have multiple locations).

Сетевой Quick Guide 8-го издания по-прежнему размещён на scientificstyleandformat.org. Он всё ещё учит снятому порогу в 10 авторов. Не смешивайте его примеры с работой по 9-му изданию:

Устаревший Quick Guide 8-го издания (ещё жив; не копируйте в CSE 9)

Порог авторов 8-го издания (снят):

For articles with more than 10 authors, list the first 10 followed by “et al.”

Образец 8-го издания на 10 авторов (Pizzi):

Pizzi C, Caraglia M, Cianciulli M, Fabbrocini A, Libroia A, Matano E, Contegiacomo A, Del Prete S, Abbruzzese A, Martignetti A, et al. Low-dose recombinant IL-2 induces psychological changes: monitoring by Minnesota Multiphasic Personality Inventory (MMPI). Anticancer Res. 2002;22(2A):727–732.

Аудиторные листы 8-го издания, которые перечисляют первых 10 авторов, требуют город для Springer и ставят дату доступа на каждый DOI, преподают старую книгу.

Три системы CSE — не взаимозаменяемые внутренние стили

Пунктуация конечной ссылки почти одинакова во всех трёх системах. Разница — в работе внутритекстовой метки и в порядке списка. Quick Guide говорит, что нумерованная пара идентична, кроме порядка списка:

CSE Citation Quick Guide, о нумерованных системах

These 2 systems are identical except for the order in which the end references are listed. In both systems, numbers within the text refer to the end references.
In the citation–sequence system, the end references are listed in the sequence in which they first appear within the text. For example, if a reference by Smith is the first one mentioned in the text, then the complete reference to the Smith work will be number 1 in the end references. The same number is used for subsequent in-text references to the same document.
In the citation–name system, the end references are listed alphabetically by the first author’s surname. Multiple works by the same author are listed alphabetically by title.
Выберите систему, которую называет программа курса или журнал. Не смешивайте их в одной работе.
СистемаМетка в текстеПорядок конечного спискаОбычное применение в биологии
Citation–sequenceНомер при первом упоминании; используйте его сноваПорядок первого появленияМногие лабораторные отчёты и некоторые журналы наук о жизни
Citation–nameНомер, присвоенный после алфавитной сортировки спискаПо алфавиту первого автора, затем заголовкаРеже в университете; всё ещё вариант CSE
Name–year(Фамилия Год); двух авторов соединяет andАлфавитный, без номеров; год после авторовЭкология, эволюция и многие организменные журналы

Quick Guide не закрепляет нумерованную метку как надстрочный знак или скобки. Это делают журналы и преподаватели. Университетская лаборатория, которая хочет надстрочный 1 после точки, всё ещё CSE citation–sequence; медицинская статья ICMJE, которая хочет (1), — это Vancouver, не CSE, даже когда конечная ссылка выглядит похоже.

Журнальные статьи: официальные примеры CSE 9

Журнальные шаблоны Quick Guide стоят в рамке выше. Названия журналов сокращают. При двух авторах конечная ссылка ставит запятую, а внутритекстовая метка name–year использует and. Внутритекстовое name–year et al в официальных примерах без точки. Эти строки — официальные примеры CSE 9, а не выдуманные статьи по клеточной биологии:

Официальные журнальные примеры CSE 9

Citation-sequence, три автора:

Haasnoot M, Lawrence J, Magnan AK. Pathways to coastal retreat. Science. 2021;372(6548):1287–1290. https://doi.org/10.1126/science.abi6594

Citation-sequence, больше 5 авторов:

Ashraf M et al. Interaction between the distribution of diabetic retinopathy lesions and the association of optical coherence tomography angiography scans with diabetic retinopathy severity. JAMA Ophthalmol. 2020;138(12):1291–1297. https://doi.org/10.1001/jamaophthalmol.2020.4516

Name-year, два автора:

Fauci AS, Lane HC. 2020. Four decades of HIV/AIDS—much accomplished, much to do. N Engl J Med. 383(1):1–4. https://doi.org/10.1056/NEJMp1916753

Name-year в тексте, два автора:

(Fauci and Lane 2020)

Name-year в тексте, три и более:

(Haasnoot et al 2021)

Порог авторов name-year (Quick Guide):

For articles with 3 to 5 authors, list all authors in the end reference; for articles with more than 5 authors, list the first author followed by “et al.” In either case, list only the first author followed by “et al” in the in-text reference.

