Руководство по цитированию в биологии: стиль CBE/CSE
Биологические исследования требуют систематического документирования научной литературы — от полевых исследований и лабораторных экспериментов до молекулярной биологии и экологии. Это руководство охватывает стиль цитирования CSE (Council of Science Editors), ранее известный как CBE, — стандарт для биологии и наук о жизни.
Почему ссылки важны в биологии
В биологических науках ссылки создают эмпирическую основу для ваших наблюдений, гипотез и выводов. Цитируя исследование экспрессии генов, динамики экосистем или клеточных механизмов, вы связываете свою работу с накопленными знаниями, определяющими наше понимание жизни.
Биология — по сути кумулятивная наука, где открытия строятся на предыдущих исследованиях. Ссылки позволяют проверять утверждения, дают возможность воспроизвести эксперименты и прослеживают эволюцию биологических концепций — от естественного отбора Дарвина до редактирования генов с помощью CRISPR.
Правильное цитирование в биологии также демонстрирует научную добросовестность, отдаёт должное вкладу коллег-исследователей и поддерживает воспроизводимость, необходимую для научного метода. В области, где данные должны выдерживать строгое рецензирование, точность ссылок отражает качество исследования.
Стиль CSE: три системы цитирования
Стиль Council of Science Editors (CSE) предлагает три отдельные системы цитирования, каждая из которых подходит для разных биологических субдисциплин. Студентам-биологам следует разбираться во всех трёх и использовать систему, предпочитаемую их преподавателем или целевым журналом.
Система «цитата-последовательность»
Наиболее распространена в биологии. Ссылки нумеруются в порядке их первого появления в тексте. Тот же номер используется для последующих ссылок на этот источник.
Внутритекстовая ссылка:
Studies have shown1,2 that mitochondrial function...
Список литературы:
1. Smith JA, Chen L. Mitochondrial dynamics in aging cells. J Cell Biol. 2023;218(4):567-582.
Система «цитата-имя»
Ссылки перечисляются в алфавитном порядке, а затем нумеруются. Ссылки в тексте используют эти номера на протяжении всей работы.
Система «имя-год»
Похожа на стиль APA. Автор и год указываются в скобках. Список литературы в алфавитном порядке.
Внутритекстовая ссылка:
(Smith and Chen 2023) or Smith and Chen (2023) observed...
Распространённые типы источников в биологических исследованиях
1. Журнальные статьи
Рецензируемые журналы, такие как Cell, Nature, Science, и специализированные биологические журналы публикуют результаты первичных исследований.
Формат «цитата-последовательность»:
1. Watson JD, Crick FH. Molecular structure of nucleic acids: a structure for deoxyribose nucleic acid. Nature. 1953;171(4356):737-738.
Формат «имя-год»:
Watson JD, Crick FH. 1953. Molecular structure of nucleic acids: a structure for deoxyribose nucleic acid. Nature. 171(4356):737-738.
2. Книги и учебники
Учебники по биологии и справочные издания дают фундаментальные знания в генетике, экологии, физиологии и других субдисциплинах.
«Цитата-последовательность»:
2. Alberts B, Johnson A, Lewis J, Morgan D, Raff M, Roberts K, Walter P. Molecular biology of the cell. 7th ed. New York: W.W. Norton & Company; 2022. 1464 p.
3. Последовательности из баз данных
GenBank, базы данных белков и геномные репозитории — важные ресурсы в молекулярной биологии, требующие особых форматов цитирования.
3. GenBank [Internet]. Bethesda (MD): National Center for Biotechnology Information; [date unknown]-. Accession No. NM_000546, Homo sapiens tumor protein p53 (TP53), mRNA; [cited 2026 Jan 5]. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_000546
4. Полевые определители и идентификация видов
Таксономические ключи, полевые определители и ресурсы для идентификации имеют фундаментальное значение для экологии и систематической биологии.
4. Sibley DA. The Sibley guide to birds. 2nd ed. New York: Alfred A. Knopf; 2014. 598 p.
5. Тезисы и материалы конференций
Научные конференции представляют новые исследования до их публикации в журналах.
5. Martinez KL, Johnson RS. Novel approaches to coral reef restoration. In: Proceedings of the International Coral Reef Symposium; 2023 Jul 3-8; Bremen, Germany. p. 234-245.
6. Отчёты государственных органов и ведомств
EPA, NOAA, USGS и другие ведомства публикуют исследовательские отчёты, сводки данных и экологические оценки.
6. [EPA] Environmental Protection Agency (US). National water quality inventory: report to Congress. Washington (DC): EPA; 2023. Report No.: EPA-841-R-23-001.
Примеры из биологических исследований
Классическая статья по генетике
7. Mendel G. Experiments in plant hybridization. Proceedings of the Natural History Society of Brünn. 1866;4:3-47.
Исследование по молекулярной биологии
8. Doudna JA, Charpentier E. The new frontier of genome engineering with CRISPR-Cas9. Science. 2014;346(6213):1258096.
Полевое исследование в экологии
9. Paine RT. Food web complexity and species diversity. Am Nat. 1966;100(910):65-75.
Биология сохранения
10. Wilson EO. Half-earth: our planet's fight for life. New York: Liveright Publishing Corporation; 2016. 272 p.
Специфичные для области сложности цитирования
1. Таксономические авторитеты
При первом упоминании вида указывайте научное название вместе с таксономическим авторитетом, который его описал.
Drosophila melanogaster (Meigen, 1830) or Escherichia coli (Migula 1895)
2. Неопубликованные данные и личные сообщения
Цитируйте предварительные данные или личные сообщения в тексте, но не в списке литературы.