Биологические журналы, отказавшиеся от постраничной нумерации выпуска в пользу номеров статей, используют ту же ячейку локации. Официальный образец Quick Guide — гидрология, а не поддельная статья eLife; eLife, PLOS Biology и PeerJ по-прежнему ставят номер статьи туда, куда CSE ставит location. Та же глава показывает том без выпуска и приложение:

Официальные CSE 9: номер статьи, без выпуска, приложение и пара одного года

Citation-sequence, номер статьи и без тома:

Liu L, Bai P, Liu C, Tian W, Liang K. Changes in extreme precipitation in the Mekong Basin. Adv Meteorol. 2020:8874869. https://doi.org/10.1155/2020/8874869

Name-year, номер статьи:

Liu L, Bai P, Liu C, Tian W, Liang K. 2020. Changes in extreme precipitation in the Mekong Basin. Adv Meteorol. 8874869. https://doi.org/10.1155/2020/8874869

Официальный citation-sequence, том и без выпуска:

Kim KY, Kim BS. The effect of regional warming on the East Asian summer monsoon. Clim Dyn. 2020;54:3259–3277. https://doi.org/10.1007/s00382-020-05169-7

Официальный citation-sequence, выпуск плюс приложение:

Yohannes AM, Kaplan A, Hanania NA. Anxiety and depression in chronic obstructive pulmonary disease: recognition and management. Cleve Clin J Med. 2018;85(2 Suppl 1):S11–S18. https://doi.org/10.3949/ccjm.85.s1.03

Name-year те же авторы, тот же год (официальный 2020a):

Lee SMC et al. 2020a. Arterial structure and function during and after long-duration spaceflight. J Appl Physiol. 129(1):108–123. https://doi.org/10.1152/japplphysiol.00550.2019

Name-year те же авторы, тот же год (официальный 2020b):

Lee SMC et al. 2020b. Efficacy of gradient compression garments in the hours after long-duration spaceflight. Front Physiol. 11:784. https://doi.org/10.3389/fphys.2020.00784

Name-year в тексте, обе работы:

(Lee et al 2020a, 2020b)

Обратите внимание на детали 9-го издания, которые студенты всё ещё путают. У инициалов нет точек и пробелов (Fauci AS, не Fauci, A. S.). Заголовок статьи — с заглавной только первой буквы. После URL DOI нет лишней точки. Работы одного года тех же авторов получают 2020a и 2020b. Номер статьи — не префикс eLocator APA; CSE пишет номер после двоеточия (нумерованные системы) или после названия журнала (name–year).

Настоящая генетическая статья, оформленная так же — это Watson and Crick (1953), а не образец CSE Quick Guide — в citation–sequence выглядит так:

Разобранное оформление CSE 9 настоящей статьи Nature

Watson JD, Crick FH. Molecular structure of nucleic acids: a structure for deoxyribose nucleic acid. Nature. 1953;171(4356):737–738. https://doi.org/10.1038/171737a0

Найти этот PDF в PubMed или Web of Science не делает PubMed источником. Цитируйте Nature. Ищите сокращение в ISSN LTWA или NLM Catalog; не изобретайте Nat. или J Cell Bio. Предпочитайте DOI. Если есть только PMID, найдите DOI, прежде чем оформлять ссылку.

Книги и главы: город издания исчез

Книжные ссылки CSE 9 убирают город, который раздатки 8-го издания всё ещё требуют. Эти строки — официальные примеры CSE 9, включая два биологических названия (Reiss и Ruse; Klarsfeld и Revah) и официальный перевод о митохондриальном биогенезе:

Официальные примеры книг и глав CSE 9

Name-year, два автора:

Reiss MJ, Ruse M. 2023. The new biology: a battle between mechanism and organicism. Harvard University Press.

Name-year в тексте:

(Reiss and Ruse 2023)

Citation-sequence, переводная книга:

Klarsfeld A, Revah F. The biology of death: origins of mortality. Brady L, translator. Cornell University Press; 2003.

Citation-sequence, переводчик и редактор (официальное митохондриальное название):

Luzikov VN. Mitochondrial biogenesis and breakdown. Galkin AV, translator; Roodyn DB, editor. Consultants Bureau; 1985.

Глава citation-sequence, другие авторы:

Geisslitz S, Scherf K. The holy grail of ancient cereals. In: Boukid F, editor. Cereal-based foodstuffs: the backbone of Mediterranean cuisine. Springer; 2021. p 269–301.

Глава citation-sequence, тот же автор:

Everard M. Ecosystem services: key issues. Routledge; 2017. Chapter 8, Regenerative landscapes: reversing the cycle; p 141–169.

Сетевая книга citation-sequence, больше 5 редакторов:

Agarwal A et al, editors. Oxford handbook of clinical surgery. 5th ed. Oxford University Press; 2022. https://doi.org/10.1093/med/9780198799481.001.0001

Современный учебник клеточной биологии с более чем пятью авторами поэтому начинается с первого имени плюс et al. и не нуждается в «New York». Alberts, Heald, Johnson, Morgan, Raff, Roberts и Walter — семь имён, поэтому CSE 9 обрезает:

Оформление CSE 9 настоящего учебника (7 авторов, поэтому et al.)

Alberts B et al. Molecular biology of the cell. 7th ed. W. W. Norton & Company; 2022.

Цитируйте главу только когда вы использовали эту главу, а не всю книгу. Официальный шаблон того же автора держит сначала заголовок книги, затем метку главы и страницы. Если у главы другие авторы, чем редакторы книги, используйте шаблон Quick Guide In: Editor, editor. (Geisslitz и Scherf выше). Не цитируйте имя файла PDF из университетского книжного магазина.

Устаревшая строка: Harrison 22 больше не “Forthcoming 2026”

Действующий Quick Guide по-прежнему печатает 22-е издание Harrison как forthcoming-книгу с датой 2026. McGraw Hill объявила о мировом выпуске 20 августа 2025; строка copyright печатного/электронного издания — 2025. Опубликованный список редакторов начинается с Longo, а не с Kasper. Сохраните официальную forthcoming-строку как шаблон CSE и цитируйте книгу, которую вы действительно открыли:

Официальная устаревшая forthcoming-строка против опубликованного 22-го издания

Официальная forthcoming-книга citation-sequence (Quick Guide, ещё жив):

Kasper D et al. Harrison’s principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill Professional. Forthcoming 2026.

Официальная forthcoming-книга name-year:

Kasper D et al. Forthcoming 2026. Harrison’s principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill Professional.

Официальное name-year в тексте:

(Kasper, forthcoming 2026)

Оформление CSE 9 опубликованного 22-го издания (Longo первым; 8 имён, поэтому et al.):

Longo DL et al, editors. Harrison's principles of internal medicine. 22nd ed. McGraw Hill; 2025.

Последовательности и базы данных: цитируйте accession.version, а не «GenBank»

Молекулярно-биологические статьи проваливают это чаще, чем пунктуацию журналов. Если вы использовали нуклеотидную или белковую запись, объект — эта запись. Обновление GenBank 2025 в Nucleic Acids Research (53(D1):D56–D61) на 9 октября 2026 всё ещё последний специализированный ежегодник GenBank; GenBank Release 273.0 (15 августа 2026) — выпуск данных, а не заменяющая цитатная статья. Обновление 2025 формулирует правило восстанавливаемости:

Sayers et al., обновление GenBank 2025, Nucleic Acids Research

the best way to cite a GenBank record in a publication is to use the full accession.version identifier for the record.