(A. Johnson, unpublished data) or (B. Smith, personal communication)
3. Указано в PubMed или в других базах данных
Когда статьи доступны через базы данных, как правило, цитируется оригинальная публикация в журнале, а не сама база данных.
4. Статьи с большим числом соавторов
В крупных биологических коллаборациях может быть более 20 авторов. Стиль CSE перечисляет всех авторов или использует «et al.» после первых 10 авторов.
5. Препринты и bioRxiv
В биологии всё чаще используются серверы препринтов. Чётко указывайте статус препринта и обновляйте ссылки, когда публикуются рецензируемые версии.
11. Chen L, Martinez R. Novel mechanisms of protein folding. bioRxiv. 2023. doi:10.1101/2023.12.01.567890. Preprint.
Советы для студентов-биологов
1. Выберите правильную систему CSE
Уточните, какую систему CSE требует ваш преподаватель или целевой журнал. «Цитата-последовательность» наиболее распространена, но в молекулярной биологии часто используется «имя-год».
2. Используйте сокращённые названия журналов
Стиль CSE использует стандартные сокращения журналов. Проверьте официальное сокращение журнала или используйте базы данных, такие как Web of Science, для стандартизированных форм.
3. Указывайте даты доступа для онлайн-источников
Для баз данных, веб-сайтов и источников, доступных только онлайн, указывайте дату, когда вы получили доступ к материалу.
4. Цитируйте статьи с описанием методов
При использовании установленных протоколов или методик цитируйте оригинальную статью о методологии или опубликованный протокол.
5. Документируйте статистическое программное обеспечение
Цитируйте пакеты R, статистическое программное обеспечение и биоинформатические инструменты, использованные в вашем анализе.
12. R Core Team. R: a language and environment for statistical computing [Internet]. Vienna (Austria): R Foundation for Statistical Computing; 2023. Available from: https://www.R-project.org/
6. Ведите лабораторные журналы с полными ссылками
Записывайте полную информацию о ссылках во время обзоров литературы и экспериментов. Это избавит от долгих поисков позже.
7. По возможности цитируйте первичные исследования
Хотя обзорные статьи дают отличный общий обзор, при конкретных утверждениях об экспериментальных результатах цитируйте оригинальные исследовательские работы.
Рекомендуемые инструменты и ресурсы
Официальные ресурсы CSE
- Scientific Style and Format: The CSE Manual (8-е издание): исчерпывающее руководство по цитированию CSE и научному письму
- Сайт Council of Science Editors: обновления и разъяснения по практикам цитирования
Управление ссылками для биологов
- Zotero: отлично подходит для управления разнообразными биологическими источниками с надёжной интеграцией с PubMed
- Mendeley: популярен среди биологов благодаря аннотированию PDF и исследовательской сети
- Papers: приложение для Mac/iOS, любимое многими биологами-исследователями
- EndNote: комплексный инструмент с надёжным форматированием CSE
Базы данных биологических исследований
- PubMed: важнейшая база данных биомедицинской литературы и наук о жизни
- Web of Science: отслеживание цитирования и показатели влияния
- Google Scholar: широкий охват с оповещениями о цитировании
- BioOne: биологические журналы с полными текстами
- JSTOR: историческая и экологическая литература
Специализированные биологические базы данных
- GenBank (NCBI): база данных генетических последовательностей
- Protein Data Bank (PDB): трёхмерные структурные данные
- Global Biodiversity Information Facility (GBIF): данные о встречаемости видов
- TreeBASE: филогенетические данные
- FishBase / SeaLifeBase: информация о видах
Поддержка письма и исследований
- Purdue OWL CSE Guide: ясные объяснения с примерами
- Nature Scitable: бесплатные образовательные ресурсы по научному письму
- Writing in the Biological Sciences Анжелики Х. Хофманн: практическое руководство по биологическому письму
Частые ошибки, которых стоит избегать
- Смешение систем CSE: используйте одну систему последовательно на протяжении всей работы
- Неверный формат имени автора: CSE использует фамилию с инициалами без точек и пробелов: Smith JA, а не Smith, J.A.
- Отсутствие номеров тома/выпуска: указывайте оба для журнальных статей
- Неправильное оформление видовых названий: выделяйте род и вид курсивом: Homo sapiens
- Забытые даты доступа: указывайте их для онлайн-баз данных и изменяющегося содержимого
- Неполные ссылки на базы данных: указывайте номера доступа и информацию о репозитории
- Цитирование обзорных статей вместо первичных исследований: по возможности прослеживайте утверждения до оригинальных исследований
Особые случаи цитирования в биологии
Неопубликованная диссертация
13. Johnson KL. Evolutionary mechanisms in adaptive radiation [dissertation]. [Berkeley (CA)]: University of California, Berkeley; 2023. 234 p.
Изображение или рисунок из другого источника
14. Miller AB, Chen CD. Cell division mechanisms. Nature. 2023;612:456-462. Figure 3, Cell cycle phases; p. 459.
Лабораторное руководство
15. Current protocols in molecular biology [Internet]. Hoboken (NJ): John Wiley & Sons; c2023 [cited 2026 Jan 5]. Available from: https://currentprotocols.onlinelibrary.wiley.com/
Патент в области биотехнологий
16. Smith JA, Johnson KL, inventors; Genetics Corp, assignee. CRISPR-based gene editing method. United States patent US 11,234,567. 2023 Jan 24.
Создавайте ссылки CSE для работ по биологии
Создавайте точные ссылки в стиле CSE для ваших исследовательских работ по биологии и лабораторных отчётов. Поддерживает форматы «цитата-последовательность», «цитата-имя» и «имя-год». Ищите по DOI, PubMed ID или вводите данные источника вручную.