Оформление CSE 9 этой статьи NAR (7 авторов, поэтому et al.):

Sayers EW et al. GenBank 2025 update. Nucleic Acids Res. 2025;53(D1):D56–D61. https://doi.org/10.1093/nar/gkae1114

Их разобранный идентификатор — AF123456.2, а не AF123456. Поиск неверсионированной аксессии возвращает только текущую версию, которая могла измениться с тех пор, как вы её анализировали. Страница цитирования NCBI у NLM даёт шаблон записи базы данных (это формулировка NLM/Citing Medicine, а не строка CSE 9 Quick Guide). Та же страница теперь указывает и на статью о ресурсах NCBI 2026 для общей цитаты базы:

NLM, How do I cite NCBI services and databases?

Nucleotide [Internet]. Bethesda (MD): National Library of Medicine (US), National Center for Biotechnology Information; [1988] – . Accession No. NM_001349333.1, Homo sapiens FYN binding protein (FYB), transcript variant 4, mRNA; [cited YYYY Mmm DD]. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001349333.1

Оформление CSE 9 статьи о ресурсах NCBI 2026 (NAR 54(D1):D20–D27):

Sayers EW et al. Database resources of the National Center for Biotechnology Information in 2026. Nucleic Acids Res. 2025;54(D1):D20–D27. https://doi.org/10.1093/nar/gkaf1060

Замените аксессию, описание продукта и дату цитирования версией, которую вы получили. Не цитируйте «NCBI» или «GenBank» без аксессии, когда утверждение зависит от последовательности. Если в вашей статье GenBank использовался как база данных, а не как одна запись, цитируйте текущее обновление GenBank в Nucleic Acids Research (всё ещё статья 2025, пока не появится обновление GenBank 2026), а не выдумывайте ссылку на домашнюю страницу. Protein Data Bank, UniProt и GBIF работают так же: назовите ID записи, который позднее сможет открыть читатель. Страница NLM также велит цитировать BLAST по списку ссылок BLAST, а не по снимку экрана поисковой строки.

Программы и методические статьи: цитируйте алгоритм, который вы запускали

Абзац Methods, который говорит «последовательности искали BLAST», без ссылки неполон. Справка BLAST NCBI перечисляет статьи, которые нужно цитировать. Статья об алгоритме 1990 года имеет пять авторов, поэтому CSE 9 перечисляет всех пятерых. Статья о gapped-BLAST 1997 года имеет семь, поэтому CSE 9 оставляет только Altschul плюс et al. Студенты, запускающие текущий веб-сервис или двоичный файл blastn, обычно запускают BLAST+, архитектурная статья которого — Camacho et al., семь авторов, поэтому CSE 9 обрезает. Справочная страница NCBI всё ещё печатает эту статью как 2008; статья BMC — том 10, статья 421 (15 декабря 2009). ElasticBLAST (2023) имеет пять авторов, поэтому CSE 9 перечисляет всех пятерых. Эти строки — оформление CSE 9 рекомендованных NCBI цитат, а не образцы Quick Guide:

Оформление CSE 9 методических статей NCBI BLAST и ImageJ

BLAST 1990 (5 авторов, поэтому перечислите всех):

Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990;215(3):403–410. https://doi.org/10.1016/S0022-2836(05)80360-2

Gapped BLAST / PSI-BLAST 1997 (больше 5 авторов):

Altschul SF et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res. 1997;25(17):3389–3402. https://doi.org/10.1093/nar/25.17.3389

BLAST+ (год 2008 в списке NCBI; BMC 2009; 7 авторов, поэтому et al.):

Camacho C et al. BLAST+: architecture and applications. BMC Bioinformatics. 2009;10:421. https://doi.org/10.1186/1471-2105-10-421

ElasticBLAST (5 авторов, поэтому перечислите всех):

Camacho C, Boratyn GM, Joukov V, Vera Alvarez R, Madden TL. ElasticBLAST: accelerating sequence search via cloud computing. BMC Bioinformatics. 2023;24(1):117. https://doi.org/10.1186/s12859-023-05245-9

ImageJ (Nature Methods; 3 автора):

Schneider CA, Rasband WS, Eliceiri KW. NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis. Nat Methods. 2012;9(7):671–675. https://doi.org/10.1038/nmeth.2089

Fiji, если вы запускали именно этот вариант (страница цитирования ImageJ, doi:10.1038/nmeth.2019):

Schindelin J et al. Fiji: an open-source platform for biological-image analysis. Nat Methods. 2012;9(7):676–682. https://doi.org/10.1038/nmeth.2019

Страница цитирования ImageJ прямолинейна: цитируйте ImageJ (doi:10.1038/nmeth.2089) для исходной программы, Fiji (doi:10.1038/nmeth.2019), если вы использовали Fiji, и ImageJ2 (doi:10.1186/s12859-017-1934-z), если вы использовали ImageJ2. Цитируйте версию, которую вы запускали. Если посадочная страница проекта называет предпочтительную цитату (ImageJ, R, QIIME 2, FlyBase), используйте эту статью или эту ссылку на программу. Не выдумывайте дату выпуска, которую вы никогда не записывали, и не цитируйте «NCBI BLAST» так, будто это журнальная статья без авторов.

Препринты, диссертации и статьи ahead-of-print

CSE 9 добавил раздел о препринтах. Отметьте статус в квадратных скобках и сохраните имя сервера. Когда появляется рецензированная версия, цитируйте журнальную статью и уберите препринт, если вы не обсуждаете саму запись препринта. Официальный образец Quick Guide — Lopez Bernal et al. на medRxiv. Эта статья уже не только препринт: она вышла как Lopez Bernal et al., *N Engl J Med* 2021;385(7):585–594. Сохраните официальную строку препринта как шаблон CSE; цитируйте версию NEJM, если вы читали именно её.

Официальный препринт CSE 9, устаревшая опубликованная версия, диссертация и ahead of print

Официальный препринт citation-sequence:

Lopez Bernal J et al. Effectiveness of COVID-19 vaccines against the B.1.617.2 variant [preprint]. medRxiv 2021. https://doi.org/10.1101/2021.05.22.21257658

Официальный препринт name-year:

Lopez Bernal J et al. 2021. Effectiveness of COVID-19 vaccines against the B.1.617.2 variant [preprint]. medRxiv. https://doi.org/10.1101/2021.05.22.21257658

Оформление CSE 9 позднейшей статьи NEJM (цитируйте её, если читали журнал):

Lopez Bernal J et al. Effectiveness of Covid-19 vaccines against the B.1.617.2 (Delta) variant. N Engl J Med. 2021;385(7):585–594. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2108891

Официальная диссертация citation-sequence:

Liang S. Transport properties of topological semimetals and non-symmorphic topological insulator [dissertation]. Princeton University; 2020. https://arks.princeton.edu/ark:/88435/dsp01vm40xv52n

Официальный ahead of print citation-sequence:

Corrigan TJ Jr, Businger S. The anatomy of a series of cloud bursts that eclipsed the US rainfall record. Mon Wea Rev. [published online ahead of print 2021 Dec 30]. https://doi.org/10.1175/MWR-D-21-0028.1

Сайты: устаревший URL CDC и date unknown только в name–year

Сайтам по-прежнему нужна дата публикации или обновления, когда она есть. Две системы CSE формулируют правило отсутствующей даты не одинаково. Citation–sequence просит только дату доступа; name–year добавляет выражение «date unknown». Официальный образец датированного сайта по-прежнему страница CDC о справедливости в здравоохранении. Открытый 9 октября 2026, этот точный URL вернул 404. Архивы CDC и archive.cdc.gov хранят более ранние снимки; не вставляйте устаревший путь 2019-ncov в работу 2026 года так, будто он жив. Скопируйте официальную пунктуацию CSE, затем замените URL страницей, которую вы действительно получили.

CSE Citation Quick Guide, сайты

Вкладка citation-sequence / citation-name:

If no date of publication or update is available, include an access date.

Вкладка name-year:

If no date of publication is available, use “date unknown” and include an access date.

Официальный датированный сайт citation-sequence (CDC; устаревший URL теперь 404):

Health equity considerations and racial and ethnic minority groups. US Centers for Disease Control and Prevention, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Division of Viral Diseases; 2020 Apr 30 [updated 2022 Jan 25]. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/health-equity/race-ethnicity.html

Официальный датированный сайт name-year:

Health equity considerations and racial and ethnic minority groups. 2020 Apr 30. US Centers for Disease Control and Prevention, National Center for Immunization and Respiratory Diseases, Division of Viral Diseases; [updated 2022 Jan 25]. https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/community/health-equity/race-ethnicity.html

Официальное name-year в тексте для этой страницы:

(Health equity . . . 2020)

Официальная недатированная карта name-year:

Montrose Point Bird Sanctuary, Chicago, Illinois. [date unknown]. Google Maps; [accessed 2022 Jan 3]. https://goo.gl/maps/GJALYGBXFZ8TSGK5A

Официальное name-year в тексте:

(Montrose Point . . . [date unknown])

Неопубликованные данные остаются в предложении, а не в списке литературы

Лабораторные группы всё ещё пытаются вносить «unpublished data» и коридорные разговоры как нумерованные ссылки. CSE 9 держит их вне конечного списка:

CSE Citation Quick Guide, личное сообщение

References to personal communications are placed in running text rather than as formal end references. Permission is usually required and should be acknowledged in an “Acknowledgments” or “Notes” section at the end of the document.
. . . local and systemic reactions were expected to be stronger after the second dose (2022 letter from TD Perez to author; unreferenced, see “Notes”) . . .
Not all forthcoming or unpublished sources are suitable for inclusion in reference lists. Check with your publisher if in doubt.

Пишите (A. Johnson, unpublished data, 2026) в предложении, если преподаватель это разрешает. Не выдумывайте нумерованную конечную ссылку для страницы лабораторного журнала, которую никто другой не сможет получить. Если данные позже появятся в статье, диссертации или записи GenBank, цитируйте этот восстанавливаемый объект.

Таксономические имена — это проза, а не тайная четвёртая система цитирования

В связном тексте биномен пишут курсивом: Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Homo sapiens. После первого упоминания многие биологические журналы принимают сокращённый род (D. melanogaster). Описывающий авторитет — Meigen, 1830 для этой дрозофилы — это таксономическая номенклатура. Это не конечная ссылка CSE, если вы не читали и не цитируете исходную работу с описанием. Не превращайте Meigen, 1830 в фальшивую журнальную статью и не пишите авторитет курсивом.

Символы генов и белков следуют номенклатурному органу организма (HGNC для человеческих генов, FlyBase, SGD и так далее), а не главе 29 CSE. CSE говорит, как цитировать статью или запись базы данных; стиль символа приходит из области.

CSE, APA, Vancouver или внутренний стиль журнала?

Университетская биология — не один стиль. Страница области стили цитирования для биологии — обзор; эта таблица — решение, которое вы принимаете для одного задания:

Соотнесите площадку. Не переносите скобки APA в нумерованный список CSE.
Если документ говорит…ИспользуйтеНе используйте
CSE, CBE, Scientific Style and Format или Council of Science EditorsCSE (одна из трёх систем)Пунктуацию автор–дата APA или (1) Vancouver так, будто это CSE
APA, психологические методы или журнал биологического образования, который называет APAAPACSE name–year. Они выглядят родственными и это не один и тот же список
ICMJE, Uniform Requirements, NLM или VancouverVancouver или руководство по медицинскому цитированиюПорог et al. CSE 9 в 5 авторов или скобки name–year
Авторские указания Nature, Cell, Science или PLOSВнутренний стиль этого журналаОбщий «биологический стиль», который вы изобрели с этой страницы

Science и PNAS — журналы, которые CSE 9 приводит как модели нового порога по авторам; их собственные Instructions for Authors по-прежнему управляют рукописями, поданными туда. Статья PLOS ONE использует нумерованный стиль PLOS, похожий на Vancouver, а не список CSE name–year. Когда программа курса молчит, спросите. Затем зафиксируйте одну систему до оформления первой ссылки.

Ошибки, в которые биологи действительно попадают

  • Смешение систем. Номер 7 в тексте не может указывать на алфавитный список name–year. Выберите одну систему и используйте её в каждой подписи к рисунку.
  • Использование порога 8-го издания в 10 авторов. CSE 9 перечисляет не больше 5 имён, затем первый автор + et al. Ссылка на Molecular Biology of the Cell с 7 авторами — Alberts B et al., а не семь фамилий. Устаревшая строка Pizzi на 10 авторов всё ещё живёт в Quick Guide 8-го издания.
  • Изобретение сокращений журналов. J. Cell. Biol. с лишними точками — не сокращение CSE. Используйте ISSN LTWA или NLM Catalog.
  • Цитирование базы, в которой нашли PDF. PubMed, JSTOR и кампусный прокси — пути поиска. Источник — журнальная статья.
  • Оставление города у каждой книги. CSE 9 убрал место издания. New York: W. W. Norton & Company; 2022 — старый шаблон.
  • Проставление даты доступа на каждый DOI. Даты доступа остаются только когда нельзя установить дату публикации, авторского права или пересмотра.
  • Копирование устаревшего URL 2019-ncov CDC. Официальный пример сайта CSE всё ещё печатает этот путь; открытый 9 октября 2026 он вернул 404. Цитируйте страницу, которую вы действительно открыли.
  • Копирование “Forthcoming 2026” для Harrison 22. McGraw Hill выпустила 22-е издание в 2025 году, первым указан Longo.
  • Цитирование строки medRxiv Lopez Bernal после чтения NEJM. Препринт Quick Guide — шаблон. Журнальная статья — N Engl J Med. 2021;385(7):585–594.
  • Забывание, что сайты name–year говорят date unknown. Вкладка citation–sequence просит только дату доступа. Вкладка name–year добавляет [date unknown].
  • Обращение с номером статьи как с eLocator APA. Официальный CSE пишет Adv Meteorol. 2020:8874869 (нумерованный) или Adv Meteorol. 8874869 (name–year).
  • Утверждение о последовательности без accession.version. AF123456 недостаточно; AF123456.2 — цитируемый объект. GenBank Release 273.0 — выгрузка, а не цитата.
  • Цитирование BLAST 1990 для поиска BLAST+. Текущий справочный список NCBI включает Camacho BLAST+ (BMC Bioinformatics 10:421) и ElasticBLAST 2023.
  • Цитирование ImageJ, когда вы запускали Fiji. Страница цитирования ImageJ хочет Schneider 2012 для ImageJ и Schindelin 2012 для Fiji.
  • Помещение неопубликованных данных в нумерованный список. Личные сообщения и результаты из лабораторного журнала остаются в предложении.
  • Оформление биномена так, будто это ссылка. D. melanogaster — проза. Статья, которую вы прочитали об этой мухе, — цитата.
  • Цитировать обзор ради конкретного экспериментального результата. Используйте исходную методическую или результативную статью, когда утверждение касается именно этого эксперимента.
  • Опускать программы, пакеты или опубликованные протоколы. Цитируйте версию, которую вы запускали, по рекомендованному цитированию проекта или по методической статье. Не выдумывайте выпуск, которым не пользовались.

Оформите запись, которую вы действительно захватили

Генератор может применить пунктуацию CSE только к метаданным, которые вы сохранили. Он не может выдумать номер выпуска, сокращение ISSN или версию последовательности. Сначала зафиксируйте внутритекстовую систему, затем оформляйте по полной записи — DOI, PMID или полям вручную — в генераторе цитат CSE.

Создайте цитаты CSE для биологических статей

Последовательно используйте citation–sequence, citation–name или name–year. Ищите по DOI или PubMed ID либо введите источник, который вы действительно открыли. Генератор не выдумает суффикс версии GenBank, который вы никогда не записали.

Вопросы о цитировании биологии в CSE

CSE — это то же самое, что CBE?
Да, исторически. Council of Biology Editors стал Council of Science Editors. Университетские раздатки всё ещё говорят CBE. Действующая книга — The CSE Manual, 9-е издание (2024). Не следуйте ксерокопии CBE 6-го издания — и не устаревшему Quick Guide 8-го издания, который всё ещё перечисляет первых 10 авторов, — для порогов авторов, городов или дат доступа.
Какую систему CSE должен использовать лабораторный отчёт по биологии?
Ту, которую назвал преподаватель. Если лист говорит «нумерованный CSE», это citation–sequence, если он также не велит сначала алфавитировать список (citation–name). Курсы экологии и организменной биологии часто хотят name–year. Не угадывайте по понравившейся методической статье.
Сколько авторов CSE 9 перечисляет до et al.?
Пять. Работа с 6 или более авторами в конечной ссылке перечисляет первого автора плюс et al. Внутритекстовые цитаты name-year уже используют первого автора плюс et al для 3 или более авторов. Правило 8-го издания «первые 10» снято; строка Pizzi Anticancer Res. в старом Quick Guide — устаревший остаток.
Нужно ли в CSE писать названия журналов курсивом?
Нет. Конечные ссылки CSE ставят названия журналов прямым шрифтом и сокращают их. Курсив принадлежит биноменам в связном тексте (Homo sapiens) и нескольким особым случаям заголовков, а не J Cell Biol в списке литературы.
Как цитировать последовательность GenBank или RefSeq в CSE?
Поставьте полный accession.version в работе (AF123456.2, NM_001349333.1). Для формальной конечной ссылки следуйте шаблону записи базы Nucleotide у NLM: база, организация, аксессия, описание продукта, дата цитирования и URL. Не цитируйте «GenBank» без идентификатора и не цитируйте Release 273.0 так, будто это последовательность.
Как цитировать BLAST или ImageJ в CSE?
Цитируйте методическую статью, которую называет NCBI или проект. BLAST 1990 имеет пять авторов, поэтому CSE 9 перечисляет Altschul, Gish, Miller, Myers и Lipman. Текущий веб-BLAST — это BLAST+; цитируйте Camacho et al., BMC Bioinformatics 2009;10:421. ImageJ — Schneider, Rasband и Eliceiri, Nat Methods 2012. Если вы запускали Fiji, цитируйте вместо этого Schindelin 2012. Не цитируйте вкладку браузера.
Как цитировать статью eLife или PLOS, у которой номер вместо страниц?
Поставьте номер статьи в слот локации CSE. Официальный образец Quick Guide — Liu et al., Adv Meteorol. 2020:8874869 (citation-sequence) или Adv Meteorol. 8874869 (name-year). Не переносите префикс Article eLocator из APA.
Цитировать bioRxiv или опубликованную статью?
Цитируйте версию, которой вы пользовались. Если статья уже в журнале, цитируйте журнал и DOI. Оставляйте препринт только когда обсуждаете именно этот препринт. Официальный пример CSE 9 — Lopez Bernal et al. на medRxiv, с пометкой [preprint]; эта статья позже вышла как N Engl J Med. 2021;385(7):585–594.
Name-year CSE — это то же самое, что APA 7?
Нет. Оба ставят имя и год в предложение. APA использует запятые, амперсанды, заголовки статей с заглавной только первой буквы, курсивными журналом и томом и порог в 20 авторов. CSE name-year использует (Fauci and Lane 2020), сокращённые прямые названия журналов, год сразу после авторов в списке и порог в 5 авторов. См. APA и CSE.
Нужен ли в CSE всё ещё город для Norton или Springer?
Не в 9-м издании. Заметка Олсона в Science Editor и Quick Guide оба убирают место издания, потому что у издателей несколько адресов и работу можно найти без города. Строка 8-го издания «New York (NY):» устарела для работы CSE 2026 года.

Связанные руководства